PAPOLG

PAPOLG
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4LT6
Ідентифікатори
Символи	PAPOLG, poly(A) polymerase gamma
Зовнішні ІД	OMIM: 616865 MGI: 2442119 HomoloGene: 56959 GeneCards: PAPOLG
Онтологія гена Молекулярна функція • transferase activity • nucleotide binding • nucleotidyltransferase activity • polynucleotide adenylyltransferase activity • ATP binding • зв'язування з іоном металу • RNA binding Клітинна компонента • мембрана • клітинне ядро • Нуклеоплазма • гіалоплазма • Ядерні тільця Біологічний процес • mRNA polyadenylation • mRNA processing • RNA polyadenylation • RNA 3'-end processing Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	64895	216578
Ensembl	ENSG00000115421	ENSMUSG00000020273
UniProt	Q9BWT3	Q6PCL9
RefSeq (мРНК)	NM_022894	NM_172555
RefSeq (білок)	NP_075045	NP_766143
Локус (UCSC)	Хр. 2: 60.76 – 60.8 Mb	Хр. 11: 23.81 – 23.85 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PAPOLG (англ. Poly(A) polymerase gamma) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 736 амінокислот, а молекулярна маса — 82 803.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MKEMSANTVL		DSQRQQKHYG		ITSPISLASP		KEIDHIYTQK		LIDAMKPFGV
FEDEEELNHR		LVVLGKLNNL		VKEWISDVSE		SKNLPPSVVA		TVGGKIFTFG
SYRLGVHTKG		ADIDALCVAP		RHVERSDFFQ		SFFEKLKHQD		GIRNLRAVED
AFVPVIKFEF		DGIEIDLVFA		RLAIQTISDN		LDLRDDSRLR		SLDIRCIRSL
NGCRVTDEIL		HLVPNKETFR		LTLRAVKLWA		KRRGIYSNML		GFLGGVSWAM
LVARTCQLYP		NAAASTLVHK		FFLVFSKWEW		PNPVLLKQPE		ESNLNLPVWD
PRVNPSDRYH		LMPIITPAYP		QQNSTYNVST		STRTVMVEEF		KQGLAVTDEI
LQGKSDWSKL		LEPPNFFQKY		RHYIVLTASA		STEENHLEWV		GLVESKIRVL
VGNLERNEFI		TLAHVNPQSF		PGNKEHHKDN		NYVSMWFLGI		IFRRVENAES
VNIDLTYDIQ		SFTDTVYRQA		NNINMLKEGM		KIEATHVKKK		QLHHYLPAEI
LQKKKKQSLS		DVNRSSGGLQ		SKRLSLDSSC		LDSSRDTDNG		TPFNSPASKS
DSPSVGETER		NSAEPAAVIV		EKPLSVPPAQ		GLSIPVIGAK		VDSTVKTVSP
PTVCTIPTVV		GRNVIPRITT		PHNPAQGQPH		LNGMSNITKT		VTPKRSHSPS
IDGTPKRLKD		VEKFIRLEST		FKDPRTAEER		KRKSVDAIGG		ESMPIPTIDT
SRKKRLPSKE		LPDSSSPVPA		NNIRVIKNSI		RLTLNR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як процесінг мРНК, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, іонами металів, іоном магнію, РНК, іоном марганцю. Локалізований у ядрі.

Література

• Perumal K., Sinha K., Henning D., Reddy R. (2001). Purification, characterization, and cloning of the cDNA of human signal recognition particle RNA 3'-adenylating enzyme. J. Biol. Chem. 276: 21791—21796. PMID 11287430 DOI:10.1074/jbc.M101905200
• Kyriakopoulou C.B., Nordvarg H., Virtanen A. (2001). A novel nuclear human poly(A) polymerase (PAP), PAP gamma. J. Biol. Chem. 276: 33504—33511. PMID 11431479 DOI:10.1074/jbc.M104599200
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Yang Q., Nausch L., Martin G., Keller W., Doublie S. (2014). Crystal structure of human poly(A) polymerase gamma reveals a conserved catalytic core for canonical poly(A) polymerases. J. Mol. Biol. 426: 43—50. PMID 24076191 DOI:10.1016/j.jmb.2013.09.025

Див. також

• Хромосома 2