POLR3C

POLR3C
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2XUB, 2XV4, 5AFQ
Ідентифікатори
Символи	POLR3C, RPC3, RPC62, polymerase (RNA) III subunit C, RNA polymerase III subunit C, C82
Зовнішні ІД	OMIM: 617454 MGI: 1921664 HomoloGene: 38185 GeneCards: POLR3C
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA polymerase III activity • single-stranded DNA binding Клітинна компонента • RNA polymerase III complex • гіалоплазма • нуклеоплазма • клітинне ядро Біологічний процес • positive regulation of interferon-beta production • regulation of transcription by RNA polymerase III • defense response to virus • transcription, DNA-templated • positive regulation of innate immune response • процес імунної системи • вроджений імунітет • transcription by RNA polymerase III • positive regulation of type I interferon production Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10623	74414
Ensembl	ENSG00000186141	ENSMUSG00000028099
UniProt	Q9BUI4	Q9D483
RefSeq (мРНК)	NM_001303456 NM_006468	NM_028925
RefSeq (білок)	NP_001290385 NP_006459	NP_083201
Локус (UCSC)	Хр. 1: 145.82 – 145.84 Mb	Хр. 3: 96.62 – 96.63 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

POLR3C (англ. RNA polymerase III subunit C) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 534 амінокислот, а молекулярна маса — 60 612.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MTQAEIKLCS		LLLQEHFGEI		VEKIGVHLIR		TGSQPLRVIA		HDTGTSLDQV
KKALCVLVQH		NLVSYQVHKR		GVVEYEAQCS		RVLRMLRYPR		YIYTTKTLYS
DTGELIVEEL		LLNGKLTMSA		VVKKVADRLT		ETMEDGKTMD		YAEVSNTFVR
LADTHFVQRC		PSVPTTENSD		PGPPPPAPTL		VINEKDMYLV		PKLSLIGKGK
RRRSSDEDAA		GEPKAKRPKY		TTDNKEPIPD		DGIYWQANLD		RFHQHFRDQA
IVSAVANRMD		QTSSEIVRTM		LRMSEITTSS		SAPFTQPLSS		NEIFRSLPVG
YNISKQVLDQ		YLTLLADDPL		EFVGKSGDSG		GGMYVINLHK		ALASLATATL
ESVVQERFGS		RCARIFRLVL		QKKHIEQKQV		EDFAMIPAKE		AKDMLYKMLS
ENFMSLQEIP		KTPDHAPSRT		FYLYTVNILS		AARMLLHRCY		KSIANLIERR
QFETKENKRL		LEKSQRVEAI		IASMQATGAE		EAQLQEIEEM		ITAPERQQLE
TLKRNVNKLD		ASEIQVDETI		FLLESYIECT		MKRQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як імунітет, вроджений імунітет, транскрипція, антивірусний захист, поліморфізм. Локалізований у ядрі.

Література

• Wang Z., Roeder R.G. (1997). Three human RNA polymerase III-specific subunits form a subcomplex with a selective function in specific transcription initiation. Genes Dev. 11: 1315—1326. PMID 9171375 DOI:10.1101/gad.11.10.1315
• Kuwana M., Kimura K., Kawakami Y. (2002). Identification of an immunodominant epitope on RNA polymerase III recognized by systemic sclerosis sera: application to enzyme-linked immunosorbent assay. Arthritis Rheum. 46: 2742—2747. PMID 12384934 DOI:10.1002/art.10521
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Hsieh Y.-J., Kundu T.K., Wang Z., Kovelman R., Roeder R.G. (1999). The TFIIIC90 subunit of TFIIIC interacts with multiple components of the RNA polymerase III machinery and contains a histone-specific acetyltransferase activity. Mol. Cell. Biol. 19: 7697—7704. PMID 10523658 DOI:10.1128/MCB.19.11.7697
• Chiu Y.-H., Macmillan J.B., Chen Z.J. (2009). RNA polymerase III detects cytosolic DNA and induces type I interferons through the RIG-I pathway. Cell. 138: 576—591. PMID 19631370 DOI:10.1016/j.cell.2009.06.015

Див. також

• Хромосома 1