PATZ1

PATZ1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2EPP, 2EPQ, 2EPR, 2EPS, 2YT9
Ідентифікатори
Символи	PATZ1, MAZR, PATZ, RIAZ, ZBTB19, ZNF278, ZSG, dJ400N23, POZ/BTB and AT hook containing zinc finger 1
Зовнішні ІД	OMIM: 605165 MGI: 1891832 HomoloGene: 8636 GeneCards: PATZ1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • chromatin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • nucleic acid binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • клітинне ядро • нуклеоплазма Біологічний процес • регуляція експресії генів • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • T cell differentiation • male gonad development • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription by RNA polymerase II • Сперматогенез • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	23598	56218
Ensembl	ENSG00000100105	ENSMUSG00000020453
UniProt	Q9HBE1	Q5NBY9
RefSeq (мРНК)	NM_032052 NM_014323 NM_032050 NM_032051	NM_001253690 NM_001253691 NM_019574
RefSeq (білок)	NP_055138 NP_114439 NP_114440 NP_114441	NP_001240619 NP_001240620 NP_062520
Локус (UCSC)	Хр. 22: 31.33 – 31.35 Mb	Хр. 11: 3.24 – 3.26 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PATZ1 (англ. POZ/BTB and AT hook containing zinc finger 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 687 амінокислот, а молекулярна маса — 74 060.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MERVNDASCG		PSGCYTYQVS		RHSTEMLHNL		NQQRKNGGRF		CDVLLRVGDE
SFPAHRAVLA		ACSEYFESVF		SAQLGDGGAA		DGGPADVGGA		TAAPGGGAGG
SRELEMHTIS		SKVFGDILDF		AYTSRIVVRL		ESFPELMTAA		KFLLMRSVIE
ICQEVIKQSN		VQILVPPARA		DIMLFRPPGT		SDLGFPLDMT		NGAALAANSN
GIAGSMQPEE		EAARAAGAAI		AGQASLPVLP		GVDRLPMVAG		PLSPQLLTSP
FPSVASSAPP		LTGKRGRGRP		RKANLLDSMF		GSPGGLREAG		ILPCGLCGKV
FTDANRLRQH		EAQHGVTSLQ		LGYIDLPPPR		LGENGLPISE		DPDGPRKRSR
TRKQVACEIC		GKIFRDVYHL		NRHKLSHSGE		KPYSCPVCGL		RFKRKDRMSY
HVRSHDGSVG		KPYICQSCGK		GFSRPDHLNG		HIKQVHTSER		PHKCQTCNAS
FATRDRLRSH		LACHEDKVPC		QVCGKYLRAA		YMADHLKKHS		EGPSNFCSIC
NRGFSSASYL		KVHVKTHHGV		PLPQVSRHQE		PILNGGAAFH		CARTYGNKEG
QKCSHQDPIE		SSDSYGDLSD		ASDLKTPEKQ		SANGSFSCDM		AVPKNKMESD
GEKKYPCPEC		GSFFRSKSYL		NKHIQKVHVR		ALGGPLGDLG		PALGSPFSPQ
QNMSLLESFG		FQIVQSAFAS		SLVDPEVDQQ		PMGPEGK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 22