NELFCD

NELFCD
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 5L3X
Ідентифікатори
Символи	NELFCD, NELF-C, NELF-D, TH1, TH1L, HSPC130, negative elongation factor complex member C/D
Зовнішні ІД	OMIM: 605297 MGI: 1926424 HomoloGene: 9496 GeneCards: NELFCD
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding Клітинна компонента • мембрана • NELF complex • клітинне ядро • нуклеоплазма Біологічний процес • transcription elongation from RNA polymerase II promoter • positive regulation of viral transcription • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • negative regulation of transcription elongation from RNA polymerase II promoter Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	51497	57314
Ensembl	ENSG00000101158	ENSMUSG00000016253
UniProt	Q8IXH7	Q922L6
RefSeq (мРНК)	NM_016397 NM_198976	NM_020580
RefSeq (білок)	NP_945327	NP_065605
Локус (UCSC)	Хр. 20: 58.98 – 59 Mb	Хр. 2: 174.26 – 174.27 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

NELFCD (англ. Negative elongation factor complex member C/D) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 590 амінокислот, а молекулярна маса — 66 247.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAGAVPGAIM		DEDYYGSAAE		WGDEADGGQQ		EDDSGEGEDD		AEVQQECLHK
FSTRDYIMEP		SIFNTLKRYF		QAGGSPENVI		QLLSENYTAV		AQTVNLLAEW
LIQTGVEPVQ		VQETVENHLK		SLLIKHFDPR		KADSIFTEEG		ETPAWLEQMI
AHTTWRDLFY		KLAEAHPDCL		MLNFTVKLIS		DAGYQGEITS		VSTACQQLEV
FSRVLRTSLA		TILDGGEENL		EKNLPEFAKM		VCHGEHTYLF		AQAMMSVLAQ
EEQGGSAVRR		IAQEVQRFAQ		EKGHDASQIT		LALGTAASYP		RACQALGAML
SKGALNPADI		TVLFKMFTSM		DPPPVELIRV		PAFLDLFMQS		LFKPGARINQ
DHKHKYIHIL		AYAASVVETW		KKNKRVSINK		DELKSTSKAV		ETVHNLCCNE
NKGASELVAE		LSTLYQCIRF		PVVAMGVLKW		VDWTVSEPRY		FQLQTDHTPV
HLALLDEIST		CHQLLHPQVL		QLLVKLFETE		HSQLDVMEQL		ELKKTLLDRM
VHLLSRGYVL		PVVSYIRKCL		EKLDTDISLI		RYFVTEVLDV		IAPPYTSDFV
QLFLPILEND		SIAGTIKTEG		EHDPVTEFIA		HCKSNFIMVN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до репресорів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Bonthron D.T., Hayward B.E., Moran V., Strain L. (2000). Characterization of TH1 and CTSZ, two non-imprinted genes downstream of GNAS1 in chromosome 20q13. Hum. Genet. 107: 165—175. PMID 11030415 DOI:10.1007/s004390000344
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Yin X.L., Chen S., Gu J.X. (2002). Identification of TH1 as an interaction partner of A-Raf kinase. Mol. Cell. Biochem. 231: 69—74. PMID 11952167 DOI:10.1023/A:1014437024129

Див. також

• Хромосома 20