NUP62

NUP62
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 5IJN, 5IJO
Ідентифікатори
Символи	NUP62, IBSN, SNDI, p62, nucleoporin 62kDa, nucleoporin 62
Зовнішні ІД	OMIM: 605815 MGI: 1351500 HomoloGene: 68773 GeneCards: NUP62
Реагує на сполуку
Viroporin 3a
Онтологія гена Молекулярна функція • Hsp90 protein binding • SH2 domain binding • chromatin binding • thyroid hormone receptor binding • PTB domain binding • Hsp70 protein binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ubiquitin binding • signaling receptor complex adaptor activity • GO:0005487 structural constituent of nuclear pore • phospholipid binding • kinesin binding Клітинна компонента • Ядерна мембрана • Flemming body • Ядерна пора • lamellae anulatae • Цитоскелет • nuclear pore central transport channel • spindle pole • цитоплазма • центросома • mitotic spindle • nuclear envelope • Центр організації мікротрубочок • клітинне ядро • GO:0009327 protein-containing complex • Рибонуклеопротеїни • host cell Біологічний процес • mRNA transport • negative regulation of epidermal growth factor receptor signaling pathway • regulation of Ras protein signal transduction • смерть клітини • negative regulation of apoptotic process • transcription, DNA-templated • negative regulation of Ras protein signal transduction • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • cell surface receptor signaling pathway • regulation of signal transduction • negative regulation of MAP kinase activity • Сперматогенез • regulation of protein import into nucleus • hormone-mediated signaling pathway • positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • protein transport • negative regulation of programmed cell death • nuclear transport • GO:0022415 viral process • positive regulation of epidermal growth factor receptor signaling pathway • negative regulation of cell population proliferation • protein import into nucleus • mRNA export from nucleus • mitotic metaphase plate congression • mitotic centrosome separation • positive regulation of mitotic nuclear division • positive regulation of centriole replication • regulation of mitotic spindle organization • centriole assembly • positive regulation of mitotic cytokinetic process • positive regulation of protein localization to centrosome • centrosome cycle • GO:0007067 мітоз • protein heterotrimerization • regulation of glycolytic process • tRNA export from nucleus • protein sumoylation • viral transcription • GO:1905616 regulation of gene silencing by miRNA • GO:0046795 intracellular transport of virus • regulation of cellular response to heat Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	23636	18226
Ensembl	ENSG00000213024	ENSMUSG00000109511
UniProt	P37198	Q63850
RefSeq (мРНК)	NM_153719 NM_001193357 NM_012346 NM_016553 NM_153718	NM_053074
RefSeq (білок)	NP_001180286 NP_036478 NP_057637 NP_714940 NP_714941	NP_444304
Локус (UCSC)	Хр. 19: 49.91 – 49.93 Mb	Хр. 7: 44.47 – 44.48 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

NUP62 (англ. Nucleoporin 62) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 522 амінокислот, а молекулярна маса — 53 255.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSGFNFGGTG		APTGGFTFGT		AKTATTTPAT		GFSFSTSGTG		GFNFGAPFQP
ATSTPSTGLF		SLATQTPATQ		TTGFTFGTAT		LASGGTGFSL		GIGASKLNLS
NTAATPAMAN		PSGFGLGSSN		LTNAISSTVT		SSQGTAPTGF		VFGPSTTSVA
PATTSGGFSF		TGGSTAQPSG		FNIGSAGNSA		QPTAPATLPF		TPATPAATTA
GATQPAAPTP		TATITSTGPS		LFASIATAPT		SSATTGLSLC		TPVTTAGAPT
AGTQGFSLKA		PGAASGTSTT		TSTAATATAT		TTSSSSTTGF		ALNLKPLAPA
GIPSNTAAAV		TAPPGPGAAA		GAAASSAMTY		AQLESLINKW		SLELEDQERH
FLQQATQVNA		WDRTLIENGE		KITSLHREVE		KVKLDQKRLD		QELDFILSQQ
KELEDLLSPL		EELVKEQSGT		IYLQHADEER		EKTYKLAENI		DAQLKRMAQD
LKDIIEHLNT		SGAPADTSDP		LQQICKILNA		HMDSLQWIDQ		NSALLQRKVE
EVTKVCEGRR		KEQERSFRIT		FD

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, транспорт, транспорт білків, транспорт мРНК, транслокація, ацетилювання. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі, комплексі ядерної пори.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Kose S., Furuta M., Imamoto N. (2012). Hikeshi, a nuclear import carrier for hsp70s, protects cells from heat shock-induced nuclear damage. Cell. 149: 578—589. PMID 22541429 DOI:10.1016/j.cell.2012.02.058
• Carmo-Fonseca M., Kern H., Hurt E.C. (1991). Human nucleoporin p62 and the essential yeast nuclear pore protein NSP1 show sequence homology and a similar domain organization. Eur. J. Cell Biol. 55: 17—30. PMID 1915414

Див. також

• Хромосома 19