PCGF6

PCGF6
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2DJB
Ідентифікатори
Символи	PCGF6, MBLR, RNF134, polycomb group ring finger 6
Зовнішні ІД	OMIM: 607816 MGI: 1918291 HomoloGene: 12378 GeneCards: PCGF6
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • DNA binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • зв'язування з іоном металу Клітинна компонента • клітинне ядро • PcG protein complex • нуклеоплазма • PRC1 complex Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • histone H2A-K119 monoubiquitination • negative regulation of G0 to G1 transition • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • inactivation of X chromosome by genetic imprinting Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	84108	71041
Ensembl	ENSG00000156374	ENSMUSG00000025050
UniProt	Q9BYE7	Q99NA9
RefSeq (мРНК)	NM_001011663 NM_032154	NM_027654 NM_001360632
RefSeq (білок)	NP_001011663 NP_115530	NP_081930 NP_001347561
Локус (UCSC)	Хр. 10: 103.3 – 103.35 Mb	Хр. 19: 47.02 – 47.04 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PCGF6 (англ. Polycomb group ring finger 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 350 амінокислот, а молекулярна маса — 39 047.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEGVAVVTAG		SVGAAKTEGA		AALPPPPPVS		PPALTPAPAA		GEEGPAPLSE
TGAPGCSGSR		PPELEPERSL		GRFRGRFEDE		DEELEEEEEL		EEEEEEEEED
MSHFSLRLEG		GRQDSEDEEE		RLINLSELTP		YILCSICKGY		LIDATTITEC
LHTFCKSCIV		RHFYYSNRCP		KCNIVVHQTQ		PLYNIRLDRQ		LQDIVYKLVI
NLEEREKKQM		HDFYKERGLE		VPKPAVPQPV		PSSKGRSKKV		LESVFRIPPE
LDMSLLLEFI		GANEGTGHFK		PLEKKFVRVS		GEATIGHVEK		FLRRKMGLDP
ACQVDIICGD		HLLEQYQTLR		EIRRAIGDAA		MQDGLLVLHY		GLVVSPLKIT

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Lee M.G., Norman J., Shilatifard A., Shiekhattar R. (2007). Physical and functional association of a trimethyl H3K4 demethylase and Ring6a/MBLR, a polycomb-like protein. Cell. 128: 877—887. PMID 17320162 DOI:10.1016/j.cell.2007.02.004
• Vandamme J., Volkel P., Rosnoblet C., Le Faou P., Angrand P.O. (2011). Interaction proteomics analysis of polycomb proteins defines distinct PRC1 Complexes in mammalian cells. Mol. Cell. Proteomics: —. PMID 21282530 DOI:10.1074/mcp.M110.002642

Див. також

• Хромосома 10