LRIF1

LRIF1
Ідентифікатори
Символи	LRIF1, C1orf103, RIF1, ligand dependent nuclear receptor interacting factor 1, HBiX1, FSHD3
Зовнішні ІД	OMIM: 615354 MGI: 2445214 HomoloGene: 10160 GeneCards: LRIF1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • retinoic acid receptor binding Клітинна компонента • nuclear matrix • клітинне ядро • центр організації мікротрубочок • Тільце Барра • хромосома Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • dosage compensation by inactivation of X chromosome Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	55791	321000
Ensembl	ENSG00000121931	ENSMUSG00000056260
UniProt	Q5T3J3	Q8CDD9
RefSeq (мРНК)	NM_001006945 NM_018372	NM_001039478 NM_001039488 NM_001286685 NM_028081 NM_177309
RefSeq (білок)	NP_001006946 NP_060842	NP_001034567 NP_001034577 NP_001273614 NP_082357
Локус (UCSC)	Хр. 1: 110.95 – 110.96 Mb	Хр. 3: 106.59 – 106.64 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

LRIF1 (англ. Ligand dependent nuclear receptor interacting factor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 769 амінокислот, а молекулярна маса — 84 568.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSNNLRRVFL		KPAEENSGNA		SRCVSGCMYQ		VVQTIGSDGK		NLLQLLPIPK
SSGNLIPLVQ		SSVMSDALKG		NTGKPVQVTF		QTQISSSSTS		ASVQLPIFQP
ASSSNYFLTR		TVDTSEKGRV		TSVGTGNFSS		SVSKVQSHGV		KIDGLTMQTF
AVPPSTQKDS		SFIVVNTQSL		PVTVKSPVLP		SGHHLQIPAH		AEVKSVPASS
LPPSVQQKIL		ATATTSTSGM		VEASQMPTVI		YVSPVNTVKN		VVTKNFQNIY
PKPVTEIAKP		VILNTTQIPK		NVATETQLKG		GQHSQAAPVK		WIFQDNLQPF
TPSLVPVKSS		NNVASKILKT		FVDRKNLGDN		TINMPPLSTI		DPSGTRSKNM
PIKDNALVMF		NGKVYLLAKK		GTDVLPSQID		QQNSVSPDTP		VRKDTLQTVS
SSPVTEISRE		VVNIVLAKSK		SSQMETKSLS		NTQLASMANL		RAEKNKVEKP
SPSTTNPHMN		QSSNYLKQSK		TLFTNPIFPV		GFSTGHNAPR		KVTAVIYARK
GSVLQSIEKI		SSSVDATTVT		SQQCVFRDQE		PKIHNEMAST		SDKGAQGRND
KKDSQGRSNK		ALHLKSDAEF		KKIFGLTKDL		RVCLTRIPDH		LTSGEGFDSF
SSLVKSGTYK		ETEFMVKEGE		RKQQNFDKKR		KAKTNKKMDH		IKKRKTENAY
NAIINGEANV		TGSQLLSSIL		PTSDVSQHNI		LTSHSKTRQE		KRTEMEYYTH
EKQEKGTLNS		NAAYEQSHFF		NKNYTEDIFP		VTPPELEETI		RDEKIRRLKQ
VLREKEAALE		EMRKKMHQK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

• Li H.J., Haque Z.K., Chen A., Mendelsohn M. (2007). RIF-1, a novel nuclear receptor corepressor that associates with the nuclear matrix. J. Cell. Biochem. 102: 1021—1035. PMID 17455211 DOI:10.1002/jcb.21340
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 1