L3MBTL2

L3MBTL2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2W0T, 3CEY, 3F70
Ідентифікатори
Символи	L3MBTL2, H-l(3)mbt-l, L3MBT, L3MBTL2 polycomb repressive complex 1 subunit, polycomb repressive complex 1 subunit, L3MBTL histone methyl-lysine binding protein 2
Зовнішні ІД	OMIM: 611865 MGI: 2443584 HomoloGene: 12882 GeneCards: L3MBTL2
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0031493 histone binding • zinc ion binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • methylated histone binding Клітинна компонента • клітинне ядро • нуклеоплазма Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • negative regulation of G0 to G1 transition • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	83746	214669
Ensembl	ENSG00000100395	ENSMUSG00000022394
UniProt	Q969R5	P59178
RefSeq (мРНК)	NM_001003689 NM_031488	NM_001289711 NM_001289712 NM_145993
RefSeq (білок)	NP_113676	NP_001276640 NP_001276641 NP_666105
Локус (UCSC)	Хр. 22: 41.21 – 41.23 Mb	Хр. 15: 81.55 – 81.57 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

L3MBTL2 (англ. L3MBTL2, polycomb repressive complex 1 subunit) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 705 амінокислот, а молекулярна маса — 79 110.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEKPRSIEET		PSSEPMEEEE		DDDLELFGGY		DSFRSYNSSV		GSESSSYLEE
SSEAENEDRE		AGELPTSPLH		LLSPGTPRSL		DGSGSEPAVC		EMCGIVGTRE
AFFSKTKRFC		SVSCSRSYSS		NSKKASILAR		LQGKPPTKKA		KVLHKAAWSA
KIGAFLHSQG		TGQLADGTPT		GQDALVLGFD		WGKFLKDHSY		KAAPVSCFKH
VPLYDQWEDV		MKGMKVEVLN		SDAVLPSRVY		WIASVIQTAG		YRVLLRYEGF
ENDASHDFWC		NLGTVDVHPI		GWCAINSKIL		VPPRTIHAKF		TDWKGYLMKR
LVGSRTLPVD		FHIKMVESMK		YPFRQGMRLE		VVDKSQVSRT		RMAVVDTVIG
GRLRLLYEDG		DSDDDFWCHM		WSPLIHPVGW		SRRVGHGIKM		SERRSDMAHH
PTFRKIYCDA		VPYLFKKVRA		VYTEGGWFEE		GMKLEAIDPL		NLGNICVATV
CKVLLDGYLM		ICVDGGPSTD		GLDWFCYHAS		SHAIFPATFC		QKNDIELTPP
KGYEAQTFNW		ENYLEKTKSK		AAPSRLFNMD		CPNHGFKVGM		KLEAVDLMEP
RLICVATVKR		VVHRLLSIHF		DGWDSEYDQW		VDCESPDIYP		VGWCELTGYQ
LQPPVAAEPA		TPLKAKEATK		KKKKQFGKKR		KRIPPTKTRP		LRQGSKKPLL
EDDPQGARKI		SSEPVPGEII		AVRVKEEHLD		VASPDKASSP		ELPVSVENIK
QETDD

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у ядрі.

Література

• Wismar J. (2001). Molecular characterization of h-l(3)mbt-like: a new member of the human mbt family. FEBS Lett. 507: 119—121. PMID 11682070 DOI:10.1016/S0014-5793(01)02959-3
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Ogawa H., Ishiguro K., Gaubatz S., Livingston D.M., Nakatani Y. (2002). A complex with chromatin modifiers that occupies E2F- and Myc-responsive genes in G0 cells. Science. 296: 1132—1136. PMID 12004135 DOI:10.1126/science.1069861
• Impens F., Radoshevich L., Cossart P., Ribet D. (2014). Mapping of SUMO sites and analysis of SUMOylation changes induced by external stimuli. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 111: 12432—12437. PMID 25114211 DOI:10.1073/pnas.1413825111
• Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep. 10: 1778—1791. PMID 25772364 DOI:10.1016/j.celrep.2015.02.033
• Lechtenberg B.C., Allen M.D., Rutherford T.J., Freund S.M., Bycroft M. (2009). Solution structure of the FCS zinc finger domain of the human polycomb group protein L(3)mbt-like 2. Protein Sci. 18: 657—661. PMID 19241375 DOI:10.1002/pro.51

Див. також

• Хромосома 22