ISL1

ISL1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2RGT, 4JCJ
Ідентифікатори
Символи	ISL1, ISLET1, Isl-1, ISL LIM homeobox 1
Зовнішні ІД	OMIM: 600366 MGI: 101791 HomoloGene: 1661 GeneCards: ISL1
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • GO:0001105 transcription coactivator activity • sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • chromatin binding • зв'язування з іоном металу • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • bHLH transcription factor binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nuclear receptor binding • GO:0001158 cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • estrogen receptor binding • promoter-specific chromatin binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • цитоплазма • Нуклеоплазма • клітинне ядро Біологічний процес • GO:1904089 negative regulation of neuron apoptotic process • peripheral nervous system neuron development • positive regulation of interleukin-1 alpha production • pituitary gland development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • negative regulation of neuron differentiation • positive regulation of interleukin-12 production • axon regeneration • spinal cord motor neuron cell fate specification • trigeminal nerve development • neuron fate specification • outflow tract morphogenesis • positive regulation of interferon-gamma production • positive regulation of granulocyte colony-stimulating factor production • heart morphogenesis • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • positive regulation of angiogenesis • positive regulation of histone acetylation • outflow tract septum morphogenesis • endocardial cushion morphogenesis • ventricular cardiac muscle tissue morphogenesis • atrial septum morphogenesis • multicellular organism development • cardiac cell fate determination • regulation of secondary heart field cardioblast proliferation • cardiac muscle cell myoblast differentiation • cellular response to glucocorticoid stimulus • visceral motor neuron differentiation • mesenchymal cell differentiation • positive regulation of granulocyte macrophage colony-stimulating factor production • neural crest cell migration • neuron differentiation • positive regulation of cell population proliferation • positive regulation of interleukin-1 beta production • positive regulation of interleukin-6 production • positive regulation of tumor necrosis factor production • регуляція експресії генів • pancreas development • positive regulation of macrophage colony-stimulating factor production • positive regulation of vascular endothelial growth factor production • negative regulation of protein homodimerization activity • positive regulation of DNA binding • peripheral nervous system neuron axonogenesis • spinal cord motor neuron differentiation • neuron fate commitment • secondary heart field specification • іннервація • negative regulation of intracellular estrogen receptor signaling pathway • negative regulation of inflammatory response • cardiac right ventricle morphogenesis • negative regulation of canonical Wnt signaling pathway • positive regulation of insulin secretion • sensory system development • pharyngeal system development • retinal ganglion cell axon guidance • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • positive regulation of cell differentiation • transcription, DNA-templated • диференціація клітин • positive regulation of tyrosine phosphorylation of STAT protein • positive regulation of epithelial to mesenchymal transition • negative regulation of epithelial cell proliferation • heart development • аксоноґенеза Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	3670	16392
Ensembl	ENSG00000016082	ENSMUSG00000042258
UniProt	P61371	P61372
RefSeq (мРНК)	NM_002202	NM_021459
RefSeq (білок)	NP_002193	NP_067434
Локус (UCSC)	Хр. 5: 51.38 – 51.39 Mb	Хр. 13: 116.43 – 116.45 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

ISL1 (англ. ISL LIM homeobox 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 349 амінокислот, а молекулярна маса — 39 036.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGDMGDPPKK		KRLISLCVGC		GNQIHDQYIL		RVSPDLEWHA		ACLKCAECNQ
YLDESCTCFV		RDGKTYCKRD		YIRLYGIKCA		KCSIGFSKND		FVMRARSKVY
HIECFRCVAC		SRQLIPGDEF		ALREDGLFCR		ADHDVVERAS		LGAGDPLSPL
HPARPLQMAA		EPISARQPAL		RPHVHKQPEK		TTRVRTVLNE		KQLHTLRTCY
AANPRPDALM		KEQLVEMTGL		SPRVIRVWFQ		NKRCKDKKRS		IMMKQLQQQQ
PNDKTNIQGM		TGTPMVAASP		ERHDGGLQAN		PVEVQSYQPP		WKVLSDFALQ
SDIDQPAFQQ		LVNFSEGGPG		SNSTGSEVAS		MSSQLPDTPN		SMVASPIEA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, диференціація. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Wang M., Drucker D.J. (1994). The LIM domain homeobox gene isl-1: conservation of human, hamster, and rat complementary deoxyribonucleic acid sequences and expression in cell types of nonneuroendocrine lineage. Endocrinology. 134: 1416—1422. PMID 7907017 DOI:10.1210/endo.134.3.7907017
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 5