PPHLN1

PPHLN1
Ідентифікатори
Символи	PPHLN1, HSPC232, HSPC206, CR, periphilin 1
Зовнішні ІД	OMIM: 608150 MGI: 1917029 HomoloGene: 9533 GeneCards: PPHLN1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding Клітинна компонента • комплекс Ґольджі • клітинне ядро • нуклеоплазма • хромосома • цитоплазма • гіалоплазма Біологічний процес • keratinization • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • negative regulation of gene expression, epigenetic • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of DNA methylation-dependent heterochromatin assembly • protein localization to heterochromatin Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	51535	223828
Ensembl	ENSG00000134283	ENSMUSG00000036167
UniProt	Q8NEY8	Q8K2H1
RefSeq (мРНК)	NM_001143787 NM_001143788 NM_001143789 NM_016488 NM_201438 NM_201439 NM_201440 NM_201515 NM_001364822 NM_001364823 NM_001364824 NM_001364825 NM_001364826 NM_001364827 NM_001364828 NM_001364829 NM_001364830 NM_001364831 NM_001364832 NM_001364833 NM_001364834	NM_001083114 NM_001285863 NM_001285864 NM_146062 NM_175363 NM_001358748 NM_001358749 NM_001358750
RefSeq (білок)	NP_001137259 NP_001137260 NP_001137261 NP_057572 NP_958846 NP_958847 NP_958848 NP_958923 NP_001351751 NP_001351752 NP_001351753 NP_001351754 NP_001351755 NP_001351756 NP_001351757 NP_001351758 NP_001351759 NP_001351760 NP_001351761 NP_001351762 NP_001351763	NP_001076583 NP_001272792 NP_001272793 NP_666174 NP_780572 NP_001345677 NP_001345678 NP_001345679
Локус (UCSC)	Хр. 12: 42.24 – 42.46 Mb	Хр. 15: 93.3 – 93.39 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PPHLN1 (англ. Periphilin 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 458 амінокислот, а молекулярна маса — 52 737.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MWSEGRYEYE		RIPRERAPPR		SHPSDGYNRL		VNIVPKKPPL		LDRPGEGSYN
RYYSHVDYRD		YDEGRSFSHD		RRSGPPHRGD		ESGYRWTRDD		HSASRQPEYR
DMRDGFRRKS		FYSSHYARER		SPYKRDNTFF		RESPVGRKDS		PHSRSGSSVS
SRSYSPERSK		SYSFHQSQHR		KSVRPGASYK		RQNEGNPERD		KERPVQSLKT
SRDTSPSSGS		AVSSSKVLDK		PSRLTEKELA		EAASKWAAEK		LEKSDESNLP
EISEYEAGST		APLFTDQPEE		PESNTTHGIE		LFEDSQLTTR		SKAIASKTKE
IEQVYRQDCE		TFGMVVKMLI		EKDPSLEKSI		QFALRQNLHE		IESAGQTWQQ
VPPVRNTEMD		HDGTPENEGE		ETAQSAPQPP		QAPQPLQPRK		KRVRRTTQLR
RTTGAPDITW		GMLKKTTQEA		ERILLRTQTP		FTPENLFLAM		LSVVHCNSRK
DVKPENKQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, кератинізація, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, хромосомах.

Література

• Kazerounian S., Aho S. (2003). Characterization of periphilin, a widespread, highly insoluble nuclear protein and potential constituent of the keratinocyte cornified envelope. J. Biol. Chem. 278: 36707—36717. PMID 12853457 DOI:10.1074/jbc.M303896200
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
• Kurita M., Suzuki H., Kawano Y., Aiso S., Matsuoka M. (2007). CR/periphilin is a transcriptional co-repressor involved in cell cycle progression. Biochem. Biophys. Res. Commun. 364: 930—936. PMID 17963697 DOI:10.1016/j.bbrc.2007.10.090

Див. також

• Хромосома 12