NELFE

NELFE
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1X5P, 2BZ2, 2JX2
Ідентифікатори
Символи	NELFE, D6S45, NELF-E, RD, RDBP, RDP, negative elongation factor complex member E
Зовнішні ІД	OMIM: 154040 MGI: 102744 HomoloGene: 134736 GeneCards: NELFE
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleic acid binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • chromatin binding • RNA binding Клітинна компонента • клітинне ядро • нуклеоплазма • NELF complex • клітинна мембрана • ядерні тільця Біологічний процес • negative regulation of transcription elongation from RNA polymerase II promoter • positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade • positive regulation of viral transcription • transcription by RNA polymerase II • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • positive regulation of histone H3-K4 methylation • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of mRNA polyadenylation • transcription elongation from RNA polymerase II promoter • transcription, DNA-templated Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	7936	27632
Ensembl	ENSG00000229363 ENSG00000206357 ENSG00000231044 ENSG00000204356 ENSG00000206268 ENSG00000233801	ENSMUSG00000024369
UniProt	P18615	P19426
RefSeq (мРНК)	NM_002904	NM_001045863 NM_001045864 NM_138580
RefSeq (білок)	NP_002895	NP_001039328 NP_001039329 NP_613046
Локус (UCSC)	Хр. 6: 31.95 – 31.96 Mb	Хр. 17: 35.07 – 35.08 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

NELFE (англ. Negative elongation factor complex member E) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 380 амінокислот, а молекулярна маса — 43 240.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MLVIPPGLSE		EEEALQKKFN		KLKKKKKALL		ALKKQSSSST		TSQGGVKRSL
SEQPVMDTAT		ATEQAKQLVK		SGAISAIKAE		TKNSGFKRSR		TLEGKLKDPE
KGPVPTFQPF		QRSISADDDL		QESSRRPQRK		SLYESFVSSS		DRLRELGPDG
EEAEGPGAGD		GPPRSFDWGY		EERSGAHSSA		SPPRSRSRDR		SHERNRDRDR
DRERDRDRDR		DRDRERDRDR		DRDRDRDRER		DRDRERDRDR		DREGPFRRSD
SFPERRAPRK		GNTLYVYGED		MTPTLLRGAF		SPFGNIIDLS		MDPPRNCAFV
TYEKMESADQ		AVAELNGTQV		ESVQLKVNIA		RKQPMLDAAT		GKSVWGSLAV
QNSPKGCHRD		KRTQIVYSDD		VYKENLVDGF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Speiser P.W., White P.C. (1989). Structure of the human RD gene: a highly conserved gene in the class III region of the major histocompatibility complex. DNA. 8: 745—751. PMID 2612324 DOI:10.1089/dna.1989.8.745
• Cheng J., Macon K.J., Volanakis J.E. (1993). cDNA cloning and characterization of the protein encoded by RD, a gene located in the class III region of the human major histocompatibility complex. Biochem. J. 294: 589—593. PMID 8373374 DOI:10.1042/bj2940589
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Surowy C.S., Hoganson G., Gosink J., Strunk K., Spritz R.A. (1990). The human RD protein is closely related to nuclear RNA-binding proteins and has been highly conserved. Gene. 90: 299—302. PMID 2119325 DOI:10.1016/0378-1119(90)90194-V
• Yamaguchi Y., Inukai N., Narita T., Wada T., Handa H. (2002). Evidence that negative elongation factor represses transcription elongation through binding to a DRB sensitivity-inducing factor/RNA polymerase II complex and RNA. Mol. Cell. Biol. 22: 2918—2927. PMID 11940650 DOI:10.1128/MCB.22.9.2918-2927.2002
• Gocke C.B., Yu H., Kang J. (2005). Systematic identification and analysis of mammalian small ubiquitin-like modifier substrates. J. Biol. Chem. 280: 5004—5012. PMID 15561718 DOI:10.1074/jbc.M411718200

Див. також

• Хромосома 6