NELFA

NELFA
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 5L3X
Ідентифікатори
Символи	NELFA, NELF-A, WHSC2, P/OKcl.15, negative elongation factor complex member A
Зовнішні ІД	OMIM: 606026 MGI: 1346098 HomoloGene: 68478 GeneCards: NELFA
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • клітинне ядро • нуклеоплазма • гіалоплазма • ядерні тільця • NELF complex Біологічний процес • multicellular organism development • transcription elongation from RNA polymerase II promoter • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • negative regulation of transcription elongation from RNA polymerase II promoter • positive regulation of viral transcription Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	7469	24116
Ensembl	ENSG00000185049	ENSMUSG00000029111
UniProt	Q9H3P2	Q8BG30
RefSeq (мРНК)	NM_005663	NM_011914
RefSeq (білок)	NP_005654	NP_036044
Локус (UCSC)	Хр. 4: 1.98 – 2.04 Mb	Хр. 5: 34.06 – 34.09 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

NELFA (англ. Negative elongation factor complex member A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 528 амінокислот, а молекулярна маса — 57 277.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MASMRESDTG		LWLHNKLGAT		DELWAPPSIA		SLLTAAVIDN		IRLCFHGLSS
AVKLKLLLGT		LHLPRRTVDE		MKGALMEIIQ		LASLDSDPWV		LMVADILKSF
PDTGSLNLEL		EEQNPNVQDI		LGELREKVGE		CEASAMLPLE		CQYLNKNALT
TLAGPLTPPV		KHFQLKRKPK		SATLRAELLQ		KSTETAQQLK		RSAGVPFHAK
GRGLLRKMDT		TTPLKGIPKQ		APFRSPTAPS		VFSPTGNRTP		IPPSRTLLRK
ERGVKLLDIS		ELDMVGAGRE		AKRRRKTLDA		EVVEKPAKEE		TVVENATPDY
AAGLVSTQKL		GSLNNEPALP		STSYLPSTPS		VVPASSYIPS		SETPPAPSSR
EASRPPEEPS		APSPTLPAQF		KQRAPMYNSG		LSPATPTPAA		PTSPLTPTTP
PAVAPTTQTP		PVAMVAPQTQ		APAQQQPKKN		LSLTREQMFA		AQEMFKTANK
VTRPEKALIL		GFMAGSRENP		CQEQGDVIQI		KLSEHTEDLP		KADGQGSTTM
LVDTVFEMNY		ATGQWTRFKK		YKPMTNVS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

• Wright T.J., Costa J.L., Naranjo C., Francis-West P., Altherr M.R. (1999). Comparative analysis of a novel gene from the Wolf-Hirschhorn/Pitt-Rogers-Danks syndrome critical region. Genomics. 59: 203—212. PMID 10409432 DOI:10.1006/geno.1999.5871
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Mariotti M., Manganini M., Maier J.A.M. (2000). Modulation of WHSC2 expression in human endothelial cells. FEBS Lett. 487: 166—170. PMID 11150502 DOI:10.1016/S0014-5793(00)02335-8
• Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240

Див. також

• Хромосома 4