NAB1

NAB1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2YUF
Ідентифікатори
Символи	NAB1, NGFI-A binding protein 1
Зовнішні ІД	OMIM: 600800 MGI: 107564 HomoloGene: 4352 GeneCards: NAB1
Онтологія гена Молекулярна функція • transcription factor binding • GO:0001104 transcription coregulator activity Клітинна компонента • клітинне ядро Біологічний процес • Schwann cell differentiation • myelination • осифікація ендохондральна • regulation of epidermis development • transcription, DNA-templated • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	4664	17936
Ensembl	ENSG00000138386	ENSMUSG00000002881
UniProt	Q13506	Q61122
RefSeq (мРНК)	NM_005966 NM_001321312 NM_001321313 NM_001321314 NM_001321315	NM_008667
RefSeq (білок)	NP_001308241 NP_001308242 NP_001308243 NP_001308244 NP_005957	NP_032693
Локус (UCSC)	Хр. 2: 190.65 – 190.69 Mb	Хр. 1: 52.5 – 52.54 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

NAB1 (англ. NGFI-A binding protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 487 амінокислот, а молекулярна маса — 54 401.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAAALPRTLG		ELQLYRILQK		ANLLSYFDAF		IQQGGDDVQQ		LCEAGEEEFL
EIMALVGMAS		KPLHVRRLQK		ALRDWVTNPG		LFNQPLTSLP		VSSIPIYKLP
EGSPTWLGIS		CSSYERSSNA		REPHLKIPKC		AATTCVQSLG		QGKSDVVGSL
ALQSVGESRL		WQGHHATESE		HSLSPADLGS		PASPKESSEA		LDAAAALSVA
ECVERMAPTL		PKSDLNEVKE		LLKTNKKLAK		MIGHIFEMND		DDPHKEEEIR
KYSAIYGRFD		SKRKDGKHLT		LHELTVNEAA		AQLCVKDNAL		LTRRDELFAL
ARQISREVTY		KYTYRTTKSK		CGERDELSPK		RIKVEDGFPD		FQDSVQTLFQ
QARAKSEELA		ALSSQQPEKV		MAKQMEFLCN		QAGYERLQHA		ERRLSAGLYR
QSSEEHSPNG		LTSDNSDGQG		ERPLNLRMPN		LQNRQPHHFV		VDGELSRLYP
SEAKSHSSES		LGILKDYPHS		AFTLEKKVIK		TEPEDSR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Garcia-Gutierrez P., Juarez-Vicente F., Gallardo-Chamizo F., Charnay P., Garcia-Dominguez M. (2011). The transcription factor Krox20 is an E3 ligase that sumoylates its Nab coregulators. EMBO Rep. 12: 1018—1023. PMID 21836637 DOI:10.1038/embor.2011.152
• Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep. 10: 1778—1791. PMID 25772364 DOI:10.1016/j.celrep.2015.02.033

Див. також

• Хромосома 2