NUDT5

NUDT5
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2DSB, 2DSC, 2DSD, 3AC9, 3ACA, 3BM4, 3L85
Ідентифікатори
Символи	NUDT5, YSA1, YSA1H, YSAH1, hYSAH1, nudix hydrolase 5, hNUDT5
Зовнішні ІД	OMIM: 609230 MGI: 1858232 HomoloGene: 5388 GeneCards: NUDT5
шифр КФ	3.6.1.58
Онтологія гена Молекулярна функція • m7G(5')pppN diphosphatase activity • hydrolase activity • magnesium ion binding • зв'язування з іоном металу • nucleoside-diphosphatase activity • RNA binding • ADP-sugar diphosphatase activity • snoRNA binding • 8-oxo-dGDP phosphatase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • transferase activity • ADP-ribose diphosphatase activity • protein homodimerization activity • nucleotidyltransferase activity Клітинна компонента • гіалоплазма • екзосома • внутрішньоклітинний • клітинне ядро Біологічний процес • nucleobase-containing small molecule catabolic process • ribonucleoside diphosphate catabolic process • nucleobase-containing compound metabolic process • nucleotide metabolic process • D-ribose catabolic process • ремоделювання хроматину • ATP generation from poly-ADP-D-ribose • nucleoside phosphate metabolic process • ribose phosphate metabolic process Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	11164	53893
Ensembl	ENSG00000165609	ENSMUSG00000025817
UniProt	Q9UKK9	Q9JKX6
RefSeq (мРНК)	NM_014142 NM_001321647 NM_001321648	NM_016918
RefSeq (білок)	NP_001308576 NP_001308577 NP_054861	NP_058614
Локус (UCSC)	Хр. 10: 12.17 – 12.2 Mb	Хр. 2: 5.85 – 5.87 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

NUDT5 (англ. Nudix hydrolase 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 219 амінокислот, а молекулярна маса — 24 328.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MESQEPTESS		QNGKQYIISE		ELISEGKWVK		LEKTTYMDPT		GKTRTWESVK
RTTRKEQTAD		GVAVIPVLQR		TLHYECIVLV		KQFRPPMGGY		CIEFPAGLID
DGETPEAAAL		RELEEETGYK		GDIAECSPAV		CMDPGLSNCT		IHIVTVTING
DDAENARPKP		KPGDGEFVEV		ISLPKNDLLQ		RLDALVAEEH		LTVDARVYSY
ALALKHANAK		PFEVPFLKF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, гідролаз, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном магнію, РНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Gasmi L., Cartwright J.L., McLennan A.G. (1999). Cloning, expression and characterization of YSA1H, a human adenosine 5'-diphosphosugar pyrophosphatase possessing a MutT motif. Biochem. J. 344: 331—337. PMID 10567213 DOI:10.1042/bj3440331
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Zha M., Zhong C., Peng Y., Hu H., Ding J. (2006). Crystal structures of human NUDT5 reveal insights into the structural basis of the substrate specificity. J. Mol. Biol. 364: 1021—1033. PMID 17052728 DOI:10.1016/j.jmb.2006.09.078

Див. також

• Хромосома 10