KMT5A

KMT5A
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1ZKK, 2BQZ, 3F9W, 3F9X, 3F9Y, 3F9Z, 4IJ8, 5HQ2
Ідентифікатори
Символи	KMT5A, PR-Set7, SET07, SET8, SETD8, lysine methyltransferase 5A, PR/SET07
Зовнішні ІД	OMIM: 607240 MGI: 1915206 HomoloGene: 41372 GeneCards: KMT5A
шифр КФ	2.1.1.354
Онтологія гена Молекулярна функція • protein-lysine N-methyltransferase activity • GO:0102674, GO:0102675 methyltransferase activity • GO:0001106 transcription corepressor activity • p53 binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • transferase activity • lysine N-methyltransferase activity • histone-lysine N-methyltransferase activity • histone methyltransferase activity (H4-K20 specific) Клітинна компонента • клітинне ядро • нуклеоплазма • хромосома • гіалоплазма Біологічний процес • Метилювання • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • peptidyl-lysine monomethylation • клітинний цикл • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • поділ клітини • transcription, DNA-templated • regulation of DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator • histone lysine methylation • regulation of signal transduction by p53 class mediator • histone H4-K20 methylation • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	387893	67956
Ensembl	ENSG00000183955	ENSMUSG00000049327
UniProt	Q9NQR1	Q2YDW7
RefSeq (мРНК)	NM_020382 NM_001324504 NM_001324505 NM_001324506 NM_001367386 NM_001367388 NM_001367389	NM_030241 NM_001310723 NM_001310725 NM_001310727
RefSeq (білок)	NP_001311433 NP_001311434 NP_001311435 NP_065115 NP_001354315 NP_001354317 NP_001354318	NP_001297652 NP_001297654 NP_001297656 NP_084517 NP_001392317 NP_001392319
Локус (UCSC)	Хр. 12: 123.38 – 123.41 Mb	Хр. 5: 124.58 – 124.6 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

KMT5A (англ. Lysine methyltransferase 5A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 393 амінокислот, а молекулярна маса — 42 890.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGEGGAAAAL		VAAAAAAAAA		AAAVVAGQRR		RRLGRRARCH		GPGRAAGGKM
SKPCAVEAAA		AAVAATAPGP		EMVERRGPGR		PRTDGENVFT		GQSKIYSYMS
PNKCSGMRFP		LQEENSVTHH		EVKCQGKPLA		GIYRKREEKR		NAGNAVRSAM
KSEEQKIKDA		RKGPLVPFPN		QKSEAAEPPK		TPPSSCDSTN		AAIAKQALKK
PIKGKQAPRK		KAQGKTQQNR		KLTDFYPVRR		SSRKSKAELQ		SEERKRIDEL
IESGKEEGMK		IDLIDGKGRG		VIATKQFSRG		DFVVEYHGDL		IEITDAKKRE
ALYAQDPSTG		CYMYYFQYLS		KTYCVDATRE		TNRLGRLINH		SKCGNCQTKL
HDIDGVPHLI		LIASRDIAAG		EELLYDYGDR		SKASIEAHPW		LKH

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, репресорів, регуляторів хроматину, метилтрансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, клітинний цикл, поділ клітини, мітоз, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з S-аденозил-L-метіоніном. Локалізований у ядрі, хромосомах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Julien E., Herr W. (2004). A switch in mitotic histone H4 lysine 20 methylation status is linked to M phase defects upon loss of HCF-1. Mol. Cell. 14: 713—725. PMID 15200950 DOI:10.1016/j.molcel.2004.06.008
• Sims J.K., Houston S.I., Magazinnik T., Rice J.C. (2006). A trans-tail histone code defined by monomethylated H4 Lys-20 and H3 Lys-9 demarcates distinct regions of silent chromatin. J. Biol. Chem. 281: 12760—12766. PMID 16517599 DOI:10.1074/jbc.M513462200
• Couture J.-F., Collazo E., Brunzelle J.S., Trievel R.C. (2005). Structural and functional analysis of SET8, a histone H4 'Lys-20' methyltransferase. Genes Dev. 19: 1455—1465. PMID 15933070 DOI:10.1101/gad.1318405

Див. також

• Хромосома 12