PRPF39

PRPF39
Ідентифікатори
Символи	PRPF39, pre-mRNA processing factor 39
Зовнішні ІД	OMIM: 614907 MGI: 104602 HomoloGene: 32377 GeneCards: PRPF39
Онтологія гена Молекулярна функція • pre-mRNA 5'-splice site binding Клітинна компонента • U1 snRNP • commitment complex • U2-type prespliceosome • клітинне ядро Біологічний процес • mRNA 5'-splice site recognition • mRNA processing • GO:0033168, GO:0036404, GO:1902360 RNA processing • Сплайсинг РНК Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	55015	328110
Ensembl	ENSG00000185246	ENSMUSG00000035597
UniProt	Q86UA1	Q8K2Z2
RefSeq (мРНК)	NM_018333 NM_017922	NM_177806 NM_001374212 NM_001374213
RefSeq (білок)	NP_060392	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 14: 45.08 – 45.12 Mb	Хр. 12: 65.08 – 65.11 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PRPF39 (англ. Pre-mRNA processing factor 39) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 14-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 669 амінокислот, а молекулярна маса — 78 430.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MQNSHMDEYR		NSSNGSTGNS		SEVVVEHPTD		FSTEIMNVTE		MEQSPDDSPN
VNASTEETEM		ASAVDLPVTL		TETEANFPPE		YEKFWKTVEN		NPQDFTGWVY
LLQYVEQENH		LMAARKAFDR		FFIHYPYCYG		YWKKYADLEK		RHDNIKPSDE
VYRRGLQAIP		LSVDLWIHYI		NFLKETLDPG		DPETNNTIRG		TFEHAVLAAG
TDFRSDRLWE		MYINWENEQG		NLREVTAIYD		RILGIPTQLY		SHHFQRFKEH
VQNNLPRDLL		TGEQFIQLRR		ELASVNGHSG		DDGPPGDDLP		SGIEDITDPA
KLITEIENMR		HRIIEIHQEM		FNYNEHEVSK		RWTFEEGIKR		PYFHVKPLEK
AQLKNWKEYL		EFEIENGTHE		RVVVLFERCV		ISCALYEEFW		IKYAKYMENH
SIEGVRHVFS		RACTIHLPKK		PMVHMLWAAF		EEQQGNINEA		RNILKTFEEC
VLGLAMVRLR		RVSLERRHGN		LEEAEHLLQD		AIKNAKSNNE		SSFYAVKLAR
HLFKIQKNLP		KSRKVLLEAI		ERDKENTKLY		LNLLEMEYSG		DLKQNEENIL
NCFDKAVHGS		LPIKMRITFS		QRKVEFLEDF		GSDVNKLLNA		YDEHQTLLKE
QDSLKRKAEN		GSEEPEEKKA		HTEDTTSSST		QMIDGDLQAN		QAVYNYSAWY
QYNYQNPWNY		GQYYPPPPT

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 14