PICALM

PICALM
Ідентифікатори
Символи	PICALM, CALM, CLTH, LAP, phosphatidylinositol binding clathrin assembly protein
Зовнішні ІД	OMIM: 603025 MGI: 2385902 HomoloGene: 111783 GeneCards: PICALM
Пов'язані генетичні захворювання
хвороба Альцгеймера
Онтологія гена Молекулярна функція • clathrin heavy chain binding • clathrin adaptor activity • clathrin binding • 1-phosphatidylinositol binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • phospholipid binding • cadherin binding • SNARE binding • amyloid-beta binding • phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate binding • tau protein binding • low-density lipoprotein particle receptor binding Клітинна компонента • clathrin coat of coated pit • комплекс Ґольджі • postsynaptic membrane • мембрана • neurofibrillary tangle • neuronal cell body • clathrin-coated pit • AP-2 adaptor complex • presynaptic membrane • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • клітинне ядро • clathrin-coated vesicle • внутрішньоклітинний • везикула • perinuclear region of cytoplasm • гіалоплазма • внутрішньоклітинна мембранна органела • early endosome • клітинна мембрана • cell surface • intrinsic component of membrane • clathrin-coated endocytic vesicle • endosome to plasma membrane transport vesicle • Синаптичні бульбашки • extrinsic component of presynaptic endocytic zone membrane Біологічний процес • regulation of endocytosis • ендоцитоз • iron ion homeostasis • receptor internalization • positive regulation of neuron death • regulation of aspartic-type endopeptidase activity involved in amyloid precursor protein catabolic process • negative regulation of gene expression • regulation of protein localization • negative regulation of receptor-mediated endocytosis • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • endosomal transport • clathrin coat assembly • проліферація • vesicle-mediated transport • аксоноґенеза • кровотворення • clathrin-dependent endocytosis • negative regulation of metalloendopeptidase activity involved in amyloid precursor protein catabolic process • synaptic vesicle maturation • positive regulation of aspartic-type endopeptidase activity involved in amyloid precursor protein catabolic process • vesicle cargo loading • рецептор-опосередкований ендоцитоз • dendrite morphogenesis • positive regulation of amyloid-beta formation • membrane organization • iron ion import across plasma membrane • vesicle budding from membrane • learning or memory • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity • GO:0034622 protein-containing complex assembly • regulation of vesicle size • membrane bending • amyloid-beta clearance by transcytosis • regulation of amyloid-beta formation • negative regulation of protein localization to plasma membrane • clathrin-coated pit assembly • negative regulation of protein localization to cell surface • synaptic vesicle budding from presynaptic endocytic zone membrane • synaptic vesicle endocytosis Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	8301	233489
Ensembl	ENSG00000073921	ENSMUSG00000039361
UniProt	Q13492	Q7M6Y3
RefSeq (мРНК)	NM_001008660 NM_001206946 NM_001206947 NM_007166	NM_001252520 NM_001252521 NM_001252522 NM_001252523 NM_001252524 NM_146194 NM_001360867
RefSeq (білок)	NP_001008660 NP_001193875 NP_001193876 NP_009097 NP_001008660.1	NP_001239449 NP_001239450 NP_001239451 NP_001239452 NP_001239453 NP_666306 NP_001347796
Локус (UCSC)	Хр. 11: 85.96 – 86.07 Mb	Хр. 7: 89.78 – 89.86 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PICALM (англ. Phosphatidylinositol binding clathrin assembly protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 652 амінокислот, а молекулярна маса — 70 755.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSGQSLTDRI		TAAQHSVTGS		AVSKTVCKAT		THEIMGPKKK		HLDYLIQCTN
EMNVNIPQLA		DSLFERTTNS		SWVVVFKSLI		TTHHLMVYGN		ERFIQYLASR
NTLFNLSNFL		DKSGLQGYDM		STFIRRYSRY		LNEKAVSYRQ		VAFDFTKVKR
GADGVMRTMN		TEKLLKTVPI		IQNQMDALLD		FNVNSNELTN		GVINAAFMLL
FKDAIRLFAA		YNEGIINLLE		KYFDMKKNQC		KEGLDIYKKF		LTRMTRISEF
LKVAEQVGID		RGDIPDLSQA		PSSLLDALEQ		HLASLEGKKI		KDSTAASRAT
TLSNAVSSLA		STGLSLTKVD		EREKQAALEE		EQARLKALKE		QRLKELAKKP
HTSLTTAASP		VSTSAGGIMT		APAIDIFSTP		SSSNSTSKLP		NDLLDLQQPT
FHPSVHPMST		ASQVASTWGD		PFSATVDAVD		DAIPSLNPFL		TKSSGDVHLS
ISSDVSTFTT		RTPTHEMFVG		FTPSPVAQPH		PSAGLNVDFE		SVFGNKSTNV
IVDSGGFDEL		GGLLKPTVAS		QNQNLPVAKL		PPSKLVSDDL		DSSLANLVGN
LGIGNGTTKN		DVNWSQPGEK		KLTGGSNWQP		KVAPTTAWNA		ATMAPPVMAY
PATTPTGMIG		YGIPPQMGSV		PVMTQPTLIY		SQPVMRPPNP		FGPVSGAQIQ
FM

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ендоцитоз, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі, мембрані, клатрин-вкритих заглибинах мембрани, цитоплазматичних везикулах, апараті гольджі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Tebar F., Bohlander S.K., Sorkin A. (1999). Clathrin assembly lymphoid myeloid leukemia (CALM) protein: localization in endocytic-coated pits, interactions with clathrin, and the impact of overexpression on clathrin-mediated traffic. Mol. Biol. Cell. 10: 2687—2702. PMID 10436022 DOI:10.1091/mbc.10.8.2687
• Archangelo L.F., Glaesner J., Krause A., Bohlander S.K. (2006). The novel CALM interactor CATS influences the subcellular localization of the leukemogenic fusion protein CALM/AF10. Oncogene. 25: 4099—4109. PMID 16491119 DOI:10.1038/sj.onc.1209438

Див. також

• Хромосома 11