NT5M

NT5M
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1MH9, 1Q91, 1Q92, 1Z4I, 1Z4J, 1Z4K, 1Z4L, 1Z4M, 1Z4P, 1Z4Q, 2JAU, 2JAW, 4L6A, 4L6C, 4MUM, 4MWO, 4NFL, 4YIK
Ідентифікатори
Символи	NT5M, dNT-2, dNT2, mdN, 5',3'-nucleotidase, mitochondrial
Зовнішні ІД	OMIM: 605292 MGI: 1917127 HomoloGene: 10622 GeneCards: NT5M
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleotide binding • nucleotidase activity • 5'-nucleotidase activity • hydrolase activity • зв'язування з іоном металу Клітинна компонента • мітохондріальний матрикс • мітохондрія Біологічний процес • pyrimidine deoxyribonucleotide catabolic process • реплікація ДНК • dUMP catabolic process • deoxyribonucleotide catabolic process • nucleotide metabolic process • pyrimidine nucleoside catabolic process • GO:0098501, GO:0098502, GO:0006286 дефосфорилювання Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	56953	103850
Ensembl	ENSG00000205309	ENSMUSG00000032615
UniProt	Q9NPB1	Q8VCE6
RefSeq (мРНК)	NM_020201	NM_134029
RefSeq (білок)	NP_064586	NP_598790
Локус (UCSC)	Хр. 17: 17.3 – 17.35 Mb	Хр. 11: 59.73 – 59.77 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

NT5M (англ. 5',3'-nucleotidase, mitochondrial) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 228 амінокислот, а молекулярна маса — 25 862.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MIRLGGWCAR		RLCSAAVPAG		RRGAAGGLGL		AGGRALRVLV		DMDGVLADFE
GGFLRKFRAR		FPDQPFIALE		DRRGFWVSEQ		YGRLRPGLSE		KAISIWESKN
FFFELEPLPG		AVEAVKEMAS		LQNTDVFICT		SPIKMFKYCP		YEKYAWVEKY
FGPDFLEQIV		LTRDKTVVSA		DLLIDDRPDI		TGAEPTPSWE		HVLFTACHNQ
HLQLQPPRRR		LHSWADDWKA		ILDSKRPC

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до гідролаз. Задіяний у такому біологічному процесі, як метаболізм нуклеотидів. Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами, іонами металів, іоном магнію. Локалізований у мітохондрії.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Rinaldo-Matthis A., Rampazzo C., Reichard P., Bianchi V., Nordlund P. (2002). Crystal structure of a human mitochondrial deoxyribonucleotidase. Nat. Struct. Biol. 9: 779—787. PMID 12352955 DOI:10.1038/nsb846

Див. також

• Хромосома 17