MYPOP

MYPOP
Ідентифікатори
Символи	MYPOP, P42pop, Myb-related transcription factor, partner of profilin, Myb related transcription factor, partner of profilin
Зовнішні ІД	OMIM: 617861 MGI: 2446472 HomoloGene: 17083 GeneCards: MYPOP
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • protein homodimerization activity • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • клітинне ядро Біологічний процес • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	339344	232934
Ensembl	ENSG00000176182	ENSMUSG00000048481
UniProt	Q86VE0	Q8R4U1
RefSeq (мРНК)	NM_001012643	NM_145579
RefSeq (білок)	NP_001012661	NP_663554
Локус (UCSC)	Хр. 19: 45.89 – 45.9 Mb	Хр. 7: 18.73 – 18.74 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

MYPOP (англ. Myb related transcription factor, partner of profilin) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на довгому плечі 19-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 399 амінокислот, а молекулярна маса — 42 508.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MASAAAGEAE		ETTRLRKPRF		SFEENQILIR		EVRAHYPQLY		GAQSRRVSVA
ERRRVWDGIA		AKINGITSWK		RTGQEVQKRW		NDFKRRTKEK		LARVPHSTQG
AGPAAEDAFS		AEEETIFAIL		GPGVAAPGAG		AGAEEPPAAP		SSQPPPPSAC
PQRYVLSEDR		REDRRADTSA		HSKAGSSSPE		PWARPSCTPQ		EGGCPRPKER
ESPPPSALQP		VQLPRLALSP		PPPAPPLPPP		PPLAQVAPSP		PSPPPPPRPP
PTLSASDPSL		DFLRAQQETA		NAIRELAGTL		RQGLAKLSEA		LSALLPLLPG
TPVDSLPPPL		PPPPPPPPPP		RPVLPPPAPK		VEITPEPVSV		VAAVVDGAVV
AARGVIIAPR		SEEGAPRPPP		APLPPHDSPP		HKRRKGFPTR		KRRGRWKSP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до репресорів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 19