NXF1

NXF1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4WYK, 1FO1, 1FT8, 1GO5, 1JKG, 1JN5, 1KOH, 1KOO, 1OAI, 2Z5K, 2Z5M, 3RW6, 3RW7
Ідентифікатори
Символи	NXF1, MEX67, TAP, nuclear RNA export factor 1
Зовнішні ІД	OMIM: 602647 MGI: 1858330 HomoloGene: 38176 GeneCards: NXF1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • single-stranded RNA binding • mRNA binding • GO:0005487 structural constituent of nuclear pore • nucleic acid binding • RNA binding Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • nuclear speck • transcription export complex • Ядерна пора • внутрішньоклітинний • nuclear inclusion body • клітинне ядро • нуклеоплазма • nuclear envelope Біологічний процес • mRNA transport • mRNA export from nucleus • poly(A)+ mRNA export from nucleus • GO:0022415 viral process • RNA export from nucleus • GO:0015915 транспорт • protein transport Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10482	53319
Ensembl	ENSG00000162231	ENSMUSG00000010097
UniProt	Q9UBU9	Q99JX7
RefSeq (мРНК)	NM_006362 NM_001081491	NM_001276704 NM_016813
RefSeq (білок)	NP_001074960 NP_006353	NP_001263633 NP_058093
Локус (UCSC)	Хр. 11: 62.79 – 62.81 Mb	Хр. 19: 8.73 – 8.75 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

NXF1 (англ. Nuclear RNA export factor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 619 амінокислот, а молекулярна маса — 70 182.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MADEGKSYSE		HDDERVNFPQ		RKKKGRGPFR		WKYGEGNRRS		GRGGSGIRSS
RLEEDDGDVA		MSDAQDGPRV		RYNPYTTRPN		RRGDTWHDRD		RIHVTVRRDR
APPERGGAGT		SQDGTSKNWF		KITIPYGRKY		DKAWLLSMIQ		SKCSVPFTPI
EFHYENTRAQ		FFVEDASTAS		ALKAVNYKIL		DRENRRISII		INSSAPPHTI
LNELKPEQVE		QLKLIMSKRY		DGSQQALDLK		GLRSDPDLVA		QNIDVVLNRR
SCMAATLRII		EENIPELLSL		NLSNNRLYRL		DDMSSIVQKA		PNLKILNLSG
NELKSERELD		KIKGLKLEEL		WLDGNSLCDT		FRDQSTYISA		IRERFPKLLR
LDGHELPPPI		AFDVEAPTTL		PPCKGSYFGT		ENLKSLVLHF		LQQYYAIYDS
GDRQGLLDAY		HDGACCSLSI		PFIPQNPARS		SLAEYFKDSR		NVKKLKDPTL
RFRLLKHTRL		NVVAFLNELP		KTQHDVNSFV		VDISAQTSTL		LCFSVNGVFK
EVDGKSRDSL		RAFTRTFIAV		PASNSGLCIV		NDELFVRNAS		SEEIQRAFAM
PAPTPSSSPV		PTLSPEQQEM		LQAFSTQSGM		NLEWSQKCLQ		DNNWDYTRSA
QAFTHLKAKG		EIPEVAFMK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, транспорт, транспорт мРНК, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Braun I.C., Rohrbach E., Schmitt C., Izaurralde E. (1999). TAP binds to the constitutive transport element (CTE) through a novel RNA-binding motif that is sufficient to promote CTE-dependent RNA export from the nucleus. EMBO J. 18: 1953—1965. PMID 10202158 DOI:10.1093/emboj/18.7.1953
• Kang Y., Cullen B.R. (1999). The human Tap protein is a nuclear mRNA export factor that contains novel RNA-binding and nucleocytoplasmic transport sequences. Genes Dev. 13: 1126—1139. PMID 10323864 DOI:10.1101/gad.13.9.1126
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Braun I.C., Herold A., Rode M., Conti E., Izaurralde E. (2001). Overexpression of TAP/p15 heterodimers bypasses nuclear retention and stimulates nuclear mRNA export. J. Biol. Chem. 276: 20536—20543. PMID 11259411 DOI:10.1074/jbc.M100400200
• Kataoka N., Diem M.D., Kim V.N., Yong J., Dreyfuss G. (2001). Magoh, a human homolog of Drosophila mago nashi protein, is a component of the splicing-dependent exon-exon junction complex. EMBO J. 20: 6424—6433. PMID 11707413 DOI:10.1093/emboj/20.22.6424
• Kim V.N., Kataoka N., Dreyfuss G. (2001). Role of the nonsense-mediated decay factor hUpf3 in the splicing-dependent exon-exon junction complex. Science. 293: 1832—1836. PMID 11546873 DOI:10.1126/science.1062829

Див. також

• Хромосома 11