Ku80

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
Перейти до навігації Перейти до пошуку
XRCC5
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи XRCC5, KARP-1, KARP1, KU80, KUB2, Ku86, NFIV, Ku80, X-ray repair complementing defective repair in Chinese hamster cells 5, X-ray repair cross complementing 5
Зовнішні ІД OMIM: 194364 MGI: 104517 HomoloGene: 40681 GeneCards: XRCC5
Шаблон експресії


Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_021141
NM_009533
NM_001357519
NM_001357520
RefSeq (білок)
NP_066964
NP_033559
NP_001344448
NP_001344449
Локус (UCSC) Хр. 2: 216.11 – 216.21 Mb Хр. 1: 72.35 – 72.43 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

Ku80 (англ. X-ray repair cross complementing 5) – білок, який кодується геном XRCC5, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 732 амінокислот, а молекулярна маса — 82 705[4]. Разом з Ku70 формують Ku-гетеродимер

Послідовність амінокислот
1020304050
MVRSGNKAAVVLCMDVGFTMSNSIPGIESPFEQAKKVITMFVQRQVFAEN
KDEIALVLFGTDGTDNPLSGGDQYQNITVHRHLMLPDFDLLEDIESKIQP
GSQQADFLDALIVSMDVIQHETIGKKFEKRHIEIFTDLSSRFSKSQLDII
IHSLKKCDISLQFFLPFSLGKEDGSGDRGDGPFRLGGHGPSFPLKGITEQ
QKEGLEIVKMVMISLEGEDGLDEIYSFSESLRKLCVFKKIERHSIHWPCR
LTIGSNLSIRIAAYKSILQERVKKTWTVVDAKTLKKEDIQKETVYCLNDD
DETEVLKEDIIQGFRYGSDIVPFSKVDEEQMKYKSEGKCFSVLGFCKSSQ
VQRRFFMGNQVLKVFAARDDEAAAVALSSLIHALDDLDMVAIVRYAYDKR
ANPQVGVAFPHIKHNYECLVYVQLPFMEDLRQYMFSSLKNSKKYAPTEAQ
LNAVDALIDSMSLAKKDEKTDTLEDLFPTTKIPNPRFQRLFQCLLHRALH
PREPLPPIQQHIWNMLNPPAEVTTKSQIPLSKIKTLFPLIEAKKKDQVTA
QEIFQDNHEDGPTAKKLKTEQGGAHFSVSSLAEGSVTSVGSVNPAENFRV
LVKQKKASFEEASNQLINHIEQFLDTNETPYFMKSIDCIRAFREEAIKFS
EEQRFNNFLKALQEKVEIKQLNHFWEIVVQDGITLITKEEASGSSVTAEE
AKKFLAPKDKPSGDTAAVFEEGGDVDDLLDMI

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, активаторів, геліказ. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, пошкодження ДНК, репарація ДНК, рекомбінація ДНК. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, ДНК. Локалізований у ядрі, хромосомах.

Література

[ред. | ред. код]
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Oderwald H., Hughes M.J., Jost J.-P. (1996). Non-histone protein 1 (NHP1) is a member of the Ku protein family which is upregulated in differentiating mouse myoblasts and human promyelocytes. FEBS Lett. 382: 313—318. PMID 8605992 DOI:10.1016/0014-5793(96)00189-5
  • Stuiver M.H., Coenjaerts F.E.J., van der Vlied P.C. (1990). The autoantigen Ku is indistinguishable from NF IV, a protein forming multimeric protein-DNA complexes. J. Exp. Med. 172: 1049—1054. PMID 2212941 DOI:10.1084/jem.172.4.1049
  • Cao Q.P., Pitt S., Leszyk J., Baril E.F. (1994). DNA-dependent ATPase from HeLa cells is related to human Ku autoantigen. Biochemistry. 33: 8548—8557. PMID 8031790 DOI:10.1021/bi00194a021
  • Chan D.W., Ye R., Veillette C.J., Lees-Miller S.P. (1999). DNA-dependent protein kinase phosphorylation sites in Ku 70/80 heterodimer. Biochemistry. 38: 1819—1828. PMID 10026262 DOI:10.1021/bi982584b
  • Wang H., Fang R., Cho J.-Y., Libermann T.A., Oettgen P. (2004). Positive and negative modulation of the transcriptional activity of the ETS factor ESE-1 through interaction with p300, CREB-binding protein, and Ku 70/86. J. Biol. Chem. 279: 25241—25250. PMID 15075319 DOI:10.1074/jbc.M401356200

Примітки

[ред. | ред. код]
  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12833 (англ.) . Архів оригіналу за 28 травня 2017. Процитовано 6 лютого 2017.
  4. UniProt, P13010 (англ.) . Архів оригіналу за 11 травня 2017. Процитовано 6 лютого 2017.

Див. також

[ред. | ред. код]