PPP1R13L

PPP1R13L
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2VGE
Ідентифікатори
Символи	PPP1R13L, IASPP, NKIP1, RAI, RAI4, protein phosphatase 1 regulatory subunit 13 like
Зовнішні ІД	OMIM: 607463 MGI: 3525053 HomoloGene: 84635 GeneCards: PPP1R13L
Онтологія гена Молекулярна функція • transcription factor binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001106 transcription corepressor activity • identical protein binding • cadherin binding Клітинна компонента • Міжклітинні контакти • клітинне ядро • intercellular bridge • Нуклеоплазма • цитоплазма • гіалоплазма Біологічний процес • embryonic camera-type eye development • hair cycle • ventricular cardiac muscle tissue development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • cardiac right ventricle morphogenesis • post-embryonic development • multicellular organismal homeostasis • cardiac muscle contraction • positive regulation of cell differentiation • transcription, DNA-templated • multicellular organism growth • GO:0097285 апоптоз • regulation of signal transduction by p53 class mediator Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10848	333654
Ensembl	ENSG00000104881	ENSMUSG00000040734
UniProt	Q8WUF5	Q5I1X5
RefSeq (мРНК)	NM_006663 NM_001142502	NM_001010836
RefSeq (білок)	NP_001135974 NP_006654	NP_001010836
Локус (UCSC)	Хр. 19: 45.38 – 45.41 Mb	Хр. 7: 19.09 – 19.11 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PPP1R13L (англ. Protein phosphatase 1 regulatory subunit 13 like) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 828 амінокислот, а молекулярна маса — 89 091.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDSEAFQSAR		DFLDMNFQSL		AMKHMDLKQM		ELDTAAAKVD		ELTKQLESLW
SDSPAPPGPQ		AGPPSRPPRY		SSSSIPEPFG		SRGSPRKAAT		DGADTPFGRS
ESAPTLHPYS		PLSPKGRPSS		PRTPLYLQPD		AYGSLDRATS		PRPRAFDGAG
SSLGRAPSPR		PGPGPLRQQG		PPTPFDFLGR		AGSPRGSPLA		EGPQAFFPER
GPSPRPPATA		YDAPASAFGS		SLLGSGGSAF		APPLRAQDDL		TLRRRPPKAW
NESDLDVAYE		KKPSQTASYE		RLDVFARPAS		PSLQLLPWRE		SSLDGLGGTG
KDNLTSATLP		RNYKVSPLAS		DRRSDAGSYR		RSLGSAGPSG		TLPRSWQPVS
RIPMPPSSPQ		PRGAPRQRPI		PLSMIFKLQN		AFWEHGASRA		MLPGSPLFTR
APPPKLQPQP		QPQPQPQSQP		QPQLPPQPQT		QPQTPTPAPQ		HPQQTWPPVN
EGPPKPPTEL		EPEPEIEGLL		TPVLEAGDVD		EGPVARPLSP		TRLQPALPPE
AQSVPELEEV		ARVLAEIPRP		LKRRGSMEQA		PAVALPPTHK		KQYQQIISRL
FHRHGGPGPG		GPEPELSPIT		EGSEARAGPP		APAPPAPIPP		PAPSQSSPPE
QPQSMEMRSV		LRKAGSPRKA		RRARLNPLVL		LLDAALTGEL		EVVQQAVKEM
NDPSQPNEEG		ITALHNAICG		ANYSIVDFLI		TAGANVNSPD		SHGWTPLHCA
ASCNDTVICM		ALVQHGAAIF		ATTLSDGATA		FEKCDPYREG		YADCATYLAD
VEQSMGLMNS		GAVYALWDYS		AEFGDELSFR		EGESVTVLRR		DGPEETDWWW
AALHGQEGYV		PRNYFGLFPR		VKPQRSKV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як апоптоз, транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Yang J.-P., Hori M., Sanda T., Okamoto T. (1999). Identification of a novel inhibitor of nuclear factor-kappaB, RelA-associated inhibitor. J. Biol. Chem. 274: 15662—15670. PMID 10336463 DOI:10.1074/jbc.274.22.15662
• Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
• Robinson R.A., Lu X., Jones E.Y., Siebold C. (2008). Biochemical and structural studies of ASPP proteins reveal differential binding to p53, p63, and p73. Structure. 16: 259—268. PMID 18275817 DOI:10.1016/j.str.2007.11.012

Див. також

• Хромосома 19