KALRN

KALRN
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1WFW
Ідентифікатори
Символи	KALRN, ARHGEF24, CHD5, CHDS5, DUET, DUO, HAPIP, TRAD, kalirin, RhoGEF kinase, kalirin RhoGEF kinase
Зовнішні ІД	OMIM: 604605 MGI: 2685385 HomoloGene: 57160 GeneCards: KALRN
Пов'язані генетичні захворювання
шизофренія, Розлади аутистичного спектру, global developmental delay, інсульт, ішемічна хвороба серця, розумова відсталість
Онтологія гена Молекулярна функція • transferase activity • nucleotide binding • protein kinase activity • guanyl-nucleotide exchange factor activity • зв'язування з іоном металу • kinase activity • protein serine/threonine kinase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ATP binding • GO:0005097, GO:0005099, GO:0005100 GTPase activator activity Клітинна компонента • цитоплазма • actin cytoskeleton • екзосома • Цитоскелет • Нуклеоплазма • гіалоплазма • GO:0097483, GO:0097481 Постсинаптичне ущільнення Біологічний процес • GO:0007243 intracellular signal transduction • фосфорилювання • ephrin receptor signaling pathway • нейробіологія розвитку • protein phosphorylation • positive regulation of apoptotic process • regulation of Rho protein signal transduction • regulation of small GTPase mediated signal transduction • vesicle-mediated transport • GO:0072468 сигнальна трансдукція • positive regulation of dendritic spine morphogenesis • behavioral response to cocaine • behavioral fear response • соціальна поведінка • regulation of protein localization to plasma membrane • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity • regulation of synaptic transmission, glutamatergic • пам'ять • positive regulation of dendritic spine development • Rho protein signal transduction • neuromuscular junction development • лактація • adult locomotory behavior • response to mechanical stimulus • smooth muscle cell migration • maternal behavior • Звикання • regulation of neuronal synaptic plasticity • smooth muscle cell proliferation • negative regulation of growth hormone secretion • maternal process involved in parturition • behavioral response to formalin induced pain • positive regulation of long-term synaptic potentiation • G protein-coupled receptor signaling pathway Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	8997	545156
Ensembl	ENSG00000160145	ENSMUSG00000061751
UniProt	O60229	A2CG49
RefSeq (мРНК)	NM_001024660 NM_003947 NM_007064 NM_001322988 NM_001322989 NM_001322990 NM_001322991 NM_001322992 NM_001322993 NM_001322994 NM_001322995 NM_001322996 NM_001322997 NM_001322998 NM_001322999 NM_001323000 NM_001323001 NM_001388412 NM_001388413 NM_001388414 NM_001388415 NM_001388416 NM_001388417 NM_001388418 NM_001388419	NM_001164268 NM_177357
RefSeq (білок)	NP_001019831 NP_001309917 NP_001309918 NP_001309919 NP_001309920 NP_001309921 NP_001309922 NP_001309923 NP_001309924 NP_001309925 NP_001309926 NP_001309927 NP_001309928 NP_001309929 NP_001309930 NP_003938 NP_008995	NP_001157740 NP_796331
Локус (UCSC)	Хр. 3: 124.03 – 124.73 Mb	Хр. 16: 33.79 – 34.39 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

KALRN (англ. Kalirin RhoGEF kinase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 985 амінокислот, а молекулярна маса — 340 174.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MTDRFWDQWY		LWYLRLLRLL		DRGSFRNDGL		KASDVLPILK		EKVAFVSGGR
DKRGGPILTF		PARSNHDRIR		QEDLRKLVTY		LASVPSEDVC		KRGFTVIIDM
RGSKWDLIKP		LLKTLQEAFP		AEIHVALIIK		PDNFWQKQKT		NFGSSKFIFE
TSMVSVEGLT		KLVDPSQLTE		EFDGSLDYNH		EEWIELRLSL		EEFFNSAVHL
LSRLEDLQEM		LARKEFPVDV		EGSRRLIDEH		TQLKKKVLKA		PVEELDREGQ
RLLQCIRCSD		GFSGRNCIPG		SADFQSLVPK		ITSLLDKLHS		TRQHLHQMWH
VRKLKLDQCF		QLRLFEQDAE		KMFDWISHNK		ELFLQSHTEI		GVSYQYALDL
QTQHNHFAMN		SMNAYVNINR		IMSVASRLSE		AGHYASQQIK		QISTQLDQEW
KSFAAALDER		STILAMSAVF		HQKAEQFLSG		VDAWCKMCSE		GGLPSEMQDL
ELAIHHHQTL		YEQVTQAYTE		VSQDGKALLD		VLQRPLSPGN		SESLTATANY
SKAVHQVLDV		VHEVLHHQRR		LESIWQHRKV		RLHQRLQLCV		FQQDVQQVLD
WIENHGEAFL		SKHTGVGKSL		HRARALQKRH		DDFEEVAQNT		YTNADKLLEA
AEQLAQTGEC		DPEEIYKAAR		HLEVRIQDFV		RRVEQRKLLL		DMSVSFHTHT
KELWTWMEDL		QKEMLEDVCA		DSVDAVQELI		KQFQQQQTAT		LDATLNVIKE
GEDLIQQLRS		APPSLGEPSE		ARDSAVSNNK		TPHSSSISHI		ESVLQQLDDA
QVQMEELFHE		RKIKLDIFLQ		LRIFEQYTIE		VTAELDAWNE		DLLRQMNDFN
TEDLTLAEQR		LQRHTERKLA		MNNMTFEVIQ		QGQDLHQYIT		EVQASGIELI
CEKDIDLAAQ		VQELLEFLHE		KQHELELNAE		QTHKRLEQCL		QLRHLQAEVK
QVLGWIRNGE		SMLNASLVNA		SSLSEAEQLQ		REHEQFQLAI		ESLFHATSLQ
KTHQSALQVQ		QKAEVLLQAG		HYDADAIREC		AEKVALHWQQ		LMLKMEDRLK
LVNASVAFYK		TSEQVCSVLE		SLEQEYRRDE		DWCGGRDKLG		PAAEIDHVIP
LISKHLEQKE		AFLKACTLAR		RNAEVFLKYI		HRNNVSMPSV		ASHTRGPEQQ
VKAILSELLQ		RENRVLHFWT		LKKRRLDQCQ		QYVVFERSAK		QALDWIQETG
EFYLSTHTST		GETTEETQEL		LKEYGEFRVP		AKQTKEKVKL		LIQLADSFVE
KGHIHATEIR		KWVTTVDKHY		RDFSLRMGKY		RYSLEKALGV		NTEDNKDLEL
DIIPASLSDR		EVKLRDANHE		VNEEKRKSAR		KKEFIMAELL		QTEKAYVRDL
HECLETYLWE		MTSGVEEIPP		GILNKEHIIF		GNIQEIYDFH		NNIFLKELEK
YEQLPEDVGH		CFVTWADKFQ		MYVTYCKNKP		DSNQLILEHA		GTFFDEIQQR
HGLANSISSY		LIKPVQRITK		YQLLLKELLT		CCEEGKGELK		DGLEVMLSVP
KKANDAMHVS		MLEGFDENLD		VQGELILQDA		FQVWDPKSLI		RKGRERHLFL
FEISLVFSKE		IKDSSGHTKY		VYKNKLLTSE		LGVTEHVEGD		PCKFALWSGR
TPSSDNKTVL		KASNIETKQE		WIKNIREVIQ		ERIIHLKGAL		KEPLQLPKTP
AKQRNNSKRD		GVEDIDSQGD		GSSQPDTISI		ASRTSQNTVD		SDKLSGGCEL
TVVLQDFSAG		HSSELTIQVG		QTVELLERPS		ERPGWCLVRT		TERSPPLEGL
VPSSALCISH		SRSSVEMDCF		FPLVKDAYSH		SSSENGGKSE		SVANLQAQPS
LNSIHSSPGP		KRSTNTLKKW		LTSPVRRLNS		GKADGNIKKQ		KKVRDGRKSF
DLGSPKPGDE		TTPQGDSADE		KSKKGWGEDE		PDEESHTPLP		PPMKIFDNDP
TQDEMSSLLA		ARQASTEVPT		AADLVNAIEK		LVKNKLSLEG		SSYRGSLKDP
AGCLNEGMAP		PTPPKNPEEE		QKAKALRGRM		FVLNELVQTE		KDYVKDLGIV
VEGFMKRIEE		KGVPEDMRGK		DKIVFGNIHQ		IYDWHKDFFL		AELEKCIQEQ
DRLAQLFIKH		ERKLHIYVWY		CQNKPRSEYI		VAEYDAYFEE		VKQEINQRLT
LSDFLIKPIQ		RITKYQLLLK		DFLRYSEKAG		LECSDIEKAV		ELMCLVPKRC
NDMMNLGRLQ		GFEGTLTAQG		KLLQQDTFYV		IELDAGMQSR		TKERRVFLFE
QIVIFSELLR		KGSLTPGYMF		KRSIKMNYLV		LEENVDNDPC		KFALMNRETS
ERVVLQAANA		DIQQAWVQDI		NQVLETQRDF		LNALQSPIEY		QRKERSTAVM
RSQPARLPQA		SPRPYSSVPA		GSEKPPKGSS		YNPPLPPLKI		STSNGSPGFE
YHQPGDKFEA		SKQNDLGGCN		GTSSMAVIKD		YYALKENEIC		VSQGEVVQVL
AVNQQNMCLV		YQPASDHSPA		AEGWVPGSIL		APLTKATAAE		SSDGSIKKSC
SWHTLRMRKR		AEVENTGKNE		ATGPRKPKDI		LGNKVSVKET		NSSEESECDD
LDPNTSMEIL		NPNFIQEVAP		EFLVPLVDVT		CLLGDTVILQ		CKVCGRPKPT
ITWKGPDQNI		LDTDNSSATY		TVSSCDSGEI		TLKICNLMPQ		DSGIYTCIAT
NDHGTTSTSA		TVKVQGVPAA		PNRPIAQERS		CTSVILRWLP		PSSTGNCTIS
GYTVEYREEG		SQIWQQSVAS		TLDTYLVIED		LSPGCPYQFR		VSASNPWGIS
LPSEPSEFVR		LPEYDAAADG		ATISWKENFD		SAYTELNEIG		RGRFSIVKKC
IHKATRKDVA		VKFVSKKMKK		KEQAAHEAAL		LQHLQHPQYI		TLHDTYESPT
SYILILELMD		DGRLLDYLMN		HDELMEEKVA		FYIRDIMEAL		QYLHNCRVAH
LDIKPENLLI		DLRIPVPRVK		LIDLEDAVQI		SGHFHIHHLL		GNPEFAAPEV
IQGIPVSLGT		DIWSIGVLTY		VMLSGVSPFL		DESKEETCIN		VCRVDFSFPH
EYFCGVSNAA		RDFINVILQE		DFRRRPTAAT		CLQHPWLQPH		NGSYSKIPLD
TSRLACFIER		RKHQNDVRPI		PNVKSYIVNR		VNQGT

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, серин/треонінових протеїнкіназ, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, іонами металів, іоном магнію. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті.

Література

• Kawai T., Sanjo H., Akira S. (1999). Duet is a novel serine/threonine kinase with Dbl-homology (DH) and pleckstrin-homology (PH) domains. Gene. 227: 249—255. PMID 10023074 DOI:10.1016/S0378-1119(98)00605-2
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Voss M., Lettau M., Janssen O. (2009). Identification of SH3 domain interaction partners of human FasL (CD178) by phage display screening. BMC Immunol. 10: 53—53. PMID 19807924 DOI:10.1186/1471-2172-10-53
• Vishwanatha K.S., Wang Y.P., Keutmann H.T., Mains R.E., Eipper B.A. (2012). Structural organization of the nine spectrin repeats of Kalirin. Biochemistry. 51: 5663—5673. PMID 22738176 DOI:10.1021/bi300583s

Див. також

• Хромосома 3