MICB

MICB
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1JE6, 2WY3
Ідентифікатори
Символи	MICB, PERB11.2, MHC class I polypeptide-related sequence B
Зовнішні ІД	OMIM: 602436 MGI: 2179989 HomoloGene: 88329 GeneCards: MICB
Пов'язані генетичні захворювання
	dengue shock syndrome
Онтологія гена
Молекулярна функція	• natural killer cell lectin-like receptor binding;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • cell surface; • клітинна мембрана; • мембрана; • міжклітинний простір; • external side of plasma membrane;
Біологічний процес	• процес імунної системи; • gamma-delta T cell activation; • GO:0022415 viral process; • response to heat; • Цитоліз; • адаптивна імунна відповідь; • GO:0001306 response to oxidative stress; • response to retinoic acid; • T cell mediated cytotoxicity; • natural killer cell mediated cytotoxicity; • regulation of immune response; • immune response-activating cell surface receptor signaling pathway; • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь; • natural killer cell activation; • susceptibility to natural killer cell mediated cytotoxicity;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	4277
	243864
ENSG00000231179; ENSG00000224378; ENSG00000206449; ENSG00000227772; ENSG00000238289;
	ENSG00000231372; ENSG00000234218; ENSG00000204516
	ENSMUSG00000040987
	Q29980
	Q8HWE5
	NM_001289160; NM_001289161; NM_005931
	NM_153760; NM_153761
	NP_001276089; NP_001276090; NP_005922
	NP_715641; NP_715642
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

MICB (англ. MHC class I polypeptide-related sequence B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 383 амінокислот, а молекулярна маса — 42 646^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGLGRVLLFL	AVAFPFAPPA	AAAEPHSLRY	NLMVLSQDES	VQSGFLAEGH
LDGQPFLRYD	RQKRRAKPQG	QWAEDVLGAK	TWDTETEDLT	ENGQDLRRTL
THIKDQKGGL	HSLQEIRVCE	IHEDSSTRGS	RHFYYDGELF	LSQNLETQES
TVPQSSRAQT	LAMNVTNFWK	EDAMKTKTHY	RAMQADCLQK	LQRYLKSGVA
IRRTVPPMVN	VTCSEVSEGN	ITVTCRASSF	YPRNITLTWR	QDGVSLSHNT
QQWGDVLPDG	NGTYQTWVAT	RIRQGEEQRF	TCYMEHSGNH	GTHPVPSGKV
LVLQSQRTDF	PYVSAAMPCF	VIIIILCVPC	CKKKTSAAEG	PELVSLQVLD
QHPVGTGDHR	DAAQLGFQPL	MSATGSTGST	EGA

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як адаптивний імунітет, імунітет, взаємодія хазяїн-вірус, цитоліз, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

Bahram S., Spies T. (1996). Nucleotide sequence of a human MHC class I MICB cDNA. Immunogenetics. 43: 230—233. PMID 8575823 DOI:10.1007/s002510050051
Bahram S., Shiina T., Oka A., Tamiya G., Inoko H. (1996). Genomic structure of the human MHC class I MICB gene. Immunogenetics. 45: 161—162. PMID 8952966 DOI:10.1007/s002510050184
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Schroeder M., Elsner H.-A., Kim T.D., Blasczyk R. (2004). Eight novel MICB alleles, including a null allele, identified in gastric MALT lymphoma patients. Tissue Antigens. 64: 276—280. PMID 15304008 DOI:10.1111/j.1399-0039.2004.00286.x
Groh V., Steinle A., Bauer S., Spies T. (1998). Recognition of stress-induced MHC molecules by intestinal epithelial gammadelta T cells. Science. 279: 1737—1740. PMID 9497295 DOI:10.1126/science.279.5357.1737
Yamamoto K., Fujiyama Y., Andoh A., Bamba T., Okabe H. (2001). Oxidative stress increases MICA and MICB gene expression in the human colon carcinoma cell line (CaCo-2). Biochim. Biophys. Acta. 1526: 10—12. PMID 11287116 DOI:10.1016/S0304-4165(01)00099-X