LIMD1

LIMD1
Ідентифікатори
Символи	LIMD1, LIM domains containing 1, LIM domain containing 1
Зовнішні ІД	OMIM: 604543 MGI: 1352502 HomoloGene: 8478 GeneCards: LIMD1
Онтологія гена Молекулярна функція • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001106 transcription corepressor activity • zinc ion binding Клітинна компонента • цитоплазма • RISC • focal adhesion • Адгезивні контакти • P-body • Міжклітинні контакти • клітинне ядро • transcription regulator complex • гіалоплазма • клітинна мембрана • cell-cell junction Біологічний процес • response to hypoxia • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • фосфорилювання • negative regulation of osteoblast differentiation • transcription, DNA-templated • GO:1905618 positive regulation of gene silencing by miRNA • multicellular organism development • negative regulation of hippo signaling • gene silencing by miRNA • cytoskeleton organization • P-body assembly • regulation of cell shape • osteoblast development • Сайленсинг генів • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • cell migration • negative regulation of canonical Wnt signaling pathway • GO:0072468 сигнальна трансдукція • regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to hypoxia Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	8994	29806
Ensembl	ENSG00000144791	ENSMUSG00000025239
UniProt	Q9UGP4	Q9QXD8
RefSeq (мРНК)	NM_014240	NM_013860
RefSeq (білок)	NP_055055	NP_038888
Локус (UCSC)	Хр. 3: 45.56 – 45.69 Mb	Хр. 9: 123.31 – 123.35 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

LIMD1 (англ. LIM domains containing 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 676 амінокислот, а молекулярна маса — 72 190.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDKYDDLGLE		ASKFIEDLNM		YEASKDGLFR		VDKGAGNNPE		FEETRRVFAT
KMAKIHLQQQ		QQQLLQEETL		PRGSRGPVNG		GGRLGPQARW		EVVGSKLTVD
GAAKPPLAAS		TGAPGAVTTL		AAGQPPYPPQ		EQRSRPYLHG		TRHGSQDCGS
RESLATSEMS		AFHQPGPCED		PSCLTHGDYY		DNLSLASPKW		GDKPGVSPSI
GLSVGSGWPS		SPGSDPPLPK		PCGDHPLNHR		QLSLSSSRSS		EGSLGGQNSG
IGGRSSEKPT		GLWSTASSQR		VSPGLPSPNL		ENGAPAVGPV		QPRTPSVSAP
LALSCPRQGG		LPRSNSGLGG		EVSGVMSKPN		VDPQPWFQDG		PKSYLSSSAP
SSSPAGLDGS		QQGAVPGLGP		KPGCTDLGTG		PKLSPTSLVH		PVMSTLPELS
CKEGPLGWSS		DGSLGSVLLD		SPSSPRVRLP		CQPLVPGPEL		RPSAAELKLE
ALTQRLEREM		DAHPKADYFG		ACVKCSKGVF		GAGQACQAMG		NLYHDTCFTC
AACSRKLRGK		AFYFVNGKVF		CEEDFLYSGF		QQSADRCFLC		GHLIMDMILQ
ALGKSYHPGC		FRCVICNECL		DGVPFTVDSE		NKIYCVRDYH		KVLAPKCAAC
GLPILPPEGS		DETIRVVSMD		RDYHVECYHC		EDCGLELNDE		DGHRCYPLED
HLFCHSCHVK		RLEKRPSSTA		LHQHHF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, РНК-залежне заглушення генів, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, клітинних контактах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Feng Y., Longmore G.D. (2005). The LIM protein Ajuba influences interleukin-1-induced NF-kappaB activation by affecting the assembly and activity of the protein kinase Czeta/p62/TRAF6 signaling complex. Mol. Cell. Biol. 25: 4010—4022. PMID 15870274 DOI:10.1128/MCB.25.10.4010-4022.2005
• Huggins C.J., Andrulis I.L. (2008). Cell cycle regulated phosphorylation of LIMD1 in cell lines and expression in human breast cancers. Cancer Lett. 267: 55—66. PMID 18439753 DOI:10.1016/j.canlet.2008.03.015

Див. також

• Хромосома 3