PHF19

PHF19
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2E5Q, 4BD3
Ідентифікатори
Символи	PHF19, MTF2L1, PCL3, TDRD19B, PHD finger protein 19
Зовнішні ІД	OMIM: 609740 MGI: 1921266 HomoloGene: 12524 GeneCards: PHF19
Онтологія гена Молекулярна функція • methylated histone binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • nucleosome binding • sequence-specific DNA binding Клітинна компонента • ESC/E(Z) complex • клітинне ядро • нуклеоплазма Біологічний процес • positive regulation of histone H3-K27 methylation • negative regulation of gene expression, epigenetic • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	26147	74016
Ensembl	ENSG00000119403	ENSMUSG00000026873
UniProt	Q5T6S3	Q9CXG9
RefSeq (мРНК)	NM_001009936 NM_001286840 NM_001286842 NM_001286843 NM_015651	NM_028716
RefSeq (білок)	NP_001009936 NP_001273769 NP_001273771 NP_001273772 NP_056466	NP_082992
Локус (UCSC)	Хр. 9: 120.86 – 120.89 Mb	Хр. 2: 34.89 – 34.91 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PHF19 (англ. PHD finger protein 19) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 9-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 580 амінокислот, а молекулярна маса — 65 591.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MENRALDPGT		RDSYGATSHL		PNKGALAKVK		NNFKDLMSKL		TEGQYVLCRW
TDGLYYLGKI		KRVSSSKQSC		LVTFEDNSKY		WVLWKDIQHA		GVPGEEPKCN
ICLGKTSGPL		NEILICGKCG		LGYHQQCHIP		IAGSADQPLL		TPWFCRRCIF
ALAVRKGGAL		KKGAIARTLQ		AVKMVLSYQP		EELEWDSPHR		TNQQQCYCYC
GGPGEWYLRM		LQCYRCRQWF		HEACTQCLNE		PMMFGDRFYL		FFCSVCNQGP
EYIERLPLRW		VDVVHLALYN		LGVQSKKKYF		DFEEILAFVN		HHWELLQLGK
LTSTPVTDRG		PHLLNALNSY		KSRFLCGKEI		KKKKCIFRLR		IRVPPNPPGK
LLPDKGLLPN		ENSASSELRK		RGKSKPGLLP		HEFQQQKRRV		YRRKRSKFLL
EDAIPSSDFT		SAWSTNHHLA		SIFDFTLDEI		QSLKSASSGQ		TFFSDVDSTD
AASTSGSAST		SLSYDSRWTV		GSRKRKLAAK		AYMPLRAKRW		AAELDGRCPS
DSSAEGASVP		ERPDEGIDSH		TFESISEDDS		SLSHLKSSIT		NYFGAAGRLA
CGEKYQVLAR		RVTPEGKVQY		LVEWEGTTPY

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Wang S., Robertson G.P., Zhu J. (2004). A novel human homologue of Drosophila polycomblike gene is up-regulated in multiple cancers. Gene. 343: 69—78. PMID 15563832 DOI:10.1016/j.gene.2004.09.006
• Boulay G., Rosnoblet C., Guerardel C., Angrand P.O., Leprince D. (2011). Functional characterization of human Polycomb-like 3 isoforms identifies them as components of distinct EZH2 protein complexes. Biochem. J. 434: 333—342. PMID 21143197 DOI:10.1042/BJ20100944
• Ghislin S., Deshayes F., Middendorp S., Boggetto N., Alcaide-Loridan C. (2012). PHF19 and Akt control the switch between proliferative and invasive states in melanoma. Cell Cycle. 11: 1634—1645. PMID 22487681 DOI:10.4161/cc.20095

Див. також

• Хромосома 9