NOCT

NOCT
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 6MAL
Ідентифікатори
Символи	NOCT, CCR4L, Ccr4c, NOC, CCRN4L, nocturnin
Зовнішні ІД	OMIM: 608468 MGI: 109382 HomoloGene: 7661 GeneCards: NOCT
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • зв'язування з іоном металу • RNA binding • nuclease activity • exonuclease activity • hydrolase activity • poly(A)-specific ribonuclease activity • mRNA binding • 3'-5'-exoribonuclease activity Клітинна компонента • P-body • нуклеоплазма • цитоплазма • perinuclear region of cytoplasm • клітинне ядро • CCR4-NOT complex Біологічний процес • regulation of embryonic development • RNA phosphodiester bond hydrolysis, exonucleolytic • ритмічний процес • deadenylation-dependent decapping of nuclear-transcribed mRNA • mRNA processing • transcription by RNA polymerase II • P-body assembly • response to extracellular stimulus • response to lipopolysaccharide • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • циркадний ритм • regulation of circadian rhythm • negative regulation of osteoblast differentiation • mRNA stabilization • negative regulation of gene expression • positive regulation of fat cell differentiation • circadian regulation of gene expression • nucleic acid phosphodiester bond hydrolysis • nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	25819	12457
Ensembl	ENSG00000151014	ENSMUSG00000023087
UniProt	Q9UK39	O35710
RefSeq (мРНК)	NM_012118	NM_009834
RefSeq (білок)	NP_036250	NP_033964
Локус (UCSC)	Хр. 4: 139.02 – 139.05 Mb	Хр. 3: 51.13 – 51.16 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

NOCT (англ. Nocturnin) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 4-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 431 амінокислот, а молекулярна маса — 48 196.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MFHSPRRLCS		ALLQRDAPGL		RRLPAPGLRR		PLSPPAAVPR		PASPRLLAAA
SAASGAARSC		SRTVCSMGTG		TSRLYSALAK		TLNSSAASQH		PEYLVSPDPE
HLEPIDPKEL		LEECRAVLHT		RPPRFQRDFV		DLRTDCPSTH		PPIRVMQWNI
LAQALGEGKD		NFVQCPVEAL		KWEERKCLIL		EEILAYQPDI		LCLQEVDHYF
DTFQPLLSRL		GYQGTFFPKP		WSPCLDVEHN		NGPDGCALFF		LQNRFKLVNS
ANIRLTAMTL		KTNQVAIAQT		LECKESGRQF		CIAVTHLKAR		TGWERFRSAQ
GCDLLQNLQN		ITQGAKIPLI		VCGDFNAEPT		EEVYKHFASS		SLNLNSAYKL
LSADGQSEPP		YTTWKIRTSG		ECRHTLDYIW		YSKHALNVRS		ALDLLTEEQI
GPNRLPSFNY		PSDHLSLVCD		FSFTEESDGL		S

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, екзонуклеаз, нуклеаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, біологічні ритми. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном магнію, РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Dupressoir A., Barbot W., Loireau M.-P., Heidmann T. (1999). Characterization of a mammalian gene related to the yeast CCR4 general transcription factor and revealed by transposon insertion. J. Biol. Chem. 274: 31068—31075. PMID 10521507 DOI:10.1074/jbc.274.43.31068
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Stubblefield J.J., Terrien J., Green C.B. (2012). Nocturnin: at the crossroads of clocks and metabolism. Trends Endocrinol. Metab. 23: 326—333. PMID 22608110 DOI:10.1016/j.tem.2012.03.007

Див. також

• Хромосома 4