KCTD5

KCTD5
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3DRX, 3DRY, 3DRZ
Ідентифікатори
Символи	KCTD5, potassium channel tetramerization domain containing 5
Зовнішні ІД	OMIM: 611285 MGI: 1916509 HomoloGene: 10363 GeneCards: KCTD5
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • cullin family protein binding • identical protein binding • GO:0032403 protein-containing complex binding Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • клітинне ядро • Cul3-RING ubiquitin ligase complex Біологічний процес • GO:0022415 viral process • protein homooligomerization • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	54442	69259
Ensembl	ENSG00000167977	ENSMUSG00000016946
UniProt	Q9NXV2	Q8VC57
RefSeq (мРНК)	NM_018992	NM_027008
RefSeq (білок)	NP_061865	NP_081284
Локус (UCSC)	Хр. 16: 2.68 – 2.71 Mb	Хр. 17: 24.27 – 24.29 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

KCTD5 (англ. Potassium channel tetramerization domain containing 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 16-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 234 амінокислот, а молекулярна маса — 26 093.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAENHCELLS		PARGGIGAGL		GGGLCRRCSA		GLGALAQRPG		SVSKWVRLNV
GGTYFLTTRQ		TLCRDPKSFL		YRLCQADPDL		DSDKDETGAY		LIDRDPTYFG
PVLNYLRHGK		LVINKDLAEE		GVLEEAEFYN		ITSLIKLVKD		KIRERDSKTS
QVPVKHVYRV		LQCQEEELTQ		MVSTMSDGWK		FEQLVSIGSS		YNYGNEDQAE
FLCVVSKELH		NTPYGTASEP		SEKAKILQER		GSRM

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, ацетилювання. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Weger S., Hammer E., Goetz A., Heilbronn R. (2007). Identification of a cytoplasmic interaction partner of the large regulatory proteins Rep78/Rep68 of adeno-associated virus type 2 (AAV-2). Virology. 362: 192—206. PMID 17239418 DOI:10.1016/j.virol.2006.12.010
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 16