PCGF5

PCGF5
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4S3O
Ідентифікатори
Символи	PCGF5, RNF159, polycomb group ring finger 5
Зовнішні ІД	OMIM: 617407 MGI: 1923505 HomoloGene: 12632 GeneCards: PCGF5
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity Клітинна компонента • центросома • ядерце • клітинне ядро • нуклеоплазма • X-хромосома • PcG protein complex • PRC1 complex Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • histone H2A-K119 monoubiquitination • inactivation of X chromosome by genetic imprinting Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	84333	76073
Ensembl	ENSG00000180628	ENSMUSG00000024805
UniProt	Q86SE9	Q3UK78
RefSeq (мРНК)	NM_001256549 NM_001257101 NM_032373	NM_029508 NM_001368690 NM_001368691 NM_001368692 NM_001368693
RefSeq (білок)	NP_001243478 NP_001244030 NP_115749	NP_083784 NP_001355619 NP_001355620 NP_001355621 NP_001355622
Локус (UCSC)	Хр. 10: 91.16 – 91.28 Mb	Хр. 19: 36.33 – 36.44 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PCGF5 (англ. Polycomb group ring finger 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 256 амінокислот, а молекулярна маса — 29 714.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MATQRKHLVK		DFNPYITCYI		CKGYLIKPTT		VTECLHTFCK		TCIVQHFEDS
NDCPRCGNQV		HETNPLEMLR		LDNTLEEIIF		KLVPGLREQE		LERESEFWKK
NKPQENGQDD		TSKADKPKVD		EEGDENEDDK		DYHRSDPQIA		ICLDCLRNNG
QSGDNVVKGL		MKKFIRCSTR		VTVGTIKKFL		SLKLKLPSSY		ELDVLCNGEI
MGKDHTMEFI		YMTRWRLRGE		NFRCLNCSAS		QVCSQDGPLY		QSYPMVLQYR
PRIDFG

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до репресорів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Vandamme J., Volkel P., Rosnoblet C., Le Faou P., Angrand P.O. (2011). Interaction proteomics analysis of polycomb proteins defines distinct PRC1 Complexes in mammalian cells. Mol. Cell. Proteomics: —. PMID 21282530 DOI:10.1074/mcp.M110.002642

Див. також

• Хромосома 10