LCOR

LCOR
Наявні структури PDB Пошук для людей: PDBe RCSB Список кодів PDB 2COB
Ідентифікатори
Символи	LCOR, MLR2, ligand dependent nuclear receptor corepressor, C10orf12
Зовнішні ІД	OMIM: 607698 HomoloGene: 22914 GeneCards: LCOR
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • transcription factor binding Клітинна компонента • клітинне ядро • нуклеоплазма Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	84458	365462
Ensembl	ENSG00000196233	н/д
UniProt	Q96JN0	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_001170765 NM_001170766 NM_001346516 NM_015652 NM_032440	XM_006223759 XM_006231418 XM_008760470 XM_008760471 XM_008760472 XM_008774844 XM_008774845
RefSeq (білок)	NP_001164236 NP_001164237 NP_001333445 NP_115816	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 10: 96.83 – 97 Mb	н/д
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

LCOR (англ. Ligand dependent nuclear receptor corepressor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 433 амінокислот, а молекулярна маса — 47 007.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MQRMIQQFAA		EYTSKNSSTQ		DPSQPNSTKN		QSLPKASPVT		TSPTAATTQN
PVLSKLLMAD		QDSPLDLTVR		KSQSEPSEQD		GVLDLSTKKS		PCAGSTSLSH
SPGCSSTQGN		GRPGRPSQYR		PDGLRSGDGV		PPRSLQDGTR		EGFGHSTSLK
VPLARSLQIS		EELLSRNQLS		TAASLGPSGL		QNHGQHLILS		REASWAKPHY
EFNLSRMKFR		GNGALSNISD		LPFLAENSAF		PKMALQAKQD		GKKDVSHSSP
VDLKIPQVRG		MDLSWESRTG		DQYSYSSLVM		GSQTESALSK		KLRAILPKQS
RKSMLDAGPD		SWGSDAEQST		SGQPYPTSDQ		EGDPGSKQPR		KKRGRYRQYN
SEILEEAISV		VMSGKMSVSK		AQSIYGIPHS		TLEYKVKERL		GTLKNPPKKK
MKLMRSEGPD		VSVKIELDPQ		GEAAQSANES		KNE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Nagase T., Nakayama M., Nakajima D., Kikuno R., Ohara O. (2001). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XX. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 8: 85—95. PMID 11347906 DOI:10.1093/dnares/8.2.85
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 10