PRPF18

PRPF18
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2DK4
Ідентифікатори
Символи	PRPF18, PRP18, hPrp18, pre-mRNA processing factor 18
Зовнішні ІД	OMIM: 604993 MGI: 1914479 HomoloGene: 2726 GeneCards: PRPF18
Онтологія гена Молекулярна функція • second spliceosomal transesterification activity Клітинна компонента • U5 snRNP • nuclear speck • U4/U6 x U5 tri-snRNP complex • U2-type post-spliceosomal complex • spliceosomal complex • клітинне ядро Біологічний процес • generation of catalytic spliceosome for second transesterification step • mRNA processing • Сплайсинг РНК Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	8559	67229
Ensembl	ENSG00000165630	ENSMUSG00000039449
UniProt	Q99633	Q8BM39
RefSeq (мРНК)	NM_003675	NM_026045 NM_001356451
RefSeq (білок)	NP_003666	NP_080321 NP_001343380
Локус (UCSC)	Хр. 10: 13.59 – 13.63 Mb	Хр. 2: 4.63 – 4.66 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PRPF18 (англ. Pre-mRNA processing factor 18) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 10-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 342 амінокислот, а молекулярна маса — 39 860.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDILKSEILR		KRQLVEDRNL		LVENKKYFKR		SELAKKEEEA		YFERCGYKIQ
PKEEDQKPLT		SSNPVLELEL		AEEKLPMTLS		RQEVIRRLRE		RGEPIRLFGE
TDYDAFQRLR		KIEILTPEVN		KGLRNDLKAA		LDKIDQQYLN		EIVGGQEPGE
EDTQNDLKVH		EENTTIEELE		ALGESLGKGD		DHKDMDIITK		FLKFLLGVWA
KELNAREDYV		KRSVQGKLNS		ATQKQTESYL		RPLFRKLRKR		NLPADIKESI
TDIIKFMLQR		EYVKANDAYL		QMAIGNAPWP		IGVTMVGIHA		RTGREKIFSK
HVAHVLNDET		QRKYIQGLKR		LMTICQKHFP		TDPSKCVEYN		AL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

• Horowitz D.S., Krainer A.R. (1997). A human protein required for the second step of pre-mRNA splicing is functionally related to a yeast splicing factor. Genes Dev. 11: 139—151. PMID 9000057 DOI:10.1101/gad.11.1.139
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Horowitz D.S., Lee E.J., Mabon S.A., Misteli T. (2002). A cyclophilin functions in pre-mRNA splicing. EMBO J. 21: 470—480. PMID 11823439 DOI:10.1093/emboj/21.3.470

Див. також

• Хромосома 10