ISY1

ISY1
Наявні структури PDB Пошук для людей: PDBe RCSB Список кодів PDB 1X4T
Ідентифікатори
Символи	ISY1, FSAP33, ISY1 splicing factor homolog
Зовнішні ІД	OMIM: 612764 HomoloGene: 130408 GeneCards: ISY1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • first spliceosomal transesterification activity • RNA binding Клітинна компонента • клітинне ядро • post-spliceosomal complex • catalytic step 2 spliceosome • spliceosomal complex • Prp19 complex • catalytic step 1 spliceosome • post-mRNA release spliceosomal complex • нуклеоплазма • U2-type catalytic step 1 spliceosome Біологічний процес • mRNA processing • transcription-coupled nucleotide-excision repair • mRNA 3'-splice site recognition • Сплайсинг РНК • mRNA splicing, via spliceosome • generation of catalytic spliceosome for second transesterification step Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	57461	н/д
Ensembl	ENSG00000240682	н/д
UniProt	Q9ULR0	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_020701 NM_001199469	н/д
RefSeq (білок)	NP_001191819	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 3: 129.13 – 129.16 Mb	н/д
PubMed search		н/д
Вікідані
Див./Ред. для людей

ISY1 (англ. ISY1-RAB43 readthrough) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 3-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 285 амінокислот, а молекулярна маса — 32 992.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MARNAEKAMT		ALARFRQAQL		EEGKVKERRP		FLASECTELP		KAEKWRRQII
GEISKKVAQI		QNAGLGEFRI		RDLNDEINKL		LREKGHWEVR		IKELGGPDYG
KVGPKMLDHE		GKEVPGNRGY		KYFGAAKDLP		GVRELFEKEP		LPPPRKTRAE
LMKAIDFEYY		GYLDEDDGVI		VPLEQEYEKK		LRAELVEKWK		AEREARLARG
EKEEEEEEEE		EINIYAVTEE		ESDEEGSQEK		GGDDSQQKFI		AHVPVPSQQE
IEEALVRRKK		MELLQKYASE		TLQAQSEEAR		RLLGY

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Jurica M.S., Licklider L.J., Gygi S.P., Grigorieff N., Moore M.J. (2002). Purification and characterization of native spliceosomes suitable for three-dimensional structural analysis. RNA. 8: 426—439. PMID 11991638 DOI:10.1017/S1355838202021088

Див. також

• Хромосома 3