PRPF38A

PRPF38A
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4RZA, 4RZ9
Ідентифікатори
Символи	PRPF38A, Prp38, pre-mRNA processing factor 38A, PRP38A
Зовнішні ІД	OMIM: 617031 MGI: 1916962 HomoloGene: 13146 GeneCards: PRPF38A
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding Клітинна компонента • ядерна мембрана • spliceosomal complex • precatalytic spliceosome • клітинне ядро • нуклеоплазма • U2-type precatalytic spliceosome Біологічний процес • mRNA processing • Сплайсинг РНК • mRNA splicing, via spliceosome Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	84950	230596
Ensembl	ENSG00000134748	ENSMUSG00000063800
UniProt	Q8NAV1	Q4FK66
RefSeq (мРНК)	NM_032284 NM_032864	NM_172697
RefSeq (білок)	NP_116253	NP_766285
Локус (UCSC)	Хр. 1: 52.4 – 52.42 Mb	Хр. 4: 108.42 – 108.44 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PRPF38A (англ. Pre-mRNA processing factor 38A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 1-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 312 амінокислот, а молекулярна маса — 37 477.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MANRTVKDAH		SIHGTNPQYL		VEKIIRTRIY		ESKYWKEECF		GLTAELVVDK
AMELRFVGGV		YGGNIKPTPF		LCLTLKMLQI		QPEKDIIVEF		IKNEDFKYVR
MLGALYMRLT		GTAIDCYKYL		EPLYNDYRKI		KSQNRNGEFE		LMHVDEFIDE
LLHSERVCDI		ILPRLQKRYV		LEEAEQLEPR		VSALEEDMDD		VESSEEEEEE
DEKLERVPSP		DHRRRSYRDL		DKPRRSPTLR		YRRSRSRSPR		RRSRSPKRRS
PSPRRERHRS		KSPRRHRSRS		RDRRHRSRSK		SPGHHRSHRH		RSHSKSPERS
KKSHKKSRRG		NE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 1