KDM4C

KDM4C
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2XDP, 2XML, 4XDO, 4XDP, 5FJK, 5FJH
Ідентифікатори
Символи	KDM4C, GASC1, JHDM3C, JMJD2C, TDRD14C, bA146B14.1, lysine demethylase 4C
Зовнішні ІД	OMIM: 605469 MGI: 1924054 HomoloGene: 41004 GeneCards: KDM4C
Онтологія гена
Молекулярна функція	• oxidoreductase activity; • histone H3-methyl-lysine-9 demethylase activity; • dioxygenase activity; • зв'язування з іоном металу; • chromatin binding; • enzyme binding; • histone demethylase activity; • androgen receptor binding; • zinc ion binding; • histone H3-methyl-lysine-36 demethylase activity; • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific; • methylated histone binding;
Клітинна компонента	• клітинне ядро; • нуклеоплазма; • pericentric heterochromatin; • histone methyltransferase complex;
Біологічний процес	• GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • transcription, DNA-templated; • positive regulation of cell population proliferation; • blastocyst formation; • регуляція експресії генів; • GO:1901313 positive regulation of gene expression; • histone H3-K9 demethylation; • positive regulation of neuron differentiation; • negative regulation of histone H3-K9 trimethylation; • regulation of stem cell population maintenance; • regulation of stem cell differentiation; • histone H3-K36 demethylation; • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization; • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • ремоделювання хроматину; • stem cell population maintenance;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	23081
	76804
	ENSG00000107077
	ENSMUSG00000028397
	Q9H3R0
	Q8VCD7
NM_001146694; NM_001146695; NM_001146696; NM_001304339; NM_001304340;
	NM_001304341; NM_015061; NM_001353997; NM_001353998; NM_001353999; NM_001354000; NM_001354001
	NM_001172095; NM_144787; NM_001356561
NP_001140167; NP_001140168; NP_001291268; NP_001291269; NP_001291270;
	NP_055876; NP_001340926; NP_001340927; NP_001340928; NP_001340929; NP_001340930
	NP_001165566; NP_659036; NP_001343490
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

KDM4C (англ. Lysine demethylase 4C) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 056 амінокислот, а молекулярна маса — 119 982^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEVAEVESPL	NPSCKIMTFR	PSMEEFREFN	KYLAYMESKG	AHRAGLAKVI
PPKEWKPRQC	YDDIDNLLIP	APIQQMVTGQ	SGLFTQYNIQ	KKAMTVKEFR
QLANSGKYCT	PRYLDYEDLE	RKYWKNLTFV	APIYGADING	SIYDEGVDEW
NIARLNTVLD	VVEEECGISI	EGVNTPYLYF	GMWKTTFAWH	TEDMDLYSIN
YLHFGEPKSW	YAIPPEHGKR	LERLAQGFFP	SSSQGCDAFL	RHKMTLISPS
VLKKYGIPFD	KITQEAGEFM	ITFPYGYHAG	FNHGFNCAES	TNFATVRWID
YGKVAKLCTC	RKDMVKISMD	IFVRKFQPDR	YQLWKQGKDI	YTIDHTKPTP
ASTPEVKAWL	QRRRKVRKAS	RSFQCARSTS	KRPKADEEEE	VSDEVDGAEV
PNPDSVTDDL	KVSEKSEAAV	KLRNTEASSE	EESSASRMQV	EQNLSDHIKL
SGNSCLSTSV	TEDIKTEDDK	AYAYRSVPSI	SSEADDSIPL	SSGYEKPEKS
DPSELSWPKS	PESCSSVAES	NGVLTEGEES	DVESHGNGLE	PGEIPAVPSG
ERNSFKVPSI	AEGENKTSKS	WRHPLSRPPA	RSPMTLVKQQ	APSDEELPEV
LSIEEEVEET	ESWAKPLIHL	WQTKSPNFAA	EQEYNATVAR	MKPHCAICTL
LMPYHKPDSS	NEENDARWET	KLDEVVTSEG	KTKPLIPEMC	FIYSEENIEY
SPPNAFLEED	GTSLLISCAK	CCVRVHASCY	GIPSHEICDG	WLCARCKRNA
WTAECCLCNL	RGGALKQTKN	NKWAHVMCAV	AVPEVRFTNV	PERTQIDVGR
IPLQRLKLKC	IFCRHRVKRV	SGACIQCSYG	RCPASFHVTC	AHAAGVLMEP
DDWPYVVNIT	CFRHKVNPNV	KSKACEKVIS	VGQTVITKHR	NTRYYSCRVM
AVTSQTFYEV	MFDDGSFSRD	TFPEDIVSRD	CLKLGPPAEG	EVVQVKWPDG
KLYGAKYFGS	NIAHMYQVEF	EDGSQIAMKR	EDIYTLDEEL	PKRVKARFST
ASDMRFEDTF	YGADIIQGER	KRQRVLSSRF	KNEYVADPVY	RTFLKSSFQK
KCQKRQ

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до оксидоредуктаз, регуляторів хроматину. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, іоном заліза. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17071 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9H3R0 (англ.) . Архів оригіналу за 20 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 9

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17071 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q9H3R0 (англ.) . Архів оригіналу за 20 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

KDM4C

Література

Примітки

Див. також

Навігаційне меню

Пошук