PPARGC1B

PPARGC1B
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3SP6
Ідентифікатори
Символи	PPARGC1B, ERRL1, PERC, PGC-1(beta), PGC1B, PPARG coactivator 1 beta
Зовнішні ІД	OMIM: 608886 MGI: 2444934 HomoloGene: 15776 GeneCards: PPARGC1B
Пов'язані генетичні захворювання
ожиріння
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001104 transcription coregulator activity • AF-2 domain binding • nuclear receptor coactivator activity • RNA binding • nucleic acid binding • transcription factor binding • estrogen receptor binding Клітинна компонента • mediator complex • мітохондрія • клітинне ядро • Нуклеоплазма Біологічний процес • mitochondrial transcription • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • Осифікація • actin filament organization • positive regulation of osteoclast differentiation • positive regulation of DNA-binding transcription factor activity • response to glucocorticoid • bone trabecula formation • positive regulation of bone resorption • transcription, DNA-templated • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • GO:0072353 cellular response to reactive oxygen species • positive regulation of alkaline phosphatase activity • response to cAMP • positive regulation of phosphorylation • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • intracellular estrogen receptor signaling pathway • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • positive regulation of cold-induced thermogenesis • regulation of nucleic acid-templated transcription Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	133522	170826
Ensembl	ENSG00000155846	ENSMUSG00000033871
UniProt	Q86YN6	Q8VHJ7
RefSeq (мРНК)	NM_001172698 NM_001172699 NM_133263	NM_133249 NM_001364996
RefSeq (білок)	NP_001166169 NP_001166170 NP_573570	NP_573512 NP_001351925
Локус (UCSC)	Хр. 5: 149.73 – 149.86 Mb	Хр. 18: 61.43 – 61.53 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PPARGC1B (англ. PPARG coactivator 1 beta) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 023 амінокислот, а молекулярна маса — 113 222.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAGNDCGALL		DEELSSFFLN		YLADTQGGGS		GEEQLYADFP		ELDLSQLDAS
DFDSATCFGE		LQWCPENSET		EPNQYSPDDS		ELFQIDSENE		ALLAELTKTL
DDIPEDDVGL		AAFPALDGGD		ALSCTSASPA		PSSAPPSPAP		EKPSAPAPEV
DELSLLQKLL		LATSYPTSSS		DTQKEGTAWR		QAGLRSKSQR		PCVKADSTQD
KKAPMMQSQS		RSCTELHKHL		TSAQCCLQDR		GLQPPCLQSP		RLPAKEDKEP
GEDCPSPQPA		PASPRDSLAL		GRADPGAPVS		QEDMQAMVQL		IRYMHTYCLP
QRKLPPQTPE		PLPKACSNPS		QQVRSRPWSR		HHSKASWAEF		SILRELLAQD
VLCDVSKPYR		LATPVYASLT		PRSRPRPPKD		SQASPGRPSS		VEEVRIAASP
KSTGPRPSLR		PLRLEVKREV		RRPARLQQQE		EEDEEEEEEE		EEEEKEEEEE
WGRKRPGRGL		PWTKLGRKLE		SSVCPVRRSR		RLNPELGPWL		TFADEPLVPS
EPQGALPSLC		LAPKAYDVER		ELGSPTDEDS		GQDQQLLRGP		QIPALESPCE
SGCGDMDEDP		SCPQLPPRDS		PRCLMLALSQ		SDPTFGKKSF		EQTLTVELCG
TAGLTPPTTP		PYKPTEEDPF		KPDIKHSLGK		EIALSLPSPE		GLSLKATPGA
AHKLPKKHPE		RSELLSHLRH		ATAQPASQAG		QKRPFSCSFG		DHDYCQVLRP
EGVLQRKVLR		SWEPSGVHLE		DWPQQGAPWA		EAQAPGREED		RSCDAGAPPK
DSTLLRDHEI		RASLTKHFGL		LETALEEEDL		ASCKSPEYDT		VFEDSSSSSG
ESSFLPEEEE		EEGEEEEEDD		EEEDSGVSPT		CSDHCPYQSP		PSKANRQLCS
RSRSSSGSSP		CHSWSPATRR		NFRCESRGPC		SDRTPSIRHA		RKRREKAIGE
GRVVYIQNLS		SDMSSRELKR		RFEVFGEIEE		CEVLTRNRRG		EKYGFITYRC
SEHAALSLTK		GAALRKRNEP		SFQLSYGGLR		HFCWPRYTDY		DSNSEEALPA
SGKSKYEAMD		FDSLLKEAQQ		SLH

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Kressler D., Schreiber S.N., Knutti D., Kralli A. (2002). The PGC-1-related protein PERC is a selective coactivator of estrogen receptor alpha. J. Biol. Chem. 277: 13918—13925. PMID 11854298 DOI:10.1074/jbc.M201134200
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Cho Y., Hazen B.C., Russell A.P., Kralli A. (2013). Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1 (PGC-1)- and estrogen-related receptor (ERR)-induced regulator in muscle 1 (Perm1) is a tissue-specific regulator of oxidative capacity in skeletal muscle cells. J. Biol. Chem. 288: 25207—25218. PMID 23836911 DOI:10.1074/jbc.M113.489674

Див. також

• Хромосома 5