MAVS

MAVS
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2MS7, 2MS8, 3J6C, 3J6J, 3RC5, 4P4H, 4Z8M, 5JEK
Ідентифікатори
Символи	MAVS, CARDIF, IPS-1, IPS1, VISA, mitochondrial antiviral signaling protein
Зовнішні ІД	OMIM: 609676 MGI: 2444773 HomoloGene: 17004 GeneCards: MAVS
Онтологія гена Молекулярна функція • signal transducer activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • CARD domain binding • protein kinase binding Клітинна компонента • integral component of membrane • мітохондріальна мембрана • мембрана • peroxisomal membrane • пероксисома • мітохондріальна зовнішня мембрана • мітохондрія Біологічний процес • positive regulation of type I interferon-mediated signaling pathway • positive regulation of protein phosphorylation • positive regulation of interferon-alpha production • процес імунної системи • regulation of peroxisome organization • positive regulation of DNA-binding transcription factor activity • positive regulation of IP-10 production • negative regulation of viral genome replication • defense response to bacterium • positive regulation of chemokine (C-C motif) ligand 5 production • positive regulation of interleukin-8 production • cellular response to exogenous dsRNA • activation of innate immune response • positive regulation of tumor necrosis factor production • positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • negative regulation of type I interferon production • вроджений імунітет • GO:0022415 viral process • positive regulation of type I interferon production • GO:0072468 сигнальна трансдукція • RIG-I signaling pathway • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • positive regulation of defense response to virus by host • positive regulation of interferon-beta production • protein deubiquitination • positive regulation of response to cytokine stimulus • defense response to virus Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	57506	228607
Ensembl	ENSG00000088888	ENSMUSG00000037523
UniProt	Q7Z434	Q8VCF0
RefSeq (мРНК)	NM_001206491 NM_020746 NM_001385663	NM_001206382 NM_001206383 NM_001206385 NM_144888
RefSeq (білок)	NP_001193420 NP_065797	NP_001193311 NP_001193312 NP_001193314 NP_659137
Локус (UCSC)	Хр. 20: 3.85 – 3.88 Mb	Хр. 2: 131.08 – 131.09 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

MAVS (англ. Mitochondrial antiviral signaling protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 540 амінокислот, а молекулярна маса — 56 528.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MPFAEDKTYK		YICRNFSNFC		NVDVVEILPY		LPCLTARDQD		RLRATCTLSG
NRDTLWHLFN		TLQRRPGWVE		YFIAALRGCE		LVDLADEVAS		VYQSYQPRTS
DRPPDPLEPP		SLPAERPGPP		TPAAAHSIPY		NSCREKEPSY		PMPVQETQAP
ESPGENSEQA		LQTLSPRAIP		RNPDGGPLES		SSDLAALSPL		TSSGHQEQDT
ELGSTHTAGA		TSSLTPSRGP		VSPSVSFQPL		ARSTPRASRL		PGPTGSVVST
GTSFSSSSPG		LASAGAAEGK		QGAESDQAEP		IICSSGAEAP		ANSLPSKVPT
TLMPVNTVAL		KVPANPASVS		TVPSKLPTSS		KPPGAVPSNA		LTNPAPSKLP
INSTRAGMVP		SKVPTSMVLT		KVSASTVPTD		GSSRNEETPA		APTPAGATGG
SSAWLDSSSE		NRGLGSELSK		PGVLASQVDS		PFSGCFEDLA		ISASTSLGMG
PCHGPEENEY		KSEGTFGIHV		AENPSIQLLE		GNPGPPADPD		GGPRPQADRK
FQEREVPCHR		PSPGALWLQV		AVTGVLVVTL		LVVLYRRRLH

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, вроджений імунітет, взаємодія хазяїн-вірус, противірусний захист, альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані, мітохондрії, зовнішній мембрані мітохондрій, пероксисомах.

Література

• Seth R.B., Sun L., Ea C.-K., Chen Z.J. (2005). Identification and characterization of MAVS, a mitochondrial antiviral signaling protein that activates NF-kappaB and IRF 3. Cell. 122: 669—682. PMID 16125763 DOI:10.1016/j.cell.2005.08.012
• Patel M.R., Loo Y.M., Horner S.M., Gale M. Jr., Malik H.S. (2012). Convergent evolution of escape from hepaciviral antagonism in primates. PLoS Biol. 10: E1001282—E1001282. PMID 22427742 DOI:10.1371/journal.pbio.1001282
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Li X.D., Sun L., Seth R.B., Pineda G., Chen Z.J. (2005). Hepatitis C virus protease NS3/4A cleaves mitochondrial antiviral signaling protein off the mitochondria to evade innate immunity. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 102: 17717—17722. PMID 16301520 DOI:10.1073/pnas.0508531102
• Komuro A., Horvath C.M. (2006). RNA- and virus-independent inhibition of antiviral signaling by RNA helicase LGP2. J. Virol. 80: 12332—12342. PMID 17020950 DOI:10.1128/JVI.01325-06
• Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240

Див. також

• Хромосома 20