IRF9

IRF9
Ідентифікатори
Символи	IRF9, IRF-9, ISGF3, ISGF3G, p48, interferon regulatory factor 9
Зовнішні ІД	OMIM: 147574 MGI: 107587 HomoloGene: 4436 GeneCards: IRF9
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding Клітинна компонента • клітинне ядро • нуклеоплазма • цитоплазма • гіалоплазма Біологічний процес • cell surface receptor signaling pathway • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription by RNA polymerase II • defense response to virus • type I interferon signaling pathway • transcription, DNA-templated • interferon-gamma-mediated signaling pathway • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • процес імунної системи Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10379	16391
Ensembl	ENSG00000213928 ENSG00000285048	ENSMUSG00000002325
UniProt	Q00978	Q61179
RefSeq (мРНК)	NM_006084 NM_001385400 NM_001385401 NM_001385402	NM_001159417 NM_001159418 NM_008394
RefSeq (білок)	NP_006075	NP_001152889 NP_001152890 NP_032420
Локус (UCSC)	Хр. 14: 24.16 – 24.17 Mb	Хр. 14: 55.84 – 55.85 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

IRF9 (англ. Interferon regulatory factor 9) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 393 амінокислот, а молекулярна маса — 43 696.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MASGRARCTR		KLRNWVVEQV		ESGQFPGVCW		DDTAKTMFRI		PWKHAGKQDF
REDQDAAFFK		AWAIFKGKYK		EGDTGGPAVW		KTRLRCALNK		SSEFKEVPER
GRMDVAEPYK		VYQLLPPGIV		SGQPGTQKVP		SKRQHSSVSS		ERKEEEDAMQ
NCTLSPSVLQ		DSLNNEEEGA		SGGAVHSDIG		SSSSSSSPEP		QEVTDTTEAP
FQGDQRSLEF		LLPPEPDYSL		LLTFIYNGRV		VGEAQVQSLD		CRLVAEPSGS
ESSMEQVLFP		KPGPLEPTQR		LLSQLERGIL		VASNPRGLFV		QRLCPIPISW
NAPQAPPGPG		PHLLPSNECV		ELFRTAYFCR		DLVRYFQGLG		PPPKFQVTLN
FWEESHGSSH		TPQNLITVKM		EQAFARYLLE		QTPEQQAAIL		SLV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, противірусний захист. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Reich N.C. (2002). Nuclear/cytoplasmic localization of IRFs in response to viral infection or interferon stimulation. J. Interferon Cytokine Res. 22: 103—109. PMID 11846981 DOI:10.1089/107999002753452719
• Cebulla C.M., Miller D.M., Sedmak D.D. (1999). Viral inhibition of interferon signal transduction. Intervirology. 42: 325—330. PMID 10702714 DOI:10.1159/000053968

Див. також

• Хромосома 14