MARCH8

MARCH8
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2D8S
Ідентифікатори
Символи	MARCHF8, MARCH-VIII, MIR, RNF178, c-MIR, CMIR, membrane associated ring-CH-type finger 8, MARCH8
Зовнішні ІД	OMIM: 613335 MGI: 1919029 HomoloGene: 12412 GeneCards: MARCHF8
Онтологія гена Молекулярна функція • zinc ion binding • зв'язування з іоном металу • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • transferase activity Клітинна компонента • integral component of membrane • lysosomal membrane • ендосома • лізосома • early endosome membrane • cytoplasmic vesicle membrane • мембрана • GO:0016023 cytoplasmic vesicle Біологічний процес • protein polyubiquitination • адаптивна імунна відповідь • Убіквітин-залежний протеоліз • процес імунної системи Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	220972	71779
Ensembl	ENSG00000165406 ENSG00000278545	ENSMUSG00000025702
UniProt	Q5T0T0	Q9DBD2
RefSeq (мРНК)	NM_001002265 NM_001002266 NM_001282866 NM_145021 NM_001401645 NM_001401646	NM_027920 NM_001302383 NM_001302384 NM_001302385
RefSeq (білок)	NP_001002266 NP_001269795 NP_659458	NP_001289312 NP_001289313 NP_001289314 NP_082196 NP_001388597 NP_001388598 NP_001388599 NP_001388600 NP_001388601 NP_001388602
Локус (UCSC)	Хр. 10: 45.45 – 45.59 Mb	Хр. 6: 116.31 – 116.39 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

MARCH8 (англ. Membrane associated ring-CH-type finger 8) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 10-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 291 амінокислот, а молекулярна маса — 32 965.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSMPLHQISA		IPSQDAISAR		VYRSKTKEKE		REEQNEKTLG		HFMSHSSNIS
KAGSPPSASA		PAPVSSFSRT		SITPSSQDIC		RICHCEGDDE		SPLITPCHCT
GSLHFVHQAC		LQQWIKSSDT		RCCELCKYEF		IMETKLKPLR		KWEKLQMTSS
ERRKIMCSVT		FHVIAITCVV		WSLYVLIDRT		AEEIKQGQAT		GILEWPFWTK
LVVVAIGFTG		GLLFMYVQCK		VYVQLWKRLK		AYNRVIYVQN		CPETSKKNIF
EKSPLTEPNF		ENKHGYGICH		SDTNSSCCTE		PEDTGAEIIH		V

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як адаптивний імунітет, імунітет, убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у мембрані, цитоплазматичних везикулах, лізосомі, ендосомах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Bartee E., Mansouri M., Hovey Nerenberg B.T., Gouveia K., Frueh K. (2004). Downregulation of major histocompatibility complex class I by human ubiquitin ligases related to viral immune evasion proteins. J. Virol. 78: 1109—1120. PMID 14722266 DOI:10.1128/JVI.78.3.1109-1120.2004
• Lapaque N., Jahnke M., Trowsdale J., Kelly A.P. (2009). The HLA-DRalpha chain is modified by polyubiquitination. J. Biol. Chem. 284: 7007—7016. PMID 19117940 DOI:10.1074/jbc.M805736200

Див. також

• Хромосома 10