LSM2

LSM2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3JCR
Ідентифікатори
Символи	LSM2, C6orf28, G7B, YBL026W, snRNP, LSM2 homolog, U6 small nuclear RNA and mRNA degradation associated
Зовнішні ІД	OMIM: 607282 MGI: 90676 HomoloGene: 48535 GeneCards: LSM2
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • U6 snRNA binding • RNA binding Клітинна компонента • гіалоплазма • U4/U6 x U5 tri-snRNP complex • catalytic step 2 spliceosome • U6 snRNP • P-body • нуклеоплазма • Lsm1-7-Pat1 complex • precatalytic spliceosome • spliceosomal complex • клітинне ядро • U2-type precatalytic spliceosome • Lsm2-8 complex Біологічний процес • mRNA splicing, via spliceosome • mRNA processing • exonucleolytic catabolism of deadenylated mRNA • Сплайсинг РНК Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	57819	27756
Ensembl	ENSG00000204392	ENSMUSG00000007050
UniProt	Q9Y333	O35900
RefSeq (мРНК)	NM_021177	NM_001110101 NM_001204273 NM_001204274 NM_030597
RefSeq (білок)	NP_067000	NP_001103571 NP_001191202 NP_001191203 NP_085100
Локус (UCSC)	Хр. 6: 31.8 – 31.81 Mb	Хр. 17: 35.2 – 35.2 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

LSM2 (англ. LSM2 homolog, U6 small nuclear RNA and mRNA degradation associated) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 95 амінокислот, а молекулярна маса — 10 835.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MLFYSFFKSL		VGKDVVVELK		NDLSICGTLH		SVDQYLNIKL		TDISVTDPEK
YPHMLSVKNC		FIRGSVVRYV		QLPADEVDTQ		LLQDAARKEA		LQQKQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рибонуклеопротеїнів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Jurica M.S., Licklider L.J., Gygi S.P., Grigorieff N., Moore M.J. (2002). Purification and characterization of native spliceosomes suitable for three-dimensional structural analysis. RNA. 8: 426—439. PMID 11991638 DOI:10.1017/S1355838202021088

Див. також

• Хромосома 6