NCOA6

NCOA6
Ідентифікатори
Символи	NCOA6, AIB3, ASC2, NRC, PRIP, RAP250, TRBP, nuclear receptor coactivator 6
Зовнішні ІД	OMIM: 605299 HomoloGene: 40920 GeneCards: NCOA6
Онтологія гена Молекулярна функція • chromatin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • enzyme binding • estrogen receptor binding • retinoid X receptor binding • nuclear receptor coactivator activity • thyroid hormone receptor binding • GO:0001105 transcription coactivator activity Клітинна компонента • внутрішньоклітинна мембранна органела • transcription regulator complex • нуклеоплазма • клітинне ядро • histone methyltransferase complex • гіалоплазма Біологічний процес • myeloid cell differentiation • DNA recombination • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • cellular response to DNA damage stimulus • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • реплікація ДНК • heart development • brain development • DNA-templated transcription, initiation • response to hormone • GO:0100026 Репарація ДНК • intracellular estrogen receptor signaling pathway • glucocorticoid receptor signaling pathway • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • regulation of lipid metabolic process Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	23054	116464
Ensembl	ENSG00000198646	ENSRNOG00000018288
UniProt	Q14686	G3V8C9
RefSeq (мРНК)	NM_001242539 NM_014071 NM_001318240	NM_001276714
RefSeq (білок)	NP_001229468 NP_001305169 NP_054790	NP_001263643
Локус (UCSC)	Хр. 20: 34.69 – 34.83 Mb	н/д
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

NCOA6 (англ. Nuclear receptor coactivator 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 063 амінокислот, а молекулярна маса — 219 145.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MVLDDLPNLE		DIYTSLCSST		MEDSEMDFDS		GLEDDDTKSD		SILEDSTIFV
AFKGNIDDKD		FKWKLDAILK		NVPNLLHMES		SKLKVQKVEP		WNSVRVTFNI
PREAAERLRI		LAQSNNQQLR		DLGILSVQIE		GEGAINLALA		QNRSQDVRMN
GPMGAGNSVR		MEAGFPMASG		PGIIRMNNPA		TVMIPPGGNV		SSSMMAPGPN
PELQPRTPRP		ASQSDAMDPL		LSGLHIQQQS		HPSGSLAPPH		HPMQPVSVNR
QMNPANFPQL		QQQQQQQQQQ		QQQQQQQQQQ		QQQQQLQARP		PQQHQQQQPQ
GIRPQFTAPT		QVPVPPGWNQ		LPSGALQPPP		AQGSLGTMTA		NQGWKKAPLP
GPMQQQLQAR		PSLATVQTPS		HPPPPYPFGS		QQASQAHTNF		PQMSNPGQFT
APQMKSLQGG		PSRVPTPLQQ		PHLTNKSPAS		SPSSFQQGSP		ASSPTVNQTQ
QQMGPRPPQN		NPLPQGFQQP		VSSPGRNPMV		QQGNVPPNFM		VMQQQPPNQG
PQSLHPGLGG		MPKRLPPGFS		AGQANPNFMQ		GQVPSTTATT		PGNSGAPQLQ
ANQNVQHAGG		QGAGPPQNQM		QVSHGPPNMM		QPSLMGIHGN		MNNQQAGTSG
VPQVNLSNMQ		GQPQQGPPSQ		LMGMHQQIVP		SQGQMVQQQG		TLNPQNPMIL
SRAQLMPQGQ		MMVNPPSQNL		GPSPQRMTPP		KQMLSQQGPQ		MMAPHNQMMG
PQGQVLLQQN		PMIEQIMTNQ		MQGNKQQFNT		QNQSNVMPGP		AQIMRGPTPN
MQGNMVQFTG		QMSGQMLPQQ		GPVNNSPSQV		MGIQGQVLRP		PGPSPHMAQQ
HGDPATTANN		DVSLSQMMPD		VSIQQTNMVP		PHVQAMQGNS		ASGNHFSGHG
MSFNAPFSGA		PNGNQMSCGQ		NPGFPVNKDV		TLTSPLLVNL		LQSDISAGHF
GVNNKQNNTN		ANKPKKKKPP		RKKKNSQQDL		NTPDTRPAGL		EEADQPPLPG
EQGINLDNSG		PKLPEFSNRP		PGYPSQPVEQ		RPLQQMPPQL		MQHVAPPPQP
PQQQPQPQLP		QQQQPPPPSQ		PQSQQQQQQQ		QQMMMMLMMQ		QDPKSVRLPV
SQNVHPPRGP		LNPDSQRMPM		QQSGSVPVMV		SLQGPASVPP		SPDKQRMPMP
VNTPLGSNSR		KMVYQESPQN		PSSSPLAEMA		SLPEASGSEA		PSVPGGPNNM
PSHVVLPQNQ		LMMTGPKPGP		SPLSATQGAT		PQQPPVNSLP		SSHGHHFPNV
AAPTQTSRPK		TPNRASPRPY		YPQTPNNRPP		STEPSEISLS		PERLNASIAG
LFPPQINIPL		PPRPNLNRGF		DQQGLNPTTL		KAIGQAPSNL		TMNPSNFATP
QTHKLDSVVV		NSGKQSNSGA		TKRASPSNSR		RSSPGSSRKT		TPSPGRQNSK
APKLTLASQT		NAALLQNVEL		PRNVLVSPTP		LANPPVPGSF		PNNSGLNPQN
STVSVAAVGG		VVEDNKESLN		VPQDSDCQNS		QSRKEQVNIE		LKAVPAQEVK
MVVPEDQSKK		DGQPSDPNKL		PSVEENKNLV		SPAMREAPTS		LSQLLDNSGA
PNVTIKPPGL		TDLEVTPPVV		SGEDLKKASV		IPTLQDLSSS		KEPSNSLNLP
HSNELCSSLV		HPELSEVSSN		VAPSIPPVMS		RPVSSSSIST		PLPPNQITVF
VTSNPITTSA		NTSAALPTHL		QSALMSTVVT		MPNAGSKVMV		SEGQSAAQSN
ARPQFITPVF		INSSSIIQVM		KGSQPSTIPA		APLTTNSGLM		PPSVAVVGPL
HIPQNIKFSS		APVPPNALSS		SPAPNIQTGR		PLVLSSRATP		VQLPSPPCTS
SPVVPSHPPV		QQVKELNPDE		ASPQVNTSAD		QNTLPSSQST		TMVSPLLTNS
PGSSGNRRSP		VSSSKGKGKV		DKIGQILLTK		ACKKVTGSLE		KGEEQYGADG
ETEGQGLDTT		APGLMGTEQL		STELDSKTPT		PPAPTLLKMT		SSPVGPGTAS
AGPSLPGGAL		PTSVRSIVTT		LVPSELISAV		PTTKSNHGGI		ASESLAGGLV
EEKVGSHPEL		LPSIAPSQNL		VSKETSTTAL		QASVARPELE		VNAAIVSGQS
SEPKEIVEKS		KIPGRRNSRT		EEPTVASESV		ENGHRKRSSR		PASASSSTKD
ITSAVQSKRR		KSK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання. Локалізований у ядрі.

Література

• Mahajan M.A., Samuels H.H. (2000). A new family of nuclear receptor coregulators that integrates nuclear receptor signaling through CBP. Mol. Cell. Biol. 20: 5048—5063. PMID 10866662 DOI:10.1128/MCB.20.14.5048-5063.2000
• Caira F., Antonson P., Pelto-Huikko M., Treuter E., Gustafsson J.-A. (2000). Cloning and characterization of RAP250, a nuclear receptor coactivator. J. Biol. Chem. 275: 5308—5317. PMID 10681503 DOI:10.1074/jbc.275.8.5308
• Ko L., Cardona G.R., Chin W.W. (2000). Thyroid hormone receptor-binding protein, an LXXLL motif-containing protein, functions as a general coactivator. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 97: 6212—6217. PMID 10823961 DOI:10.1073/pnas.97.11.6212
• Nagase T., Seki N., Ishikawa K., Tanaka A., Nomura N. (1996). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. V. The coding sequences of 40 new genes (KIAA0161-KIAA0200) deduced by analysis of cDNA clones from human cell line KG-1. DNA Res. 3: 17—24. PMID 8724849 DOI:10.1093/dnares/3.1.17
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Iwasaki T., Chin W.W., Ko L. (2001). Identification and characterization of RRM-containing coactivator activator (CoAA) as TRBP-interacting protein, and its splice variant as a coactivator modulator (CoAM). J. Biol. Chem. 276: 33375—33383. PMID 11443112 DOI:10.1074/jbc.M101517200

Див. також

• Хромосома 20