PRAG1

PRAG1
Ідентифікатори
Символи	PRAG1, PRAGMIN, SGK223, homolog of rat pragma of Rnd2, PEAK1 related kinase activating pseudokinase 1, NACK, PEAK2, PEAK1 related, kinase-activating pseudokinase 1
Зовнішні ІД	OMIM: 617344 MGI: 1196223 HomoloGene: 18256 GeneCards: PRAG1
Онтологія гена Молекулярна функція • transferase activity • protein kinase activity • nucleotide binding • protein tyrosine kinase activity • non-membrane spanning protein tyrosine kinase activity • ATP binding • kinase activity • identical protein binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • цитоплазма • focal adhesion • клітинне ядро • міжклітинні контакти Біологічний процес • peptidyl-tyrosine phosphorylation • protein phosphorylation • фосфорилювання • regulation of cell shape • regulation of Notch signaling pathway • negative regulation of neuron projection development • cell migration • positive regulation of Rho protein signal transduction • regulation of cell motility Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	157285	244418
Ensembl	ENSG00000275342	ENSMUSG00000050271
UniProt	Q86YV5	Q571I4
RefSeq (мРНК)	NM_001080826 NM_001369759	NM_172911
RefSeq (білок)	NP_001074295 NP_001356688	NP_766499
Локус (UCSC)	Хр. 8: 8.32 – 8.39 Mb	Хр. 8: 36.56 – 36.61 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PRAG1 (англ. PEAK1 related, kinase-activating pseudokinase 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 8-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 406 амінокислот, а молекулярна маса — 149 624.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MHQTLCLNPE		SLKMSACSDF		VEHIWKPGSC		KNCFCLRSDH		QLVAGPPQPR
AGSLPPPPRL		PPRPENCRLE		DEGVNSSPYS		KPTIAVKPTM		MSSEASDVWT
EANLSAEVSQ		VIWRRAPGKL		PLPKQEDAPV		VYLGSFRGVQ		KPAGPSTSPD
GNSRCPPAYT		MVGLHNLEPR		GERNIAFHPV		SFPEEKAVHK		EKPSFPYQDR
PSTQESFRQK		LAAFAGTTSG		CHQGPGPLRE		SLPSEDDSDQ		RCSPSGDSEG
GEYCSILDCC		PGSPVAKAAS		QTAGSRGRHG		GRDCSPTCWE		QGKCSGPAEQ
EKRGPSFPKE		CCSQGPTAHP		SCLGPKKLSL		TSEAAISSDG		LSCGSGSGSG
SGASSPFVPH		LESDYCSLMK		EPAPEKQQDP		GCPGVTPSRC		LGLTGEPQPP
AHPREATQPE		PIYAESTKRK		KAAPVPSKSQ		AKIEHAAAAQ		GQGQVCTGNA
WAQKAASGWG		RDSPDPTPQV		SATITVMAAH		PEEDHRTIYL		SSPDSAVGVQ
WPRGPVSQNS		EVGEEETSAG		QGLSSRESHA		HSASESKPKE		RPAIPPKLSK
SSPVGSPVSP		SAGGPPVSPL		ADLSDGSSGG		SSIGPQPPSQ		GPADPAPSCR
TNGVAISDPS		RCPQPAASSA		SEQRRPRFQA		GTWSRQCRIE		EEEEVEQELL
SHSWGRETKN		GPTDHSNSTT		WHRLHPTDGS		SGQNSKVGTG		MSKSASFAFE
FPKDRSGIET		FSPPPPPPKS		RHLLKMNKSS		SDLEKVSQGS		AESLSPSFRG
VHVSFTTGST		DSLASDSRTC		SDGGPSSELA		HSPTNSGKKL		FAPVPFPSGS
TEDVSPSGPQ		QPPPLPQKKI		VSRAASSPDG		FFWTQGSPKP		GTASPKLNLS
HSETNVHDES		HFSYSLSPGN		RHHPVFSSSD		PLEKAFKGSG		HWLPAAGLAG
NRGGCGSPGL		QCKGAPSASS		SQLSVSSQAS		TGSTQLQLHG		LLSNISSKEG
TYAKLGGLYT		QSLARLVAKC		EDLFMGGQKK		ELHFNENNWS		LFKLTCNKPC
CDSGDAIYYC		ATCSEDPGST		YAVKICKAPE		PKTVSYCSPS		VPVHFNIQQD
CGHFVASVPS		SMLSSPDAPK		DPVPALPTHP		PAQEQDCVVV		ITREVPHQTA
SDFVRDSAAS		HQAEPEAYER		RVCFLLLQLC		NGLEHLKEHG		IIHRDLCLEN
LLLVHCTLQA		GPGPAPAPAP		APAPAAAAPP		CSSAAPPAGG		TLSPAAGPAS
PEGPREKQLP		RLIISNFLKA		KQKPGGTPNL		QQKKSQARLA		PEIVSASQYR
KFDEFQTGIL		IYELLHQPNP		FEVRAQLRER		DYRQEDLPPL		PALSLYSPGL
QQLAHLLLEA		DPIKRIRIGE		AKRVLQCLLW		GPRRELVQQP		GTSEEALCGT
LHNWIDMKRA		LMMMKFAEKA		VDRRRGVELE		DWLCCQYLAS		AEPGALLQSL
KLLQLL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, тирозинових протеїнкіназ, фосфопротеїнів. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами.

Література

• Manning G., Whyte D.B., Martinez R., Hunter T., Sudarsanam S. (2002). The protein kinase complement of the human genome. Science. 298: 1912—1934. PMID 12471243 DOI:10.1126/science.1075762

Див. також

• Хромосома 8