MED1

MED1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1RJK, 1RK3, 1RKG, 1RKH, 2O4J, 2O4R, 2ZFX, 3A2H, 3AUN, 3VJS, 3VJT, 3VRT, 3VRU, 3VRV, 3VRW, 3W0G, 3W0H, 3W0I, 3W0J, 3W5P, 3W5Q, 3W5R, 3W5T, 3WT5, 3WT6, 3WT7, 3WTQ, 5AWK, 5AWJ, 4YNK, 5B5B
Ідентифікатори
Символи	MED1, CRSP1, CRSP200, DRIP205, DRIP230, PBP, PPARBP, PPARGBP, RB18A, TRAP220, TRIP2, mediator complex subunit 1
Зовнішні ІД	OMIM: 604311 MGI: 1100846 HomoloGene: 21002 GeneCards: MED1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0032403 protein-containing complex binding; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; • estrogen receptor binding; • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity; • transcription factor binding; • GO:0001104 transcription coregulator activity; • thyroid hormone receptor binding; • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; • retinoic acid receptor binding; • chromatin binding; • LBD domain binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • nuclear receptor binding; • vitamin D receptor binding; • DNA binding; • mediator complex binding; • GO:0001105 transcription coactivator activity; • peroxisome proliferator activated receptor binding; • nuclear receptor coactivator activity; • chromatin DNA binding; • RNA polymerase II core promoter sequence-specific DNA binding; • GO:0001106 transcription corepressor activity; • signaling receptor activity;
Клітинна компонента	• мембрана; • клітинне ядро; • mediator complex; • ядерце; • Хроматин; • ubiquitin ligase complex; • нуклеоплазма; • protein-DNA complex;
Біологічний процес	• regulation of RNA biosynthetic process; • thyroid hormone mediated signaling pathway; • negative regulation of neuron differentiation; • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II; • monocyte differentiation; • embryonic heart tube development; • androgen biosynthetic process; • epithelial cell proliferation involved in mammary gland duct elongation; • enucleate erythrocyte development; • animal organ regeneration; • Ангіогенез; • animal organ morphogenesis; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • negative regulation of keratinocyte proliferation; • positive regulation of erythrocyte differentiation; • regulation of transcription by RNA polymerase I; • ERK1 and ERK2 cascade; • in utero embryonic development; • mammary gland branching involved in pregnancy; • transcription, DNA-templated; • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated; • heart development; • Убіквітин-залежний протеоліз; • camera-type eye development; • transcription initiation from RNA polymerase II promoter; • лактація; • cellular response to steroid hormone stimulus; • positive regulation of intracellular estrogen receptor signaling pathway; • peroxisome proliferator activated receptor signaling pathway; • cellular response to hepatocyte growth factor stimulus; • positive regulation of keratinocyte differentiation; • positive regulation of interferon-gamma-mediated signaling pathway; • positive regulation of G0 to G1 transition; • embryonic placenta development; • negative regulation of apoptotic process; • intracellular steroid hormone receptor signaling pathway; • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • retinal pigment epithelium development; • ventricular trabecula myocardium morphogenesis; • thyroid hormone generation; • fat cell differentiation; • positive regulation of hepatocyte proliferation; • megakaryocyte development; • androgen receptor signaling pathway; • positive regulation of mammary gland epithelial cell proliferation; • mammary gland epithelial cell proliferation; • mammary gland branching involved in thelarche; • regulation of vitamin D receptor signaling pathway; • mRNA transcription by RNA polymerase II; • keratinocyte differentiation; • regulation of cell cycle; • cellular response to epidermal growth factor stimulus; • multicellular organism development; • positive regulation of signaling receptor activity; • brain development; • GO:1901313 positive regulation of gene expression; • lens development in camera-type eye; • GO:0000767 cell morphogenesis; • embryonic hemopoiesis; • cellular response to thyroid hormone stimulus; • positive regulation of cell population proliferation; • liver development; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • erythrocyte development; • embryonic hindlimb morphogenesis; • regulation of lipid metabolic process; • protein import into nucleus;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	5469
	19014
	ENSG00000125686
	ENSMUSG00000018160
	Q15648
	Q925J9
	NM_004774
	NM_001080118; NM_013634; NM_134027; NM_001361950; NM_001361951
	NP_004765
	NP_001073587; NP_038662; NP_598788; NP_001348879; NP_001348880
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

MED1 (англ. Mediator complex subunit 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 581 амінокислот, а молекулярна маса — 168 478^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MKAQGETEES	EKLSKMSSLL	ERLHAKFNQN	RPWSETIKLV	RQVMEKRVVM
SSGGHQHLVS	CLETLQKALK	VTSLPAMTDR	LESIARQNGL	GSHLSASGTE
CYITSDMFYV	EVQLDPAGQL	CDVKVAHHGE	NPVSCPELVQ	QLREKNFDEF
SKHLKGLVNL	YNLPGDNKLK	TKMYLALQSL	EQDLSKMAIM	YWKATNAGPL
DKILHGSVGY	LTPRSGGHLM	NLKYYVSPSD	LLDDKTASPI	ILHENNVSRS
LGMNASVTIE	GTSAVYKLPI	APLIMGSHPV	DNKWTPSFSS	ITSANSVDLP
ACFFLKFPQP	IPVSRAFVQK	LQNCTGIPLF	ETQPTYAPLY	ELITQFELSK
DPDPIPLNHN	MRFYAALPGQ	QHCYFLNKDA	PLPDGRSLQG	TLVSKITFQH
PGRVPLILNL	IRHQVAYNTL	IGSCVKRTIL	KEDSPGLLQF	EVCPLSESRF
SVSFQHPVND	SLVCVVMDVQ	DSTHVSCKLY	KGLSDALICT	DDFIAKVVQR
CMSIPVTMRA	IRRKAETIQA	DTPALSLIAE	TVEDMVKKNL	PPASSPGYGM
TTGNNPMSGT	TTPTNTFPGG	PITTLFNMSM	SIKDRHESVG	HGEDFSKVSQ
NPILTSLLQI	TGNGGSTIGS	SPTPPHHTPP	PVSSMAGNTK	NHPMLMNLLK
DNPAQDFSTL	YGSSPLERQN	SSSGSPRMEI	CSGSNKTKKK	KSSRLPPEKP
KHQTEDDFQR	ELFSMDVDSQ	NPIFDVNMTA	DTLDTPHITP	APSQCSTPPT
TYPQPVPHPQ	PSIQRMVRLS	SSDSIGPDVT	DILSDIAEEA	SKLPSTSDDC
PAIGTPLRDS	SSSGHSQSTL	FDSDVFQTNN	NENPYTDPAD	LIADAAGSPS
SDSPTNHFFH	DGVDFNPDLL	NSQSQSGFGE	EYFDESSQSG	DNDDFKGFAS
QALNTLGVPM	LGGDNGETKF	KGNNQADTVD	FSIISVAGKA	LAPADLMEHH
SGSQGPLLTT	GDLGKEKTQK	RVKEGNGTSN	STLSGPGLDS	KPGKRSRTPS
NDGKSKDKPP	KRKKADTEGK	SPSHSSSNRP	FTPPTSTGGS	KSPGSAGRSQ
TPPGVATPPI	PKITIQIPKG	TVMVGKPSSH	SQYTSSGSVS	SSGSKSHHSH
SSSSSSSAST	SGKMKSSKSE	GSSSSKLSSS	MYSSQGSSGS	SQSKNSSQSG
GKPGSSPITK	HGLSSGSSST	KMKPQGKPSS	LMNPSLSKPN	ISPSHSRPPG
GSDKLASPMK	PVPGTPPSSK	AKSPISSGSG	GSHMSGTSSS	SGMKSSSGLG
SSGSLSQKTP	PSSNSCTASS	SSFSSSGSSM	SSSQNQHGSS	KGKSPSRNKK
PSLTAVIDKL	KHGVVTSGPG	GEDPLDGQMG	VSTNSSSHPM	SSKHNMSGGE
FQGKREKSDK	DKSKVSTSGS	SVDSSKKTSE	SKNVGSTGVA	KIIISKHDGG
SPSIKAKVTL	QKPGESSGEG	LRPQMASSKN	YGSPLISGST	PKHERGSPSH
SKSPAYTPQN	LDSESESGSS	IAEKSYQNSP	SSDDGIRPLP	EYSTEKHKKH
KKEKKKVKDK	DRDRDRDKDR	DKKKSHSIKP	ESWSKSPISS	DQSLSMTSNT
ILSADRPSRL	SPDFMIGEED	DDLMDVALIG	N

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

Drane P., Barel M., Balbo M., Frade R. (1997). Identification of RB18A, a 205 kDa new p53 regulatory protein which shares antigenic and functional properties with p53. Oncogene. 15: 3013—3024. PMID 9444950 DOI:10.1038/sj.onc.1201492
Yuan C.-X., Ito M., Fondell J.D., Fu Z.-Y., Roeder R.G. (1998). The TRAP220 component of a thyroid hormone receptor-associated protein (TRAP) coactivator complex interacts directly with nuclear receptors in a ligand-dependent fashion. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 95: 7939—7944. PMID 9653119 DOI:10.1073/pnas.95.14.7939
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Lee J.W., Choi H.-S., Gyuris J., Brent R., Moore D.D. (1995). Two classes of proteins dependent on either the presence or absence of thyroid hormone for interaction with the thyroid hormone receptor. Mol. Endocrinol. 9: 243—254. PMID 7776974 DOI:10.1210/mend.9.2.7776974
Zhang J., Fondell J.D. (1999). Identification of mouse TRAP100: a transcriptional coregulatory factor for thyroid hormone and vitamin D receptors. Mol. Endocrinol. 13: 1130—1140. PMID 10406464 DOI:10.1210/mend.13.7.0295
Burakov D., Wong C.-W., Rachez C., Cheskis B.J., Freedman L.P. (2000). Functional interactions between the estrogen receptor and DRIP205, a subunit of the heteromeric DRIP coactivator complex. J. Biol. Chem. 275: 20928—20934. PMID 10770935 DOI:10.1074/jbc.M002013200

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9234 (англ.) . Архів оригіналу за 6 липня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, Q15648 (англ.) . Архів оригіналу за 27 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 17

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9234 (англ.) . Архів оригіналу за 6 липня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q15648 (англ.) . Архів оригіналу за 27 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

MED1

Література

Примітки

Див. також

Навігаційне меню

Пошук