KHDRBS1

KHDRBS1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2XA6, 3QHE
Ідентифікатори
Символи	KHDRBS1, Sam68, p62, p68, KH domain containing, RNA binding, signal transduction associated 1, KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 1
Зовнішні ІД	OMIM: 602489 MGI: 893579 HomoloGene: 4781 GeneCards: KHDRBS1
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • poly(A) binding • poly(U) RNA binding • SH3 domain binding • GO:0032403 protein-containing complex binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding • nucleic acid binding • protein domain specific binding • identical protein binding Клітинна компонента • цитоплазма • Grb2-Sos complex • мембрана • клітинне ядро • гіалоплазма • нуклеоплазма Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • regulation of protein stability • transcription, DNA-templated • positive regulation of RNA export from nucleus • cell surface receptor signaling pathway • G2/M transition of mitotic cell cycle • regulation of RNA export from nucleus • клітинний цикл • проліферація • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of translational initiation • GO:0072468 сигнальна трансдукція • mRNA processing • positive regulation of signal transduction • regulation of mRNA splicing, via spliceosome • Сперматогенез • protein complex oligomerization • regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome • G1/S transition of mitotic cell cycle Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10657	20218
Ensembl	ENSG00000121774	ENSMUSG00000028790
UniProt	Q07666	Q60749
RefSeq (мРНК)	NM_001271878 NM_006559	NM_011317
RefSeq (білок)	NP_001258807 NP_006550	NP_035447
Локус (UCSC)	Хр. 1: 32.01 – 32.06 Mb	Хр. 4: 129.6 – 129.64 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

KHDRBS1 (англ. KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 443 амінокислот, а молекулярна маса — 48 227.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MQRRDDPAAR		MSRSSGRSGS		MDPSGAHPSV		RQTPSRQPPL		PHRSRGGGGG
SRGGARASPA		TQPPPLLPPS		ATGPDATVGG		PAPTPLLPPS		ATASVKMEPE
NKYLPELMAE		KDSLDPSFTH		AMQLLTAEIE		KIQKGDSKKD		DEENYLDLFS
HKNMKLKERV		LIPVKQYPKF		NFVGKILGPQ		GNTIKRLQEE		TGAKISVLGK
GSMRDKAKEE		ELRKGGDPKY		AHLNMDLHVF		IEVFGPPCEA		YALMAHAMEE
VKKFLVPDMM		DDICQEQFLE		LSYLNGVPEP		SRGRGVPVRG		RGAAPPPPPV
PRGRGVGPPR		GALVRGTPVR		GAITRGATVT		RGVPPPPTVR		GAPAPRARTA
GIQRIPLPPP		PAPETYEEYG		YDDTYAEQSY		EGYEGYYSQS		QGDSEYYDYG
HGEVQDSYEA		YGQDDWNGTR		PSLKAPPARP		VKGAYREHPY		GRY

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як процесінг мРНК, транскрипція, регуляція транскрипції, клітинний цикл, ацетиляція. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі, мембрані.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Fusaki N., Iwamatsu A., Iwashima M., Fujisawa J. (1997). Interaction between Sam68 and Src family tyrosine kinases, Fyn and Lck, in T cell receptor signaling. J. Biol. Chem. 272: 6214—6219. PMID 9045636 DOI:10.1074/jbc.272.10.6214
• Sanchez-Margalet V., Martin-Romero C. (2001). Human leptin signaling in human peripheral blood mononuclear cells: activation of the JAK-STAT pathway. Cell. Immunol. 211: 30—36. PMID 11585385 DOI:10.1006/cimm.2001.1815
• Cote J., Boisvert F.-M., Boulanger M.-C., Bedford M.T., Richard S. (2003). Sam68 RNA binding protein is an in vivo substrate for protein arginine N-methyltransferase 1. Mol. Biol. Cell. 14: 274—287. PMID 12529443 DOI:10.1091/mbc.E02-08-0484
• Ong S.E., Mittler G., Mann M. (2004). Identifying and quantifying in vivo methylation sites by heavy methyl SILAC. Nat. Methods. 1: 119—126. PMID 15782174 DOI:10.1038/nmeth715
• Babic I., Jakymiw A., Fujita D.J. (2004). The RNA binding protein Sam68 is acetylated in tumor cell lines, and its acetylation correlates with enhanced RNA binding activity. Oncogene. 23: 3781—3789. PMID 15021911 DOI:10.1038/sj.onc.1207484

Див. також

• Хромосома 1