NSD3

NSD3
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2DAQ, 4GND, 4GNE, 4GNF, 4GNG, 4RXJ, 4YZ8, 2ND1, 2NCZ
Ідентифікатори
Символи	NSD3, pp14328, WHSC1L1, WHISTLE, Wolf-Hirschhorn syndrome candidate 1-like 1, nuclear receptor binding SET domain protein 3, KMT3G, KMT3F
Зовнішні ІД	OMIM: 607083 MGI: 2142581 HomoloGene: 56960 GeneCards: NSD3
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0102674, GO:0102675 methyltransferase activity • transferase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • histone-lysine N-methyltransferase activity • GO:0001105 transcription coactivator activity • histone methyltransferase activity (H3-K36 specific) Клітинна компонента • клітинне ядро • нуклеоплазма • хромосома • Хроматин Біологічний процес • histone methylation • Метилювання • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • histone lysine methylation • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of histone H3-K36 trimethylation • histone H3-K36 methylation Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	54904	234135
Ensembl	ENSG00000147548	ENSMUSG00000054823
UniProt	Q9BZ95	Q6P2L6
RefSeq (мРНК)	NM_017778 NM_023034	NM_001001735 NM_001081269 NM_001308481 NM_001308482
RefSeq (білок)	NP_060248 NP_075447	NP_001001735 NP_001074738 NP_001295410 NP_001295411
Локус (UCSC)	Хр. 8: 38.27 – 38.38 Mb	Хр. 8: 26.09 – 26.21 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

NSD3 (англ. Nuclear receptor binding SET domain protein 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 437 амінокислот, а молекулярна маса — 161 613.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDFSFSFMQG		IMGNTIQQPP		QLIDSANIRQ		EDAFDNNSDI		AEDGGQTPYE
ATLQQGFQYP		ATTEDLPPLT		NGYPSSISVY		ETQTKYQSYN		QYPNGSANGF
GAVRNFSPTD		YYHSEIPNTR		PHEILEKPSP		PQPPPPPSVP		QTVIPKKTGS
PEIKLKITKT		IQNGRELFES		SLCGDLLNEV		QASEHTKSKH		ESRKEKRKKS
NKHDSSRSEE		RKSHKIPKLE		PEEQNRPNER		VDTVSEKPRE		EPVLKEEAPV
QPILSSVPTT		EVSTGVKFQV		GDLVWSKVGT		YPWWPCMVSS		DPQLEVHTKI
NTRGAREYHV		QFFSNQPERA		WVHEKRVREY		KGHKQYEELL		AEATKQASNH
SEKQKIRKPR		PQRERAQWDI		GIAHAEKALK		MTREERIEQY		TFIYIDKQPE
EALSQAKKSV		ASKTEVKKTR		RPRSVLNTQP		EQTNAGEVAS		SLSSTEIRRH
SQRRHTSAEE		EEPPPVKIAW		KTAAARKSLP		ASITMHKGSL		DLQKCNMSPV
VKIEQVFALQ		NATGDGKFID		QFVYSTKGIG		NKTEISVRGQ		DRLIISTPNQ
RNEKPTQSVS		SPEATSGSTG		SVEKKQQRRS		IRTRSESEKS		TEVVPKKKIK
KEQVETVPQA		TVKTGLQKGA		SEISDSCKPL		KKRSRASTDV		EMTSSAYRDT
SDSDSRGLSD		LQVGFGKQVD		SPSATADADV		SDVQSMDSSL		SRRGTGMSKK
DTVCQICESS		GDSLIPCEGE		CCKHFHLECL		GLASLPDSKF		ICMECKTGQH
PCFSCKVSGK		DVKRCSVGAC		GKFYHEACVR		KFPTAIFESK		GFRCPQHCCS
ACSMEKDIHK		ASKGRMMRCL		RCPVAYHSGD		ACIAAGSMLV		SSYILICSNH
SKRSSNSSAV		NVGFCFVCAR		GLIVQDHSDP		MFSSYAYKSH		YLLNESNRAE
LMKLPMIPSS		SASKKKCEKG		GRLLCCESCP		ASFHPECLSI		EMPEGCWNCN
DCKAGKKLHY		KQIVWVKLGN		YRWWPAEICN		PRSVPLNIQG		LKHDLGDFPV
FFFGSHDYYW		VHQGRVFPYV		EGDKSFAEGQ		TSINKTFKKA		LEEAAKRFQE
LKAQRESKEA		LEIEKNSRKP		PPYKHIKANK		VIGKVQIQVA		DLSEIPRCNC
KPADENPCGL		ESECLNRMLQ		YECHPQVCPA		GDRCQNQCFT		KRLYPDAEII
KTERRGWGLR		TKRSIKKGEF		VNEYVGELID		EEECRLRIKR		AHENSVTNFY
MLTVTKDRII		DAGPKGNYSR		FMNHSCNPNC		ETQKWTVNGD		VRVGLFALCD
IPAGMELTFN		YNLDCLGNGR		TECHCGADNC		SGFLGVRPKS		ACASTNEEKA
KNAKLKQKRR		KIKTEPKQMH		EDYCFQCGDG		GELVMCDKKD		CPKAYHLLCL
NLTQPPYGKW		ECPWHQCDEC		SSAAVSFCEF		CPHSFCKDHE		KGALVPSALE
GRLCCSEHDP		MAPVSPEYWS		KIKCKWESQD		HGEEVKE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, регуляторів хроматину, метилтрансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, S-аденозил-L-метіоніном. Локалізований у ядрі, хромосомах.

Література

• Stec I., van Ommen G.-J.B., den Dunnen J.T. (2001). WHSC1L1, on human chromosome 8p11.2, closely resembles WHSC1 and maps to a duplicated region shared with 4p16.3. Genomics. 76: 5—8. PMID 11549311 DOI:10.1006/geno.2001.6581
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep. 10: 1778—1791. PMID 25772364 DOI:10.1016/j.celrep.2015.02.033

Див. також

• Хромосома 8