PRDM10

PRDM10
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3IHX
Ідентифікатори
Символи	PRDM10, PFM7, PR domain 10, PR/SET domain 10
Зовнішні ІД	OMIM: 618319 MGI: 2682952 HomoloGene: 45718 GeneCards: PRDM10
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0102674, GO:0102675 methyltransferase activity • transferase activity • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • nucleic acid binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • RNA polymerase II core promoter sequence-specific DNA binding Клітинна компонента • клітинне ядро • histone methyltransferase complex Біологічний процес • Метилювання • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • регуляція експресії генів Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	56980	382066
Ensembl	ENSG00000170325	ENSMUSG00000042496
UniProt	Q9NQV6	Q3UTQ7
RefSeq (мРНК)	NM_020228 NM_199437 NM_199438 NM_199439	NM_001080817 NM_199315 NM_001368845 NM_001368846
RefSeq (білок)	NP_064613 NP_955469 NP_955470 NP_955471 NP_001354819 NP_001354820 NP_001354821 NP_001354822 NP_001354823 NP_001354824 NP_001354825 NP_001354826 NP_001354827 NP_001354828	NP_001355774 NP_001355775 NP_955019
Локус (UCSC)	Хр. 11: 129.9 – 130 Mb	Хр. 9: 31.19 – 31.29 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PRDM10 (англ. PR/SET domain 10) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 11-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 147 амінокислот, а молекулярна маса — 130 136.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDSKDESSHV		WPTSAEHEQN		AAQVHFVPDT		GTVAQIVYTD		DQVRPPQQVV
YTADGASYTS		VDGPEHTLVY		IHPVEAAQTL		FTDPGQVAYV		QQDATAQQAS
LPVHNQVLPS		IESVDGSDPL		ATLQTPLGRL		EAKEEEDEDE		DEDTEEDEEE
DGEDTDLDDW		EPDPPRPFDP		HDLWCEECNN		AHASVCPKHG		PLHPIPNRPV
LTRARASLPL		VLYIDRFLGG		VFSKRRIPKR		TQFGPVEGPL		VRGSELKDCY
IHLKVSLDKG		DRKERDLHED		LWFELSDETL		CNWMMFVRPA		QNHLEQNLVA
YQYGHHVYYT		TIKNVEPKQE		LKVWYAASYA		EFVNQKIHDI		SEEERKVLRE
QEKNWPCYEC		NRRFISSEQL		QQHLNSHDEK		LDVFSRTRGR		GRGRGKRRFG
PGRRPGRPPK		FIRLEITSEN		GEKSDDGTQD		LLHFPTKEQF		DEAEPATLNG
LDQPEQTTIP		IPQLPQETQS		SLEHEPETHT		LHLQPQHEES		VVPTQSTLTA
DDMRRAKRIR		LELQNAALQH		LFIRKSFRPF		KCLQCGKAFR		EKDKLDQHLR
FHGREGNCPL		TCDLCNKGFI		SSTSLESHMK		LHSDQKTYSC		IFCPESFDRL
DLLKDHVAIH		INDGYFTCPT		CKKRFPDFIQ		VKKHVRSFHS		EKIYQCTECD
KAFCRPDKLR		LHMLRHSDRK		DFLCSTCGKQ		FKRKDKLREH		MQRMHNPERE
AKKADRISRS		KTFKPRITST		DYDSFTFKCR		LCMMGFRRRG		MLVNHLSKRH
PDMKIEEVPE		LTLPIIKPNR		DYFCQYCDKV		YKSASKRKAH		ILKNHPGAEL
PPSIRKLRPA		GPGEPDPMLS		THTQLTGTIA		TPPVCCPHCS		KQYSSKTKMV
QHIRKKHPEF		AQLSNTIHTP		LTTAVISATP		AVLTTDSATG		ETVVTTDLLT
QAMTELSQTL		TTDYRTPQGD		YQRIQYIPVS		QSASGLQQPQ		HIQLQVVQVA
SATSPHQSQQ		STVDVGQLHD		PQPYPQHAIQ		VQHIQVSGQP		LSPSAQQAQQ
GLSPSHIQGS		SSTQGQALQQ		QQQQQQNSSV		QHTYLPSAWN		SFRGYSSEIQ
MMTLPPGQFV		ITDSGVATPV		TTGQVKAVTS		GHYVLSESQS		ELEEKQTSAL
SGGVQVEPPA		HSDSLDPQTN		SQQQTTQYII		TTTTNGNGSS		EVHITKP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, метилтрансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК, S-аденозил-L-метіоніном. Локалізований у ядрі.

Література

• Siegel D.A., Huang M.K., Becker S.F. (2002). Ectopic dendrite initiation: CNS pathogenesis as a model of CNS development. Int. J. Dev. Neurosci. 20: 373—389. PMID 12175877 DOI:10.1016/S0736-5748(02)00055-2
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Jiang G.L., Huang S. (2000). The yin-yang of PR-domain family genes in tumorigenesis. Histol. Histopathol. 15: 109—117. PMID 10668202

Див. також

• Хромосома 11