LIN28B

LIN28B
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4A4I
Ідентифікатори
Символи	LIN28B, CSDD2, lin-28 homolog B
Зовнішні ІД	OMIM: 611044 MGI: 3584032 HomoloGene: 47607 GeneCards: LIN28B
Пов'язані генетичні захворювання
нейробластома
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • zinc ion binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • RNA binding • nucleic acid binding Клітинна компонента • цитоплазма • клітинне ядро • ядерце • гіалоплазма Біологічний процес • pre-miRNA processing • miRNA catabolic process • Сайленсинг генів • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • RNA 3'-end processing Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	389421	380669
Ensembl	ENSG00000187772	ENSMUSG00000063804
UniProt	Q6ZN17	Q45KJ6
RefSeq (мРНК)	NM_001004317	NM_001031772 NM_001033152
RefSeq (білок)	NP_001004317	NP_001026942
Локус (UCSC)	Хр. 6: 104.94 – 105.08 Mb	Хр. 10: 45.25 – 45.36 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

LIN28B (англ. Lin-28 homolog B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 250 амінокислот, а молекулярна маса — 27 084.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAEGGASKGG		GEEPGKLPEP		AEEESQVLRG		TGHCKWFNVR		MGFGFISMIN
REGSPLDIPV		DVFVHQSKLF		MEGFRSLKEG		EPVEFTFKKS		SKGLESIRVT
GPGGSPCLGS		ERRPKGKTLQ		KRKPKGDRCY		NCGGLDHHAK		ECSLPPQPKK
CHYCQSIMHM		VANCPHKNVA		QPPASSQGRQ		EAESQPCTST		LPREVGGGHG
CTSPPFPQEA		RAEISERSGR		SPQEASSTKS		SIAPEEQSKK		GPSVQKRKKT

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як РНК-залежне заглушення генів, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Mayr F., Schutz A., Doge N., Heinemann U. (2012). The Lin28 cold-shock domain remodels pre-let-7 microRNA. Nucleic Acids Res. 40: 7492—7506. PMID 22570413 DOI:10.1093/nar/gks355

Див. також

• Хромосома 6