PROP1

PROP1
Ідентифікатори
Символи	PROP1, CPHD2, PROP-1, PROP paired-like homeobox 1
Зовнішні ІД	OMIM: 601538 MGI: 109330 HomoloGene: 4558 GeneCards: PROP1
Пов'язані генетичні захворювання
Pickardt syndrome, гіпопітуїтаризм
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • DNA binding • sequence-specific DNA binding • beta-catenin binding • chromatin binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • protein C-terminus binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • transcription regulator complex • клітинне ядро Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • somatotropin secreting cell differentiation • hypothalamus cell differentiation • hypophysis morphogenesis • negative regulation of apoptotic process • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • adenohypophysis development • central nervous system development • blood vessel development • animal organ morphogenesis • canonical Wnt signaling pathway • dorsal/ventral pattern formation • cell migration • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • gland development Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	5626	19127
Ensembl	ENSG00000280635 ENSG00000175325 ENSG00000274382	ENSMUSG00000044542
UniProt	O75360	P97458
RefSeq (мРНК)	NM_006261	NM_008936
RefSeq (білок)	NP_006252	NP_032962
Локус (UCSC)	Хр. 5: 177.99 – 178 Mb	Хр. 11: 50.84 – 50.84 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PROP1 (англ. PROP paired-like homeobox 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 226 амінокислот, а молекулярна маса — 24 984.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEAERRRQAE		KPKKGRVGSN		LLPERHPATG		TPTTTVDSSA		PPCRRLPGAG
GGRSRFSPQG		GQRGRPHSRR		RHRTTFSPVQ		LEQLESAFGR		NQYPDIWARE
SLARDTGLSE		ARIQVWFQNR		RAKQRKQERS		LLQPLAHLSP		AAFSSFLPES
TACPYSYAAP		PPPVTCFPHP		YSHALPSQPS		TGGAFALSHQ		SEDWYPTLHP
APAGHLPCPP		PPPMLPLSLE		PSKSWN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 5