JMJD1C
Перейти до навігації
Перейти до пошуку
JMJD1C (англ. Jumonji domain containing 1C) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 540 амінокислот, а молекулярна маса — 284 525[5].
Послідовність амінокислот
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MAVETRAELV | GKRFLCVAVG | DEARSERWES | GRGWRSWRAG | VIRAVSHRDS | ||||
RNPDLAVYVE | FDDLEWDKRE | WVKVYEDFST | FLVEYHLIWA | KRNDPSQTQG | ||||
SKSKQIQWPA | LTFKPLVERN | IPSSVTAVEF | LVDKQLDFLT | EDSAFQPYQD | ||||
DIDSLNPVLR | DNPQLHEEVK | VWVKEQKVQE | IFMQGPYSLN | GYRVRVYRQD | ||||
SATQWFTGII | THHDLFTRTM | IVMNDQVLEP | QNVDPSMVQM | TFLDDVVHSL | ||||
LKGENIGITS | RRRSRANQNV | NAVHSHYTRA | QANSPRPAMN | SQAAVPKQNT | ||||
HQQQQQRSIR | PNKRKGSDSS | IPDEEKMKEE | KYDYISRGEN | PKGKNKHLMN | ||||
KRRKPEEDEK | KLNMKRLRTD | NVSDFSESSD | SENSNKRIID | NSSEQKPENE | ||||
LKNKNTSKIN | GEEGKPHNNE | KAGEETLKNS | QPPWDQIQED | KKHEEAEKRK | ||||
SVDTQLQEDM | IIHSSEQSTV | SDHNSNDLLP | QECNMDKTHT | MELLPKEKFV | ||||
SRPPTPKCVI | DITNDTNLEK | VAQENSSTFG | LQTLQKMDPN | VSDSKHSIAN | ||||
AKFLETAKKD | SDQSWVSDVV | KVDLTQSSVT | NASSGNDHLN | MEKEKYVSYI | ||||
SPLSAVSVME | DKLHKRSPPP | ETIKSKLNTS | VDTHKIKSSP | SPEVVKPKIT | ||||
HSPDSVKSKA | TYVNSQATGE | RRLANKIEHE | LSRCSFHPIP | TRSSTLETTK | ||||
SPLIIDKNEH | FTVYRDPALI | GSETGANHIS | PFLSQHPFPL | HSSSHRTCLN | ||||
PGTHHPALTP | APHLLAGSSS | QTPLPTINTH | PLTSGPHHAV | HHPHLLPTVL | ||||
PGVPTASLLG | GHPRLESAHA | SSLSHLALAH | QQQQQLLQHQ | SPHLLGQAHP | ||||
SASYNQLGLY | PIIWQYPNGT | HAYSGLGLPS | SKWVHPENAV | NAEASLRRNS | ||||
PSPWLHQPTP | VTSADGIGLL | SHIPVRPSSA | EPHRPLKITA | HSSPPLTKTL | ||||
VDHHKEELER | KAFMEPLRSV | ASTSAKNDLD | LNRSQTGKDC | HLHRHFVDPV | ||||
LNQLQRPPQE | TGERLNKYKE | EHRRILQESI | DVAPFTTKIK | GLEGERENYS | ||||
RVASSSSSPK | SHIIKQDMDV | ERSVSDLYKM | KHSVPQSLPQ | SNYFTTLSNS | ||||
VVNEPPRSYP | SKEVSNIYGD | KQSNALAAAA | ANPQTLTSFI | TSLSKPPPLI | ||||
KHQPESEGLV | GKIPEHLPHQ | IASHSVTTFR | NDCRSPTHLT | VSSTNTLRSM | ||||
PALHRAPVFH | PPIHHSLERK | EGSYSSLSPP | TLTPVMPVNA | GGKVQESQKP | ||||
PTLIPEPKDS | QANFKSSSEQ | SLTEMWRPNN | NLSKEKTEWH | VEKSSGKLQA | ||||
AMASVIVRPS | SSTKTDSMPA | MQLASKDRVS | ERSSAGAHKT | DCLKLAEAGE | ||||
TGRIILPNVN | SDSVHTKSEK | NFQAVSQGSV | PSSVMSAVNT | MCNTKTDVIT | ||||
SAADTTSVSS | WGGSEVISSL | SNTILASTSS | ECVSSKSVSQ | PVAQKQECKV | ||||
STTAPVTLAS | SKTGSVVQPS | SGFSGTTDFI | HLKKHKAALA | AAQYKSSNAS | ||||
ETEPNAIKNQ | TLSASLPLDS | TVICSTINKA | NSVGNGQASQ | TSQPNYHTKL | ||||
KKAWLTRHSE | EDKNTNKMEN | SGNSVSEIIK | PCSVNLIAST | SSDIQNSVDS | ||||
KIIVDKYVKD | DKVNRRKAKR | TYESGSESGD | SDESESKSEQ | RTKRQPKPTY | ||||
KKKQNDLQKR | KGEIEEDLKP | NGVLSRSAKE | RSKLKLQSNS | NTGIPRSVLK | ||||
DWRKVKKLKQ | TGESFLQDDS | CCEIGPNLQK | CRECRLIRSK | KGEEPAHSPV | ||||
FCRFYYFRRL | SFSKNGVVRI | DGFSSPDQYD | DEAMSLWTHE | NFEDDELDIE | ||||
TSKYILDIIG | DKFCQLVTSE | KTALSWVKKD | AKIAWKRAVR | GVREMCDACE | ||||
ATLFNIHWVC | QKCGFVVCLD | CYKAKERKSS | RDKELYAWMK | CVKGQPHDHK | ||||
HLMPTQIIPG | SVLTDLLDAM | HTLREKYGIK | SHCHCTNKQN | LQVGNFPTMN | ||||
GVSQVLQNVL | NHSNKISLCM | PESQQQNTPP | KSEKNGGSSP | ESDVGTDNKL | ||||
TPPESQSPLH | WLADLAEQKA | REEKKENKEL | TLENQIKEER | EQDNSESPNG | ||||
RTSPLVSQNN | EQGSTLRDLL | TTTAGKLRVG | STDAGIAFAP | VYSMGAPSSK | ||||
SGRTMPNILD | DIIASVVENK | IPPSKTSKIN | VKPELKEEPE | ESIISAVDEN | ||||
NKLYSDIPHS | WICEKHILWL | KDYKNSSNWK | LFKECWKQGQ | PAVVSGVHKK | ||||
MNISLWKAES | ISLDFGDHQA | DLLNCKDSII | SNANVKEFWD | GFEEVSKRQK | ||||
NKSGETVVLK | LKDWPSGEDF | KTMMPARYED | LLKSLPLPEY | CNPEGKFNLA | ||||
SHLPGFFVRP | DLGPRLCSAY | GVVAAKDHDI | GTTNLHIEVS | DVVNILVYVG | ||||
IAKGNGILSK | AGILKKFEEE | DLDDILRKRL | KDSSEIPGAL | WHIYAGKDVD | ||||
KIREFLQKIS | KEQGLEVLPE | HDPIRDQSWY | VNKKLRQRLL | EEYGVRTCTL | ||||
IQFLGDAIVL | PAGALHQVQN | FHSCIQVTED | FVSPEHLVES | FHLTQELRLL | ||||
KEEINYDDKL | QVKNILYHAV | KEMVRALKIH | EDEVEDMEEN |
Кодований геном білок за функціями належить до оксидоредуктаз, регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, іоном заліза. Локалізований у ядрі.
Література[ред. | ред. код]
- Wolf S.S., Patchev V.K., Obendorf M. (2007). A novel variant of the putative demethylase gene, s-JMJD1C, is a coactivator of the AR. Arch. Biochem. Biophys. 460: 56—66. PMID 17353003 DOI:10.1016/j.abb.2007.01.017
- Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVI. The complete sequences of 150 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 65—73. PMID 10718198 DOI:10.1093/dnares/7.1.65
- Lee J.W., Choi H.-S., Gyuris J., Brent R., Moore D.D. (1995). Two classes of proteins dependent on either the presence or absence of thyroid hormone for interaction with the thyroid hormone receptor. Mol. Endocrinol. 9: 243—254. PMID 7776974 DOI:10.1210/mend.9.2.7776974
- Katoh M., Katoh M. (2003). Identification and characterization of TRIP8 gene in silico. Int. J. Mol. Med. 12: 817—821. PMID 14533015
Примітки[ред. | ред. код]
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з JMJD1C переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12313 (англ.) . Архів оригіналу за 1 серпня 2016. Процитовано 8 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q15652 (англ.) . Архів оригіналу за 23 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
Див. також[ред. | ред. код]
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |
Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |