NPAT

NPAT
Ідентифікатори
Символи	NPAT, E14, E14/p220, nuclear protein, co-activator of histone transcription, nuclear protein, coactivator of histone transcription
Зовнішні ІД	OMIM: 601448 MGI: 107605 HomoloGene: 1888 GeneCards: NPAT
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001105 transcription coactivator activity • protein C-terminus binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001106 transcription corepressor activity • protein N-terminus binding • GO:0001104 transcription coregulator activity Клітинна компонента • цитоплазма • Тільце Кахаля • клітинне ядро • gemini of coiled bodies • нуклеоплазма Біологічний процес • регуляція експресії генів • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • клітинний цикл • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • regulation of transcription involved in G1/S transition of mitotic cell cycle • transcription, DNA-templated • negative regulation of nucleic acid-templated transcription Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	4863	244879
Ensembl	ENSG00000149308	ENSMUSG00000033054
UniProt	Q14207	Q8BMA5
RefSeq (мРНК)	NM_002519 NM_001321307	NM_001081152 NM_178905
RefSeq (білок)	NP_001308236 NP_002510	NP_001074621
Локус (UCSC)	Хр. 11: 108.16 – 108.22 Mb	Хр. 9: 53.45 – 53.49 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

NPAT (англ. Nuclear protein, coactivator of histone transcription) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 427 амінокислот, а молекулярна маса — 154 290.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MLLPSDVARL		VLGYLQQENL		ISTCQTFILE		SSDLKEYAEH		CTDEGFIPAC
LLSLFGKNLT		TILNEYVAMK		TKETSNNVPA		IMSSLWKKLD		HTLSQIRSMQ
SSPRFAGSQR		ARTRTGIAEI		KRQRKLASQT		APASAELLTL		PYLSGQFTTP
PSTGTQVTRP		SGQISDPSRS		YFVVVNHSQS		QDTVTTGEAL		NVIPGAQEKK
AHASLMSPGR		RKSESQRKST		TLSGPHSTIR		NFQDPNAFAV		EKQMVIENAR
EKILSNKSLQ		EKLAENINKF		LTSDNNIAQV		PKQTDNNPTE		PETSIDEFLG
LPSEIHMSEE		AIQDILEQTE		SDPAFQALFD		LFDYGKTKNN		KNISQSISSQ
PMESNPSIVL		ADETNLAVKG		SFETEESDGQ		SGQPAFCTSY		QNDDPLNALK
NSNNHDVLRQ		EDQENFSQIS		TSIQKKAFKT		AVPTEQKCDI		DITFESVPNL
NDFNQRGNSN		AECNPHCAEL		YTNQMSTETE		MAIGIEKNSL		SSNVPSESQL
QPDQPDIPIT		SFVSLGCEAN		NENLILSGKS		SQLLSQDTSL		TGKPSKKSQF
CENSNDTVKL		KINFHGSKSS		DSSEVHKSKI		EINVLEPVMS		QLSNCQDNSC
LQSEILPVSV		ESSHLNVSGQ		VEIHLGDSLS		STKQPSNDSA		SVELNHTENE
AQASKSENSQ		EPSSSVKEEN		TIFLSLGGNA		NCEKVALTPP		EGTPVENSHS
LPPESVCSSV		GDSHPESQNT		DDKPSSNNSA		EIDASNIVSL		KVIISDDPFV
SSDTELTSAV		SSINGENLPT		IILSSPTKSP		TKNAELVKCL		SSEETVGAVV
YAEVGDSASM		EQSLLTFKSE		DSAVNNTQNE		DGIAFSANVT		PCVSKDGGYI
QLMPATSTAF		GNSNNILIAT		CVTDPTALGT		SVSQSNVVVL		PGNSAPMTAQ
PLPPQLQTPP		RSNSVFAVNQ		AVSPNFSQGS		AIIIASPVQP		VLQGMVGMIP
VSVVGQNGNN		FSTPPRQVLH		MPLTAPVCNR		SIPQFPVPPK		SQKAQGLRNK
PCIGKQVNNL		VDSSGHSVGC		HAQKTEVSDK		SIATDLGKKS		EETTVPFPEE
SIVPAAKPCH		RRVLCFDSTT		APVANTQGPN		HKMVSQNKER		NAVSFPNLDS
PNVSSTLKPP		SNNAIKREKE		KPPLPKILSK		SESAISRHTT		IRETQSEKKV
SPTEIVLESF		HKATANKENE		LCSDVERQKN		PENSKLSIGQ		QNGGLRSEKS
IASLQEMTKK		QGTSSNNKNV		LSVGTAVKDL		KQEQTKSASS		LITTEMLQDI
QRHSSVSRLA		DSSDLPVPRT		PGSGAGEKHK		EEPIDIIKAP		SSRRFSEDSS
TSKVMVPPVT		PDLPACSPAS		ETGSENSVNM		AAHTLMILSR		AAISRTTSAT
PLKDNTQQFR		ASSRSTTKKR		KIEELDERER		NSRPSSKNLT		NSSIPMKKKK
IKKKKLPSSF		PAGMDVDKFL		LSLHYDE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, клітинний цикл, ацетилювання. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Zhao J., Dynlacht B., Imai T., Hori T., Harlow E. (1998). Expression of NPAT, a novel substrate of cyclin E-CDK2, promotes S-phase entry. Genes Dev. 12: 456—461. PMID 9472014 DOI:10.1101/gad.12.4.456
• Kim W.-J., Vo Q.N., Shrivastav M., Lataxes T.A., Brown K.D. (2002). Aberrant methylation of the ATM promoter correlates with increased radiosensitivity in a human colorectal tumor cell line. Oncogene. 21: 3864—3871. PMID 12032824 DOI:10.1038/sj.onc.1205485
• Zheng L., Roeder R.G., Luo Y. (2003). S phase activation of the histone H2B promoter by OCA-S, a coactivator complex that contains GAPDH as a key component. Cell. 114: 255—266. PMID 12887926 DOI:10.1016/S0092-8674(03)00552-X
• Wei Y., Jin J., Harper J.W. (2003). The cyclin E/Cdk2 substrate and Cajal body component p220(NPAT) activates histone transcription through a novel LisH-like domain. Mol. Cell. Biol. 23: 3669—3680. PMID 12724424 DOI:10.1128/MCB.23.10.3669-3680.2003
• Ye X., Wei Y., Nalepa G., Harper J.W. (2003). The cyclin E/Cdk2 substrate p220(NPAT) is required for S-phase entry, histone gene expression, and Cajal body maintenance in human somatic cells. Mol. Cell. Biol. 23: 8586—8600. PMID 14612403 DOI:10.1128/MCB.23.23.8586-8600.2003

Див. також

• Хромосома 11