PDK2

PDK2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2BTZ, 2BU2, 2BU5, 2BU6, 2BU7, 2BU8, 4MP2, 4MP7, 4MPC, 4MPE, 4MPN, 4V25, 4V26
Ідентифікатори
Символи	PDK2, PDHK2, PDKII, pyruvate dehydrogenase kinase 2
Зовнішні ІД	OMIM: 602525 MGI: 1343087 HomoloGene: 68265 GeneCards: PDK2
Онтологія гена Молекулярна функція • transferase activity • nucleotide binding • protein kinase activity • protein homodimerization activity • kinase activity • ATP binding • pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring) kinase activity Клітинна компонента • нуклеоплазма • мітохондріальний матрикс • мітохондрія • mitochondrial pyruvate dehydrogenase complex • гіалоплазма Біологічний процес • фосфорилювання • GO:0072353 cellular response to reactive oxygen species • intrinsic apoptotic signaling pathway by p53 class mediator • glucose metabolic process • regulation of acetyl-CoA biosynthetic process from pyruvate • cellular response to nutrient • GO:1901047 insulin receptor signaling pathway • regulation of cellular ketone metabolic process • regulation of glucose metabolic process • glucose homeostasis • regulation of pH • protein phosphorylation • regulation of gluconeogenesis • carbohydrate metabolic process • regulation of calcium-mediated signaling Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	5164	18604
Ensembl	ENSG00000005882	ENSMUSG00000038967
UniProt	Q15119	Q9JK42
RefSeq (мРНК)	NM_002611 NM_001199898 NM_001199899 NM_001199900	NM_133667 NM_001361915
RefSeq (білок)	NP_001186827 NP_001186828 NP_001186829 NP_002602	NP_598428 NP_001348844
Локус (UCSC)	Хр. 17: 50.09 – 50.11 Mb	Хр. 11: 94.92 – 94.93 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PDK2 (англ. Pyruvate dehydrogenase kinase 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 407 амінокислот, а молекулярна маса — 46 154.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MRWVWALLKN		ASLAGAPKYI		EHFSKFSPSP		LSMKQFLDFG		SSNACEKTSF
TFLRQELPVR		LANIMKEINL		LPDRVLSTPS		VQLVQSWYVQ		SLLDIMEFLD
KDPEDHRTLS		QFTDALVTIR		NRHNDVVPTM		AQGVLEYKDT		YGDDPVSNQN
IQYFLDRFYL		SRISIRMLIN		QHTLIFDGST		NPAHPKHIGS		IDPNCNVSEV
VKDAYDMAKL		LCDKYYMASP		DLEIQEINAA		NSKQPIHMVY		VPSHLYHMLF
ELFKNAMRAT		VESHESSLIL		PPIKVMVALG		EEDLSIKMSD		RGGGVPLRKI
ERLFSYMYST		APTPQPGTGG		TPLAGFGYGL		PISRLYAKYF		QGDLQLFSME
GFGTDAVIYL		KALSTDSVER		LPVYNKSAWR		HYQTIQEAGD		WCVPSTEPKN
TSTYRVS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ. Задіяний у таких біологічних процесах, як вуглеводний обмін, обмін глюкози, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у мітохондрії.

Література

• Gudi R., Bowker-Kinley M.M., Kedishvili N.Y., Zhao Y., Popov K.M. (1995). Diversity of the pyruvate dehydrogenase kinase gene family in humans. J. Biol. Chem. 270: 28989—28994. PMID 7499431 DOI:10.1074/jbc.270.48.28989
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Majer M., Popov K.M., Harris R.A., Bogardus C., Prochazka M. (1998). Insulin downregulates pyruvate dehydrogenase kinase (PDK) mRNA: potential mechanism contributing to increased lipid oxidation in insulin-resistant subjects. Mol. Genet. Metab. 65: 181—186. PMID 9787110 DOI:10.1006/mgme.1998.2748
• Hiromasa Y., Roche T.E. (2003). Facilitated interaction between the pyruvate dehydrogenase kinase isoform 2 and the dihydrolipoyl acetyltransferase. J. Biol. Chem. 278: 33681—33693. PMID 12816949 DOI:10.1074/jbc.M212733200
• Bao H., Kasten S.A., Yan X., Roche T.E. (2004). Pyruvate dehydrogenase kinase isoform 2 activity limited and further inhibited by slowing down the rate of dissociation of ADP. Biochemistry. 43: 13432—13441. PMID 15491150 DOI:10.1021/bi049488x
• Hiromasa Y., Hu L., Roche T.E. (2006). Ligand-induced effects on pyruvate dehydrogenase kinase isoform 2. J. Biol. Chem. 281: 12568—12579. PMID 16517984 DOI:10.1074/jbc.M513514200

Див. також

• Хромосома 17